耐药细胞模型构建与验证
建立并验证卡铂耐药EOC细胞模型,以研究耐药机制
通过逐步递增卡铂浓度(0.1-2.0 μg/mL)处理SK-OV-3和TOV-21G细胞5个月,建立耐药株,并通过IC50测定和形态观察验证耐药性。
Down-regulation of PSMD4 can attenuate autophagy, enhance the accumulation of intracellular ROS, and increase the sensitivity of epithelial ovarian cancer to carboplatin by inhibiting the NF-κB pathway.
包含细胞模型、耐药株构建、转录组测序、生物信息学分析、体外功能验证、机制研究及体内异种移植瘤实验,证据层级独立且功能验证明确。
人EOC细胞系SK-OV-3 人EOC细胞系TOV-21G 卡铂耐药细胞系SK-OV-3/carboplatin 卡铂耐药细胞系TOV-21G/carboplatin EOC皮下异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠)
细胞系:SK-OV-3和TOV-21G及其对应卡铂耐药株 PSMD4敲低:使用shPSMD4载体转染 卡铂处理剂量:耐药株建立时0.1-2.0 μg/mL,细胞活力检测时不同浓度,体内给药剂量3 mg/kg 体内模型:雌性BALB/c裸鼠,皮下注射2×10^4 cells/μL细胞与Matrigel 1:1混合悬液 统计方法:Student's t检验和单因素方差分析,P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立并验证卡铂耐药EOC细胞模型,以研究耐药机制
通过逐步递增卡铂浓度(0.1-2.0 μg/mL)处理SK-OV-3和TOV-21G细胞5个月,建立耐药株,并通过IC50测定和形态观察验证耐药性。
筛选EOC卡铂耐药相关的核心基因
对SK-OV-3/carboplatin和亲本细胞进行二代测序,结合GO、KEGG、PPI网络和GEO芯片分析,筛选出PSMD4作为核心基因。
验证PSMD4在耐药细胞和组织中的表达变化
通过qRT-PCR和Western blot检测PSMD4在敏感和耐药细胞中的mRNA和蛋白表达。
检测PSMD4表达对EOC细胞卡铂敏感性的影响
通过转染shPSMD4或OV-PSMD4调控PSMD4表达,使用MTS检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡,Hoechst染色观察核碎裂,Western blot检测自噬和凋亡相关蛋白。
探究PSMD4调控EOC卡铂敏感性的分子机制
通过测序和KEGG富集分析显示差异基因富集于NF-κB通路,随后用NF-κB抑制剂(BAY 11-7082)处理,检测细胞活力、ROS、凋亡和自噬变化;并检测PSMD4敲低后NF-κB p65和IκBα的表达及核质分布。
验证PSMD4下调对EOC裸鼠移植瘤卡铂敏感性的影响
将PSMD4敲低和对照耐药细胞皮下接种至BALB/c裸鼠,成瘤后给予卡铂腹腔注射,监测肿瘤体积变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Neofect DNA转染试剂 | Neofect Biotech Co., Ltd. | -- |
| shPSMD4敲低质粒 | Genechem | -- | |
| PSMD4过表达质粒 | Gemma Pharmaceutical Technology Co., Ltd. | -- | |
| 细胞活力测定 | MTS试剂 | Shanghai Yihui Biological Technology Co., Ltd. | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | -- | -- |
| 自噬检测 | Hoechst 33342染料 | -- | -- |
| ROS检测 | 2,7-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Beijing Biolab Technology Co., Ltd. | -- |
| 药物处理 | Mito Tempo | -- | -- |
| BAY 11-7082 | -- | -- | |
| Western blot | PSMD4抗体 | GenWay Biotech Inc. | GWB-F0AEDC |
| LC3抗体 | MBL International | PD014 | |
| Beclin-1抗体 | US Biological | B0981-23T | |
| P62抗体 | PeproTech | 500-P62-50 | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 8202 | |
| Bcl-2抗体 | LSBio (LifeSpan) | LS-C438-1000 | |
| Bax抗体 | GenWay Biotech Inc. | 18-661-15197-0.1 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3034 | |
| IκBα抗体 | ABclonal | A19714 | |
| Lamin B抗体 | LSBio (LifeSpan) | LS-B2005-50 | |
| β-actin抗体 | Miltenyi Biotec | 130-120-277 | |
| 免疫组织化学 | PSMD4抗体 | Enzo Life Sciences | PAB0242 |
| 生物素化山羊抗兔二抗 | Signalway | L3012 | |
| 动物实验 | 基质胶 | -- | -- |
| 透射电镜 | 日立HT7700透射电子显微镜 | HITACHI | -- |
| 数据统计 | GraphPad Prism 7.0软件 | GraphPadSoftware | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系(SK-OV-3、TOV-21G等)来源及培养条件,转染试剂和质粒(shPSMD4、OV-PSMD4)及浓度 阅读提示:Methods:Cell culture and transfection |
| 耐药细胞建立 | 卡铂浓度递增范围、处理时间、停药后稳定性验证方法 阅读提示:Methods:Establishment of carboplatin-resistant cell lines |
| 体外功能实验 | 卡铂浓度和处理时间、MTS检测细胞密度和孵育时间、凋亡检测染色体积和孵育时间、自噬相关蛋白检测抗体稀释比例 阅读提示:Methods:MTS assay, Flow cytometry, Hoechst staining, Western blot |
| 机制研究 | BAY 11-7082浓度和剂量(文中未明确说明)、Mito Tempo浓度、ROS检测DCFH-DA浓度 阅读提示:Results:Inhibition of the NF-κB pathway...;Figure 7 |
| 体内实验 | 小鼠品系、性别、周龄、体重、分组方法、细胞接种密度和基质胶比例、卡铂给药剂量和频率 阅读提示:Methods:In vivo tumor xenograft |