动物模型建立与分组处理
在体评估不同剂量TFA对雄性SD大鼠的影响
18只雄性SD大鼠(180±20g)适应1周后随机分为3组(n=6):ND(正常饮食)、LTD(TFA占总能量1%)、HTD(TFA占总能量4%),进行12周饮食干预。
Trans-Fatty Acids (TFA) Induced Vascular Injury Through the Regulation of the Sirt1-Ppargc1a-Nfe2l2 Signaling Pathway in Male Rats.
包含动物模型(SD大鼠3组饮食干预)、形态学与超微结构观察(HE、Weigert、电镜)、功能检测(ROS、血脂)、分子机制验证(Western blot、网络药理学、分子对接),证据层级涉及体内、病理和分子层面。
雄性Sprague-Dawley (SD) 大鼠模型 大鼠主动脉血管组织
TFA剂量:低剂量组(LTD)为总能量的1%,高剂量组(HTD)为总能量的4% 大鼠品系和性别:雄性Sprague-Dawley (SD) 大鼠,体重180±20g 干预时间:12周饮食干预 蛋白检测靶点:Sirt1、Ppargc1a、Nfe2l2、Bcl2、Bax、Casp3、Cleaved Casp3 分子对接验证:TFA与Sirt1结合能低于-5 kcal/mol
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体评估不同剂量TFA对雄性SD大鼠的影响
18只雄性SD大鼠(180±20g)适应1周后随机分为3组(n=6):ND(正常饮食)、LTD(TFA占总能量1%)、HTD(TFA占总能量4%),进行12周饮食干预。
监测TFA对体重、食物摄入和血压的生理影响
每周测量体重和食物摄入量,每6周记录收缩压和舒张压。
评估TFA对血管组织形态和线粒体结构的影响
采集主动脉组织,进行HE染色(炎症浸润)、Weigert染色(弹性纤维)和透射电镜(线粒体形态)观察。
检测TFA对血脂水平的影响
采集血清,使用全自动生化分析仪测定TC、TG、HDL-C和LDL-C水平。
评估TFA对血管氧化应激水平的影响
新鲜腹主动脉组织切片与DCFH-DA探针孵育,通过荧光显微镜定量ROS水平。
预测TFA诱导血管损伤的潜在靶点和通路
使用CTD和BATMAN-TCM预测TFA靶点,GeneCards获取血管损伤靶点,取交集142个靶点,进行KEGG富集、PPI网络构建及hub蛋白筛选(Cytoscape,CytoHubba)。
验证TFA与Sirt1的结合能力
获取Sirt1结构(AlphaFold)、TFA结构(PubChem),在线平台进行分子对接,计算结合能,并用PyMOL可视化。
验证凋亡相关蛋白和Sirt1/Ppargc1a/Nfe2l2通路蛋白的表达变化
提取血管组织蛋白,SDS-PAGE电泳,转膜,抗体孵育,ECL显色,ImageJ定量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 膳食配制 | 氢化棕榈油 | -- | -- |
| 实验饲料制备 | 北京诺康源生物技术有限公司饲料 | Beijing Nuokang Source Biotechnology Co. Ltd. | -- |
| 蛋白质定量 | Lowry法 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | 抗兔Bcl2抗体 | Signalway Antibody | -- |
| 抗兔Bax抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗兔Ppargc1a抗体 | Affinity | -- | |
| 抗兔Casp3抗体 | GeneTex | -- | |
| 抗兔Cleaved Casp3抗体 | Arigo Biolaboratories | -- | |
| 抗兔Nfe2l2抗体 | Medical & Biological Laboratories | -- | |
| 抗兔Sirt1抗体 | OriGene | -- | |
| 抗兔β-肌动蛋白抗体 | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔IgG-辣根过氧化物酶二抗 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 荧光染色 | 2',7'-二氯荧光黄双乙酸盐 | -- | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| 增强化学发光检测系统 | -- | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 统计分析 | SPSS软件 | -- | -- |
| GraphPad Prism软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 物种与品系:雄性Sprague-Dawley (SD) 大鼠;体重:180±20g;来源:北京维通利华实验动物技术有限公司 阅读提示:Materials and Methods – Animal Treatment |
| TFA剂量与分组 | 低剂量(LTD)为总能量的1%,高剂量(HTD)为总能量的4%;对照组为无TFA正常饮食;每组n=6 阅读提示:Materials and Methods – Animal Treatment |
| 饮食组成 | TFA来源:氢化棕榈油(含46% TFA);饲料由北京诺康源生物技术有限公司制备 阅读提示:Materials and Methods – Materials and Reagents,Table 1 |
| 组织病理学 | 固定:4%多聚甲醛24h(4°C);切片厚度4μm 阅读提示:Materials and Methods – Histological Analysis |
| ROS检测 | 探针浓度10 mmol/L DCFH-DA;孵育37°C 30分钟,避光 阅读提示:Materials and Methods – Measurement of ROS Generation in Vascular |
| 电镜观察 | 腹主动脉长度约2mm;固定于4%戊二醛 阅读提示:Materials and Methods – Electron Microscope Observations |
| 血脂检测 | 使用全自动生化分析仪,具体型号文中未明确说明 阅读提示:Materials and Methods – Serum Biochemical Tests |
| 网络药理学 | 数据库版本和筛选阈值:CTD、BATMAN-TCM、GeneCards(前10%);KEGG富集p<0.05;拓扑算法Betweenness和Stress 阅读提示:Materials and Methods – Network Pharmacology Prediction,Results |
| 分子对接 | TFA结构:PubChem CID;Sirt1结构:AlphaFold;结合能阈值< -5 kcal/mol 阅读提示:Materials and Methods – Docking Analysis |
| Western blot | 抗体来源和稀释度(文中未明确说明稀释度);内参β-actin;ImageJ定量 阅读提示:Materials and Methods – Western Blotting |