circHIPK3通过作为支架招募泛素连接酶降解HuR来预防心肌衰老

circHIPK3 prevents cardiac senescence by acting as a scaffold to recruit ubiquitin ligase to degrade HuR.

作者信息Fengzhi Ding, Lin Lu, Chengjie Wu, Xiangbin Pan, Bin Liu, Yu Zhang, Yanli Wang, Weiliang Wu, Bing Yan, Yuqing Zhang, Xi-Yong Yu, Yangxin Li
PMID36438474
发布时间2022-10-31
DOI10.7150/thno.77630

实验完整度

包含体外细胞实验(H9C2、原代心肌细胞)、体内动物模型(基因敲除小鼠)及机制验证(RIP、RNA-pulldown、Co-IP),并评估心脏功能及端粒长度等多层级证据。

主要模型

H9C2心肌细胞系 原代心肌细胞(新生小鼠) 心肌细胞特异性circHIPK3诱导敲除(CKO)小鼠 C2C12成肌细胞系

重点核对

他莫昔芬诱导剂量:100 μg/g体重,腹腔注射 circHIPK3 siRNA及过表达质粒转染时间:40小时 外泌体处理浓度及时间:体外24小时,体内100 μg尾静脉注射每周三次 MG132处理浓度:10 μM,处理6小时 对照设置:使用空白载体或阴性对照siRNA

摘要

背景:衰老是导致心血管疾病发生的主要老化过程,但其潜在分子机制在很大程度上仍未知。原因之一是缺乏合适的动物模型。我们旨在生成心肌细胞特异性的衰老动物模型,揭示潜在机制,并开发针对衰老相关心功能障碍的新疗法。方法:采用circHIPK3的获得/缺失功能方法来探讨circHIPK3在心肌细胞衰老中的作用。为了研究circHIPK3在心脏衰老中的机制,我们生成了心肌细胞特异性、他莫昔芬诱导的circHIPK3敲除(CKO)小鼠。我们还应用了多种分析,包括PCR、Western blot、核质蛋白提取、免疫荧光、超声心动图、RNA免疫沉淀分析、RNA pull-down分析和共免疫沉淀。结果:我们的新型CKO小鼠表现出更差的心脏功能、circHIPK3表达降低和心脏端粒长度缩短。与对照小鼠相比,CKO小鼠心脏中衰老诱导因子p21的水平显著升高,存活率较差。在体外,circHIPK3过表达使心肌细胞中p21的水平显著降低,而circHIPK3沉默使其升高。我们发现circHIPK3是p21 mRNA结合蛋白HuR和E3泛素连接酶β-TrCP的支架。circHIPK3沉默减弱了HuR与β-TrCP之间的相互作用,减少了HuR泛素化,并增强了HuR与p21 mRNA之间的相互作用。此外,我们发现注射人脐带间充质干细胞来源的外泌体(UMSC-Exos)的小鼠表现出circHIPK3水平升高,p21水平降低,端粒长度延长,心脏功能良好。然而,UMSC-Exos的这些有益作用被circHIPK3沉默所抑制。结论:我们成功生成了用于衰老研究的心肌细胞特异性CKO小鼠。我们的结果表明,circHIPK3的缺失导致心肌细胞衰老加剧和心脏功能下降。作为支架,circHIPK3在细胞质中增强了E3泛素连接酶β-TrCP与HuR的结合,导致HuR的泛素化和降解,并降低p21活性。此外,UMSC-Exos通过递送circHIPK3发挥抗衰老和心脏保护作用。这些发现为开发针对衰老相关心功能障碍的新疗法铺平了道路。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
circHIPK3在心肌细胞衰老中发挥何种作用及其分子机制?
核心机制
circHIPK3作为支架同时结合HuR和E3泛素连接酶β-TrCP,促进HuR的泛素化降解,减少胞质中HuR与p21 mRNA的结合,降低p21 mRNA稳定性,从而抑制心肌细胞衰老。
主要证据
通过CKO小鼠模型证实circHIPK3缺失导致心脏衰老表型;在细胞实验中,RIP和RNA-pull-down显示circHIPK3与HuR和β-TrCP结合;Co-IP显示circHIPK3沉默减弱HuR与β-TrCP相互作用并减少HuR泛素化;外泌体递送circHIPK3恢复CKO小鼠心脏功能。
研究意义
提供了心肌细胞特异性circHIPK3敲除小鼠作为衰老研究的新模型,并揭示UMSC-Exos递送circHIPK3作为治疗衰老相关心功能障碍的潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

circRNA测序及circHIPK3表达分析

筛选与心脏衰老相关的circRNA,并分析circHIPK3的表达特征。

提取年轻(6周)和中龄(15个月)小鼠心脏total RNA,进行circRNA/mRNA测序分析,发现circHIPK3在心脏中高表达且随年龄下降;通过qRT-PCR验证不同组织和不同年龄心脏中的表达。

