验证SIRT7对NRF2表达和核转位的影响
确定SIRT7是否调节NRF2的蛋白水平和亚细胞定位。
在Huh7细胞中敲低或过表达SIRT7,通过Western blot、亚细胞分级、免疫荧光检测NRF2蛋白水平和核定位,并通过RT-qPCR检测NRF2靶基因表达。
SIRT7-mediated NRF2 deacetylation promotes antioxidant response and protects against chemodrug-induced liver injury.
包含体外细胞实验(Huh7、HEK293T、原代小鼠肝细胞)、体内动物模型(SIRT7HKO小鼠)以及机制验证(Co-IP、泛素化、位点突变等),多个独立证据层级。
Huh7人肝癌细胞系 HEK293T人胚肾细胞系 原代小鼠肝细胞(PMH) 肝细胞特异性SIRT7敲除小鼠(SIRT7HKO)
细胞系:Huh7、HEK293T、原代小鼠肝细胞,需验证STR和支原体污染。 动物模型:SIRT7HKO小鼠(Alb-Cre),C57BL/6背景,4-6周龄,雄性。 药物处理:Oxaliplatin(奥沙利铂)4 mg/kg腹腔注射每日一次共12天;Oltipraz 100 mg/kg口服5天。 对照:5%葡萄糖溶液作为Oxaliplatin对照;溶剂(DMSO+PEG300+生理盐水)作为Oltipraz对照。 关键试剂:MG132(50 μM)处理4小时,CHX(100 μg/ml)处理以检测蛋白半衰期。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SIRT7是否调节NRF2的蛋白水平和亚细胞定位。
在Huh7细胞中敲低或过表达SIRT7,通过Western blot、亚细胞分级、免疫荧光检测NRF2蛋白水平和核定位,并通过RT-qPCR检测NRF2靶基因表达。
检验SIRT7是否影响氧化应激诱导的ROS积累和细胞凋亡。
从SIRT7HKO小鼠和WT小鼠分离原代肝细胞,使用Oxaliplatin、H2O2、APAP处理,通过DCFH-DA、DHE、MitoSOX Red检测ROS水平,TUNEL染色检测细胞死亡。
确定SIRT7是否直接与NRF2结合并使其去乙酰化。
通过Co-IP检测内源和外源SIRT7与NRF2的相互作用,并在SIRT7敲低细胞中检测NRF2乙酰化水平,使用SIRT7酶活突变体(HY)评估去乙酰化对NRF2表达和靶基因的影响。
阐明SIRT7是否通过调节NRF2/KEAP1相互作用影响NRF2的泛素化和稳定性。
检测SIRT7过表达或敲低对NRF2半衰期、泛素化水平以及与KEAP1结合的影响,并使用MG132处理。
确定SIRT7在NRF2上的具体去乙酰化位点及其功能意义。
通过序列比对和位点预测,构建NRF2点突变(K443R、K518R、2KR、2KQ),检测乙酰化水平、泛素化、KEAP1结合、靶基因表达、亚细胞定位和ROS水平。
评估SIRT7缺失是否加重奥沙利铂诱导的肝损伤和炎症。
利用SIRT7HKO小鼠和WT对照,给予Oxaliplatin处理,检测血清ALT、TG、炎症因子,组织学分析(H&E、IHC)和NRF2通路蛋白表达。
确认NRF2是SIRT7保护作用的下游效应分子。
在SIRT7HKO小鼠中通过AAV8-NRF2过表达或Oltipraz处理,检测肝损伤指标、炎症和组织学改变。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Basal Media | -- | |
| 药物处理 | 奥沙利铂 | Targetmol | -- |
| 奥替普拉 | MedChemExpress | -- | |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | -- | |
| 动物实验 | AAV8-TBG NRF2载体 | Hanbio | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| 二氢乙锭 | APExBio | C3807 | |
| MitoSOX Red探针 | MedChemExpress | HY-D1055 | |
| 生化检测 | ALT测定试剂盒 | Nanjing JianCheng Bioengineering Institute | -- |
| 甘油三酯水平测定试剂盒 | Beijing Boxbio Science & Technology | -- | |
| RNA提取与qPCR | Trizol试剂 | Vazyme Biotech | -- |
| RNA逆转录试剂盒 | Vazyme Biotech | -- | |
| qPCR | qPCR SuperMix预混液 | TransGen Biotech | -- |
| 免疫组织化学 | DAB显色液 | Zhong Shan-Golden Bridge Biological Technology | -- |
| 蔡司Axiolab 5数字实验室显微镜 | Carl Zeiss AG | -- | |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | Biolinkedin基础免疫共沉淀试剂盒 | Biolinkedin | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 6000转染试剂 | Beyotime | -- |
| 突变构建 | Q5定点突变试剂盒 | New England biolabs | -- |
| TUNEL检测 | TUNEL染色试剂盒 | Vazyme Biotech | -- |
| 抗体 | 抗F4/80抗体 | Cell Signaling Technology | 70076 |
| 抗SIRT7抗体 | Cell Signaling Technology | 5360 | |
| 抗SIRT3抗体 | Cell Signaling Technology | 5490 | |
| 抗SIRT4抗体 | Cell Signaling Technology | 69786 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗Bcl2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071 | |
| 抗cleaved-caspase3抗体 | Proteintech | 82707-13-RR | |
| 抗NRF2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| 抗KEAP1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Signalway Antibody | 41549 | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | Bioworld Technology | BS74032 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(icell,需身份验证)、培养条件(DMEM+10%FBS+抗生素,5%CO2,37°C) 阅读提示:Materials and methods: Animals and cell culture |
| 药物处理 | Oxaliplatin浓度和时间(15 μM,24h);H2O2浓度和时间(400 μM,3h);APAP浓度和时间(20 μM,24h) 阅读提示:Figure legends: Fig. 2D |
| 质粒转染 | 转染试剂Lipofectamine 6000,血清-free条件,DNA量(文中未明确说明) 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 蛋白质印迹 | 一抗稀释比例(如anti-NRF2 1:5000,anti-KEAP1 1:4000),二抗1:3000 阅读提示:Materials and methods: Western blotting analysis |
| 免疫共沉淀 | 总蛋白量400 μg,使用Biolinkedin Basic Co-IP kit 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP) and Ubiquitination assay |