建立SICM小鼠模型并评估ATO的心脏保护作用
验证ATO对脓毒症诱导的心肌损伤是否有保护作用
C57BL/6J小鼠经ATO(10、20、40 mg/kg)连续灌胃预处理6天后,通过CLP手术建立SICM模型,术后24小时用超声心动图评估心功能,H&E染色观察心脏病理,ELISA检测血清心肌损伤标志物。
Atorvastatin Alleviates Sepsis-Induced Cardiomyopathy by Targeting the METTL3/IGF2BP1/CXCL2 Pathway.
包含CLP小鼠模型、LPS诱导的心肌细胞模型、m6A-MeRIP-seq、RIP、Western blot、ELISA、CETSA和DARTS等体外和体内实验,并进行功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠CLP诱导的脓毒症心肌病模型 HL-1心肌细胞LPS刺激模型
ATO预处理剂量(10、20、40 mg/kg)及给药方式(灌胃6天) CLP手术操作细节(盲肠结扎75%,21号针头穿刺) LPS刺激浓度(0、1、2、5、10 μg/mL)及ATO预处理时间(24 h) METTL3、IGF2BP1、CXCL2的敲低/过表达验证 RNA稳定性实验的放线菌素D浓度(5 μg/mL)和处理时间(0、6、12 h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ATO对脓毒症诱导的心肌损伤是否有保护作用
C57BL/6J小鼠经ATO(10、20、40 mg/kg)连续灌胃预处理6天后,通过CLP手术建立SICM模型,术后24小时用超声心动图评估心功能,H&E染色观察心脏病理,ELISA检测血清心肌损伤标志物。
探究ATO对脓毒症小鼠心肌炎症和m6A水平的影响
ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β水平;免疫组化检测心脏TLR4表达;Western blot检测COX2、IL-6、METTL3蛋白表达;ELISA检测心脏组织整体m6A修饰水平。
证实ATO是否直接靶向METTL3
通过AutoDock Vina进行分子对接预测ATO与METTL3的结合亲和力;通过CETSA和DARTS实验验证ATO与METTL3的直接结合。
验证METTL3在ATO保护心肌细胞中的作用
在HL-1细胞中敲低或过表达METTL3,结合LPS刺激和ATO预处理,检测CK-MB、LDH、TNF-α、IL-1β等心肌损伤和炎症指标。
鉴定METTL3调控的m6A修饰下游靶基因
在HL-1细胞中敲低METTL3后进行m6A-MeRIP-seq,分析差异m6A修饰基因,KEGG富集显示IL-17信号通路相关,聚焦CXCL2。
阐明METTL3和IGF2BP1如何调控CXCL2表达
RIP-qRT-PCR验证METTL3敲低后CXCL2 mRNA的m6A修饰水平;检测m6A readers表达,发现IGF2BP1上调;敲低IGF2BP1或METTL3检测CXCL2 mRNA和蛋白水平;RNA稳定性实验检测CXCL2 mRNA半衰期。
验证CXCL2在METTL3介导的心肌损伤中的作用
在HL-1细胞中共转染OV-METTL3和Si-CXCL2,检测CK-MB、LDH、TNF-α、IL-1β水平以及铁死亡指标(Fe2+、MDA、GSH、SLC7A11、GPX4)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 阿托伐他汀 | China Food and Drug Administration | 10059 |
| 脂多糖 | Puxitang Biotechnology | O55:B5 | |
| Western blot | 抗COX2抗体 | Proteintech | 27308-1-AP |
| 抗METTL3抗体 | Proteintech | 15073-1-AP | |
| 抗CXCL2抗体 | Proteintech | 26791-1-AP | |
| 抗TLR4抗体 | Proteintech | 19811-1-AP | |
| 抗IL-17抗体 | Proteintech | 66148-1-Ig | |
| 抗IL-6抗体 | Abcam | ab290735 | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Abcam | ab307601 | |
| 抗GAPDH抗体 | Signalway | 40493–1 | |
| ELISA检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience Biotechnology | EMC102a.96 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience Biotechnology | EMC004.96 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience Biotechnology | EMC001b.96 | |
| CK-MB检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| LDH检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| cTnI检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| AST检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| MDA检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| GSH检测试剂盒 | JianCheng | -- | |
| Fe2+检测试剂盒 | Solarbio | -- | |
| m6A定量 | m6A RNA甲基化定量试剂盒 | EpiQuik | P-9005-96 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | -- |
| qRT-PCR | SweScript全合一逆转录SuperMix | ServiceBio | -- |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Ncnbio | WB3100 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Ncmbio | WB6501 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Ncmbio | P10060 | |
| 超声心动图 | 超高分辨率小动物超声成像系统 | Fujifilm Visualsonics | VEVO |
| Vevo LAB 5.7.1软件 | Visualsonics | -- | |
| 免疫组化 | 显微镜(Olympus BX53) | Olympus | BX53 |
| CaseViewer 2.4.0软件 | 3DHISTech | -- | |
| 分子对接 | AutoDock Vina | -- | -- |
| PyMOL | -- | -- | |
| Chem3D软件 | -- | -- | |
| m6A-MeRIP-seq | Dynabeads™磁珠 | Thermo Fisher | -- |
| 抗m6A抗体 | Synaptic Systems | 1:500 | |
| Agilent扫描仪G2505C | Agilent Technologies | G2505C | |
| 测序 | Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、年龄;ATO给药剂量、途径(灌胃)、预处理时间(6天);CLP手术细节(结扎程度、穿刺针规格);术后观察时间(24小时);超声心动图检测参数 阅读提示:Methods: Animal Studies, Echocardiography |
| 细胞培养与处理 | HL-1细胞培养条件;LPS浓度和刺激时间;ATO预处理浓度和时间;siRNA和过表达质粒转染条件;检测时间点 阅读提示:Methods: The Culture and Cell Transfection of HL-1 Cardiomyocytes, Cell Viability |
| 炎症因子检测 | 血清和细胞上清中TNF-α、IL-6、IL-1β的检测方法(ELISA)及对应试剂盒;心肌损伤标志物(CK-MB、LDH、cTnI、AST)检测 阅读提示:Methods: ELISA Assays |
| m6A水平检测 | 心脏组织和细胞中m6A整体水平检测方法(ELISA)及试剂盒;METTL3蛋白表达检测 阅读提示:Methods: Quantification of m6A RNA Modification Level, Western Blot |
| ATO与METTL3结合验证 | 分子对接条件(蛋白结构、药物结构、网格参数);CETSA温度梯度和ATO浓度;DARTS pronase浓度梯度 阅读提示:Methods: Molecular Docking Study, CETSA, DARTS |
| METTL3/IGF2BP1/CXCL2机制 | m6A-MeRIP-seq实验步骤;RIP-qRT-PCR条件;RNA稳定性分析中Act D浓度和时间;m6A位点预测软件SRAMP 阅读提示:Methods: M6A-MeRIP-Seq, RNA Immunoprecipitation, RNA Stability Analysis |
| 铁死亡指标检测 | Fe2+、MDA、GSH检测试剂盒及方法;铁死亡相关蛋白SLC7A11和GPX4的表达检测 阅读提示:Results, Figure 7 |