比较不同脂肪细胞模型中AMPKβ亚型的表达
确定不同脂肪细胞模型中AMPKβ1和β2的相对表达水平。
通过Western blot分析3T3-L1、原代小鼠、大鼠和人类脂肪细胞裂解液中AMPKβ1和β2的表达,并使用β1/β2抗体进行免疫沉淀验证抗体特异性。
AMPKβ isoform expression patterns in various adipocyte models and in relation to body mass index.
研究包含多种细胞模型比较、免疫沉淀、激酶活性测定、Western blot及临床样本分析等多层次证据,且进行了相关性验证。
原代人皮下脂肪细胞 原代小鼠附睾及腹股沟脂肪细胞 3T3-L1脂肪细胞 原代大鼠附睾脂肪细胞
AMPKβ1/β2抗体特异性及免疫沉淀效率 不同脂肪细胞模型(3T3-L1、原代小鼠/大鼠/人)的β亚型分布 BMI范围(21-66 kg/m²)及样本量(22例) AMPK活性测定中使用的AMARA肽及32Pγ-ATP Western blot信号归一化参考(HSP90)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定不同脂肪细胞模型中AMPKβ1和β2的相对表达水平。
通过Western blot分析3T3-L1、原代小鼠、大鼠和人类脂肪细胞裂解液中AMPKβ1和β2的表达,并使用β1/β2抗体进行免疫沉淀验证抗体特异性。
评估不同β亚型对总AMPK活性的贡献。
从各细胞模型中免疫沉淀β1或β2,使用AMARA肽进行体外激酶活性测定。
探讨BMI是否影响AMPK亚基表达和激酶活性。
从22名不同BMI个体分离皮下脂肪细胞,Western blot检测AMPK亚基表达和磷酸化,测定AMPKα1激酶活性,并进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质分离与检测 | 完全蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Sigma Aldrich | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | Sigma Aldrich | -- | |
| 庆大霉素 | Sigma Aldrich | -- | |
| 苯基异丙基腺苷 | Sigma Aldrich | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白G-琼脂糖 | GE Healthcare Biosciences | -- |
| 体外激酶活性测定 | p81磷酸纤维素阳离子交换纸 | Whatman | -- |
| γ-32P-ATP | Perkin Elmer | -- | |
| AMARA肽 | GL Biochem | -- | |
| 蛋白质检测 | SuperSignal West Pico底物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SuperSignal West Femto底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 抗AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2603 |
| 抗AMPK磷酸化T172抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 抗Raptor抗体 | Cell Signaling Technology | 2280 | |
| 抗Raptor磷酸化S792抗体 | Cell Signaling Technology | 2083 | |
| 抗ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3662 | |
| 抗ACC磷酸化S79抗体 | Cell Signaling Technology | 3661 | |
| 抗AMPKβ1/β2抗体 | Cell Signaling Technology | 4150 | |
| 抗AMPKγ1抗体 | Cell Signaling Technology | 4187 | |
| 抗HSP90抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫沉淀 | 抗AMPKα1抗体 | 在内部生成,使用Innovagen合成肽 | -- |
| 抗AMPKβ1抗体 | Signalway | 27201 | |
| 抗AMPKβ2抗体 | Grahame Hardie馈赠 | -- | |
| 蛋白质检测 | 抗兔HRP标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗小鼠HRP标记二抗 | GE Healthcare | -- | |
| 细胞培养 | 胶原酶 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 统计学分析 | GraphPad 9软件 | GraphPad | -- |
| 蛋白质检测 | ChemiDoc XRS+成像系统 | BioRad | -- |
| 细胞培养 | 3T3-L1成纤维细胞 | ATCC | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 原代小鼠、大鼠和人类脂肪细胞的分离方法、培养条件及3T3-L1细胞的分化方案(包括分化天数和培养基成分) 阅读提示:Methods: Isolation and lysis of primary rodent adipocytes; Isolation and lysis of primary human adipocytes; Culture and lysis of mouse 3T3-L1 adipocytes |
| 抗体特异性验证 | AMPKβ1和β2抗体的特异性及免疫沉淀效率(不同细胞模型中残留量) 阅读提示:Figure 1 and corresponding legend; Methods: AMPKβ1 and -β2 immunoprecipitation |
| 激酶活性测定 | 免疫沉淀的蛋白量、抗体量、AMARA肽浓度、32Pγ-ATP浓度、反应时间等参数 阅读提示:Methods: In vitro assay of AMPK activity |
| 人类样本分析 | BMI范围、样本量、性别比例、样本来源(手术类型)、脂肪组织部位(皮下)、处理及裂解方法 阅读提示:Methods: Isolation and lysis of primary human adipocytes; Figure 2 legend |
| Western blot分析 | 用于归一化的内部对照(HSP90)及标准化方式 阅读提示:Methods: Western blotting; Figure 2 legend |