建立ALI细胞模型及PCSK6表达分析
确定LPS刺激是否影响PCSK6表达,并建立ALI体外模型。
用LPS处理人BEAS-2B细胞,在不同时间点检测PCSK6 mRNA和蛋白水平。
Bone Mesenchymal Stem Cell-Derived Small Extracellular Vesicles Ameliorated Lipopolysaccharide-Induced Lung Injury Via the miR-21-5p/PCSK6 Pathway.
包含细胞实验(BEAS-2B细胞模型)、sEVs分离表征、功能验证(增殖、通透性、炎症因子)和机制验证(双荧光素酶报告基因),但缺乏动物体内实验验证。
人支气管上皮细胞系BEAS-2B 人骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其来源的小细胞外囊泡(BMSC-sEVs)
LPS刺激时间点:0、12、24、48小时 BMSC-sEVs处理剂量:50、100、200 μg/mL GW4869和miR-21-5p抑制剂处理BMSCs BEAS-2B细胞与BMSCs共培养体系(Transwell, 0.4 μm孔径)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LPS刺激是否影响PCSK6表达,并建立ALI体外模型。
用LPS处理人BEAS-2B细胞,在不同时间点检测PCSK6 mRNA和蛋白水平。
探究PCSK6对LPS诱导的细胞损伤(增殖、通透性、炎症)的影响。
通过shRNA敲低和过表达PCSK6,检测细胞增殖、通透性和炎症因子分泌。
验证BMSC-sEVs的分离效果,并确认BEAS-2B细胞能否内化它们。
从BMSCs培养上清中分离sEVs,通过NTA和TEM表征,并用Western blot检测CD63和CD81,用PKH67标记后与BEAS-2B细胞共培养观察摄取。
评估BMSC-sEVs对LPS诱导的细胞损伤的改善作用,并验证是否通过PCSK6介导。
用不同剂量BMSC-sEVs处理LPS刺激的BEAS-2B细胞,检测PCSK6表达、细胞增殖、通透性和炎症因子;并过表达PCSK6以验证其必要性。
确认miR-21-5p是否直接靶向PCSK6,并验证其在BMSC-sEVs中的关键作用。
通过miR-21-5p mimic/inhibitor处理BEAS-2B细胞,检测PCSK6表达;双荧光素酶报告基因验证直接结合;通过共培养和GW4869/miR-21-5p inhibitor处理BMSCs,检测下游效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Trueline | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | -- | |
| 流式分析 | CD34 FITC抗体 | BD Biosciences | 555821 |
| CD45 FITC抗体 | BD Biosciences | 555482 | |
| CD90 FITC抗体 | BD Biosciences | 561969 | |
| CD105 FITC抗体 | BD Biosciences | 561443 | |
| 共培养 | Transwell通透性支持物 | Corning | -- |
| sEVs分离 | GW4869 | Sigma | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 30%蔗糖/D2O | -- | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| 0.22 μm孔径滤膜 | Millipore | -- | |
| sEVs表征 | 透射电子显微镜(FEI Tecnai 12) | Philips | -- |
| 磷钨酸溶液 | -- | -- | |
| ZetaView纳米颗粒分析仪 | -- | ZetaView | |
| sEVs摄取 | PKH67染料 | Sigma | -- |
| DAPI染料 | Sigma | -- | |
| PCSK6表达操作 | 短发夹RNA | -- | -- |
| 慢病毒质粒(pLKO.1) | -- | -- | |
| pLVX-puro慢病毒质粒 | -- | -- | |
| 细胞增殖 | 细胞计数试剂盒-8 | Signalway Antibody | -- |
| 通透性检测 | FITC标记的葡聚糖 | -- | -- |
| Millicell ERS-2电阻仪 | Millipore | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL3-Basic载体 | -- | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白质提取和定量 | 蛋白质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| 抗小鼠IgG二抗 | Beyotime | -- | |
| 增强化学发光系统 | Tanon | -- | |
| PCSK6抗体 | Abcam | Ab151562 | |
| CD63抗体 | Proteintech | 25682-1-AP | |
| CD81抗体 | Proteintech | 66866-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | BEAS-2B细胞传代数(第三代),BMSCs来源,培养基成分(DMEM+10%sEV-depleted FBS+2mM L-glutamine+1%青霉素/链霉素),培养条件(5% CO2, 37°C) 阅读提示:Material and Methods 2.1 |
| 共培养 | Transwell孔径(0.4 μm),上室BMSCs,下室BEAS-2B,GW4869浓度(10 μM)及处理时间(共培养前8小时),miR-21-5p inhibitor/mimic处理时间(48小时) 阅读提示:Material and Methods 2.2 |
| sEVs分离和表征 | 超速离心步骤(1000g, 2000g, 10000g各20min,100000g 1hr),30% sucrose/D2O垫层,过滤(0.22 μm),sEVs浓度(200 μg/mL) 阅读提示:Material and Methods 2.3 |
| LPS处理 | LPS浓度(未明确说明),处理时间(0, 12, 24, 48小时) 阅读提示:Results 3.1, 图1图注 |
| 功能检测 | CCK-8检测时间点(0, 12, 24, 48小时),FITC-dextran浓度(1 mg/mL)及检测时间(24小时),TEER测量方法 阅读提示:Material and Methods 2.6, 2.7 |
| 机制验证 | 双荧光素酶报告基因实验中的WT和Mut PCSK6 3'-UTR序列,mimic/inhibitor处理浓度和时间(48小时),共培养体系中的GW4869和miR-21-5p inhibitor处理条件 阅读提示:Material and Methods 2.8, Results 3.3 |