2

细胞水平circHIPK3功能获得与缺失实验

验证circHIPK3对心肌细胞衰老的影响。

在H9C2细胞和原代心肌细胞中,通过siRNA沉默或质粒过表达circHIPK3,检测细胞增殖(EdU)、衰老相关β-半乳糖苷酶染色及p16、p21表达。

3

心肌细胞特异性circHIPK3敲除小鼠模型建立与表型分析

在体内验证circHIPK3缺失对心脏衰老和功能的影响。

通过αMHCMerCreMer小鼠与circHIPK3Flox/Flox小鼠杂交,获得CKO小鼠,他莫昔芬诱导敲除后,通过超声心动图、端粒长度检测、qRT-PCR和Western blot评估心脏功能及衰老标志物。

4

circHIPK3与HuR及β-TrCP相互作用的机制验证

阐明circHIPK3调控HuR降解的分子机制。

通过RNA-pulldown、RIP、Co-IP实验检测circHIPK3与HuR、β-TrCP的结合,以及circHIPK3沉默对HuR泛素化和p21 mRNA结合的影响;使用MG132抑制蛋白酶体确认HuR降解途径。

5

外泌体递送circHIPK3的抗衰老作用评估

验证UMSC-Exos通过递送circHIPK3发挥心脏保护作用。

从UMSC培养上清中提取外泌体,通过PKH26标记和荧光显微镜观察心肌细胞摄取;在体外用外泌体处理H9C2细胞和原代心肌细胞,评估增殖、衰老和p21表达;在体内向CKO小鼠尾静脉注射外泌体,检测心脏功能和衰老指标。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
他莫昔芬Sigma--
玉米油Solarbio--
TRIzol试剂Invitrogen--
TRIzol试剂TaKaRa--
PrimeScript逆转录试剂TaKaRa--
SYBR Premix Ex TaqTaKaRa--
StepOnePlus实时荧光定量PCR系统ABI--
RIPA裂解液Beyotime Biotechnology--
PVDF膜MilliporeISEQ00010
p16抗体Signalway Antibody32050
p21抗体Signalway Antibody30427
GAPDH抗体Proteintech60004-1-lg
HuR抗体Santa Cruz Biotechnologysc-5261
CD63抗体Santa Cruz Biotechnologysc-5275
CD9抗体Abcamab92726
β-TrCP抗体Cell Signaling Technology4394
组蛋白H3抗体Cell Signaling Technology9715
泛素抗体Cell Signaling Technology3933
ECL化学发光试剂盒Biological Industries--
BioRad化学发光成像系统BioRad--
核质蛋白提取试剂盒Beyotime Biotechnology--
组织/血液DNA提取试剂盒Tiangen Biotech--
蛋白A/G琼脂糖珠Santa Cruz Biotechnologysc-2003
IgG抗体Beyotime BiotechnologyA7031
链霉亲和素磁珠Invitrogen65001
总外泌体分离试剂盒Life Technology--
BCA蛋白定量试剂盒Takara--
PKH26荧光标记试剂盒Sigma-Aldrich--
NanoSight NS300纳米颗粒分析仪Malvern--
EdU细胞增殖检测试剂盒RiboBio--
衰老相关β-半乳糖苷酶染色试剂盒Beyotime Biotechnology--
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen--
嘌呤霉素Merck--
杀稻瘟菌素Sigma-Aldrich--
MG132蛋白酶体抑制剂----
13 MHz超声探头VisualSonics--
跑台Jiangsu SANS Biological Technology Co. Ltd.--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型构建
他莫昔芬剂量、给药途径、给药次数
阅读提示:Methods: Generation of circHIPK3 knockout mice
细胞实验
转染时间、EdU浓度、β-gal染色步骤
阅读提示:Methods: EdU proliferation assay, Senescence-associated β-galactosidase staining, Plasmid and siRNA construction
蛋白相互作用
抗体信息和IP条件
阅读提示:Methods: RNA immunoprecipitation, Co-immunoprecipitation
外泌体实验
外泌体提取和鉴定方法、处理浓度和时间
阅读提示:Methods: Harvest and identification of UMSC exosomes, Exosome labeling and uptake
体内外泌体治疗
注射剂量、频率和周期
阅读提示:Methods: Exosomes prevent cardiac senescence in circHIPK3 knockout mice