ATM抑制对糖酵解和氧化磷酸化的影响
评估ATM抑制是否影响糖酵解酶和线粒体复合物的表达。
用KU55933处理H1975和H1993细胞48小时,Western blot分析HKII、p-PKM2等。
ATM inhibition blocks glucose metabolism and amplifies the sensitivity of resistant lung cancer cell lines to oncogene driver inhibitors.
包含细胞系药物处理、siRNA干扰、Western blot、代谢物检测和细胞活力测定等功能验证,但缺乏体内实验和患者样本验证。
H1975细胞系(EGFR L858R/T790M突变) H1993细胞系(MET扩增)
细胞系H1975和H1993需经验证其EGFR/MET状态及ATM表达。 ATM抑制剂KU55933的浓度(10 nM和100 nM),驱动抑制剂WZ4002和克唑替尼的浓度(0.5 µM和1 µM)。。 处理时间均为48小时。 转染条件:siRNA浓度100 nM,转染试剂DharmaFECT,转染后24小时加抑制剂,再培养48小时。 MTS细胞活力实验:H1975接种密度5000/孔,处理48小时,OD读数在450 nm。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ATM抑制是否影响糖酵解酶和线粒体复合物的表达。
用KU55933处理H1975和H1993细胞48小时,Western blot分析HKII、p-PKM2等。
探究ATM抑制对葡萄糖消耗及代谢中间体(丙酮酸、柠檬酸、琥珀酸)的影响。
KU55933处理细胞,检测培养基中葡萄糖残余量和细胞内代谢物。
验证ATM基因敲低是否模拟药物抑制效应。
siRNA转染沉默ATM,加驱动抑制剂处理,Western blot分析。
测试ATM抑制剂联合驱动抑制剂是否能增强细胞毒性。
H1975用KU55933和WZ4002,H1993用KU55933和crizotinib处理,检测蛋白表达。
定量评估联合治疗对细胞活力的影响。
MTS法检测处理后的细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco, Thermo Fisher | A1049101 |
| RPMI培养基 | Gibco, Thermo Fisher | 21875091 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | KU55933 | Sigma-Aldrich | -- |
| WZ4002 | Selleck Chemicals | -- | |
| 克唑替尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| 细胞活力检测 | MTS实验 | Sigma-Aldrich | -- |
| siRNA转染 | DharmaFECT转染试剂 | Dharmacon | -- |
| Western blot | 抗肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A4700 |
| 抗磷酸化ATM抗体 | Abcam | ab81292 | |
| 抗ATM抗体 | Abcam | ab199726 | |
| 抗BIM抗体 | BD Biosciences | 559685 | |
| 抗细胞周期蛋白D1抗体 | Cell Signaling Technology | 2922 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174S | |
| 抗G6PDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-373886 | |
| 抗HKII抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 | |
| 抗核纤层蛋白A/C抗体 | Cell Signaling Technology | 2032 | |
| 抗LDH-A抗体 | Cell Signaling Technology | 3582 | |
| 抗磷酸化p53Ser15抗体 | Cell Signaling Technology | 9284S | |
| 抗p53抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-126 | |
| 抗磷酸化PDHSer293抗体 | Abcam | ab92696 | |
| 抗PDH抗体 | Cell Signaling Technology | 3205 | |
| 抗PARP抗体 | BD Pharmingen | 556494 | |
| 抗磷酸化PKM2Tyr105抗体 | Cell Signaling Technology | 3827 | |
| 抗磷酸化PKM2Ser37抗体 | Signalway Antibody | 11456 | |
| 抗PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053 | |
| 抗纽蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4650 | |
| 抗OXPHOS抗体混合物 | Abcam | ab110411 | |
| ECL试剂盒 | Advansta | -- | |
| 代谢物检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 柠檬酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 琥珀酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 能量代谢检测 | Seahorse XFp分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| 实时ATP速率检测试剂盒 | Agilent technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(培养基、血清浓度、CO2、温度) 阅读提示:查看Materials and methods - Cell lines and treatment |
| 药物处理 | 药物浓度(KU55933、WZ4002、crizotinib)、处理时间 阅读提示:查看Materials and methods - Cell lines and treatment及图例 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度、处理时间、MTS检测波长、重复次数 阅读提示:查看Materials and methods - Cell lines and treatment |
| siRNA转染 | siRNA序列、浓度、转染试剂、转染后处理时间 阅读提示:查看Materials and methods - siRNA interference |
| 代谢物检测 | 细胞接种密度、处理浓度、检测方法 阅读提示:查看Materials and methods - Glucose consumption, pyruvate, citrate, and succinate levels |