细菌培养与感染模型建立
建立齿垢密螺旋体或牙龈卟啉单胞菌口腔感染的小鼠模型,模拟慢性牙周炎。
将T. denticola ATCC 35405和P. gingivalis ATCC 33277培养后,以109 CFU/mL/50 µL的剂量给小鼠口腔灌胃,每周3次,共24周。对照组给予等体积含3% CMC的PBS。
Treponema denticola Induces Neuronal Apoptosis by Promoting Amyloid-β Accumulation in Mice.
包含体内动物模型和体外细胞实验两个独立证据层级,并进行了功能验证(Aβ抑制剂逆转)和机制验证(凋亡相关蛋白检测)。
C57BL/6小鼠 N2a小鼠神经母细胞瘤细胞
T. denticola ATCC 35405和P. gingivalis ATCC 33277口腔感染,剂量为109 CFU/mL/50 µL,每周3次,持续24周 N2a细胞与T. denticola共培养(MOI 1:100)或Aβ1-40、Aβ1-42(25 μM)处理2小时,然后更换培养基培养12小时 Aβ抑制剂KMI1303预处理浓度1 μM,处理4小时 动物分组:空白对照组、T. denticola感染组、P. gingivalis感染组,每组5只小鼠 TUNEL染色和Western blot检测凋亡指标(cleaved caspase-3、BCL-W、SAPK/JNK、SMAC)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立齿垢密螺旋体或牙龈卟啉单胞菌口腔感染的小鼠模型,模拟慢性牙周炎。
将T. denticola ATCC 35405和P. gingivalis ATCC 33277培养后,以109 CFU/mL/50 µL的剂量给小鼠口腔灌胃,每周3次,共24周。对照组给予等体积含3% CMC的PBS。
评估口腔感染齿垢密螺旋体是否导致牙槽骨吸收。
采用Micro-CT扫描小鼠上颌骨,三维重建后测量第二磨牙CEJ到ABC的距离,评估牙槽骨水平。
检测口腔感染齿垢密螺旋体是否诱导小鼠海马神经元凋亡。
通过TUNEL染色检测海马凋亡细胞,Western blot检测cleaved caspase-3蛋白水平,qRT-PCR和Western blot检测凋亡相关基因和蛋白表达变化。
验证T. denticola和Aβ对神经元凋亡的直接作用。
N2a细胞与T. denticola(MOI 1:100)或Aβ1-40、Aβ1-42(25 μM)共培养2小时,更换新鲜培养基后培养12小时,检测凋亡和蛋白表达。
验证Aβ在T. denticola诱导神经元凋亡中的介导作用。
N2a细胞先用Aβ抑制剂KMI1303(1 μM)预处理4小时,再与T. denticola共培养2小时,更换新鲜培养基后培养12小时,检测凋亡和蛋白变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 新型口腔螺旋体培养基 | -- | -- |
| 脑心浸液培养基 | OXOID | -- | |
| 脱纤维羊血 | -- | -- | |
| 血红素 | -- | -- | |
| 甲萘醌 | -- | -- | |
| 细菌稀释 | 羧甲基纤维素 | -- | -- |
| 动物实验 | 卡那霉素 | -- | -- |
| PCR | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| PCR扩增试剂盒 | Takara | -- | |
| Taq PCR预混液 | -- | -- | |
| PCR引物合成 | PCR引物 | Sangon Biotech | -- |
| Micro-CT扫描 | 显微CT仪器 | Scanco Medical | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| β-淀粉样蛋白1-40 | -- | -- | |
| β-淀粉样蛋白1-42 | -- | -- | |
| 细胞处理 | KMI1303 | Bioss | -- |
| TUNEL染色 | TUNEL试剂盒 | Roche | -- |
| 蛋白酶K | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Signalway Antibody | 200612 | |
| SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5×) | Beyotime | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| cleaved caspase-3一抗 | Signalway Antibody | 49500 | |
| BCL-W一抗 | Signalway Antibody | 40641 | |
| SAPK/JNK一抗 | Signalway Antibody | 11249 | |
| SMAC/DIABLO一抗 | Signalway Antibody | 39330 | |
| GAPDH一抗 | Signalway Antibody | 21612 | |
| Super ECL Plus试剂 | -- | -- | |
| qRT-PCR | RNApure总RNA快速提取试剂盒 | BioTeke | -- |
| Evo M-MLV逆转录试剂盒(含gDNA Clean,适用于qPCR II) | Accurate Biology | -- | |
| TB Green Premix Ex Taq II | TAKARA | -- | |
| Applied Biosystems QuantStudio 6 Flex实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 统计分析 | SPSS 16.0 | SPSS Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养与口腔感染 | 细菌浓度、接种体积、接种频率、持续时间;小鼠品系、年龄、性别、体重;对照组处理 阅读提示:Methods 4.1和4.2 |
| Micro-CT检测牙槽骨丢失 | 扫描参数、测量位点、图像分析软件 阅读提示:Methods 4.4 |
| 体内凋亡检测 | TUNEL染色、Western blot、qRT-PCR的具体实验条件和样本量 阅读提示:Methods 4.6、4.7、4.8;Figure 1和2图注 |
| 细胞培养和处理 | N2a细胞培养条件、T. denticola的MOI、Aβ的浓度、共培养时间、KMI1303的浓度和预处理时间 阅读提示:Methods 4.5;Figure 3和4图注 |
| 统计分析 | 统计方法、样本量、显著性水平 阅读提示:Methods 4.9 |