验证PFKP在脑肿瘤生长和血管形成中的作用
探究PFKP缺失是否影响EGFR激活的GBM细胞脑肿瘤生长和血管形成。
在LN229/EGFRvIII细胞中敲低PFKP,颅内注射裸鼠,进行组织学、IHC(CD31)和生存分析。
Mutual regulation between phosphofructokinase 1 platelet isoform and VEGF promotes glioblastoma tumor growth.
研究包含体外细胞模型、体内颅内异种移植模型和患者样本IHC分析及TCGA数据等多层级验证,并进行了功能验证(如PFKP敲低和回补)和机制验证(如SP1、β-catenin通路)。
GBM细胞系(LN229、U251、A172、LN18、U373MG、T98G、U251等) 胶质瘤干细胞(GSCs,XO6) 颅内异种移植裸鼠模型 人GBM标本(25例)及TCGA GBM数据队列
PFKP和VEGF的敲低/过表达及回补实验 EGF和VEGF处理浓度及时间(EGF 100 ng/mL;VEGF 20 ng/mL) 关键抑制剂处理(MK-2206、LY294002、SU1498、HIF-1α抑制剂等) 颅内注射细胞的数量和动物品系(4周龄雄性裸鼠,每组5只) 临床样本的IHC评分和TCGA相关性分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PFKP缺失是否影响EGFR激活的GBM细胞脑肿瘤生长和血管形成。
在LN229/EGFRvIII细胞中敲低PFKP,颅内注射裸鼠,进行组织学、IHC(CD31)和生存分析。
检测PFKP表达对EGFR激活诱导的VEGF表达和体外血管生成的影响。
在GSCs、LN229等细胞中敲低PFKP,用EGF刺激,检测VEGF mRNA和蛋白表达;收集条件培养基进行HUVEC管形成实验;TCGA相关性分析。
探究PFKP是否影响EGFR激活诱导的HIF-1α表达和转录活性。
敲低PFKP后,EGF刺激,检测HIF-1α蛋白和mRNA;HRE荧光素酶报告实验;放线菌素D处理;TCGA分析。
确定PFKP Y64磷酸化是否通过AKT/SP1通路调控HIF-1α转录。
使用信号通路抑制剂,鉴定PI3K/AKT、NF-κB等通路的作用;在PFKP敲低细胞中回补WT或Y64F突变体,检测HIF-1α表达;SP1敲低和mithramycin处理;SP1荧光素酶和ChIP实验。
阐明PFKP Y64磷酸化如何通过HIF-1α和β-catenin调节VEGF表达。
在PFKP敲低细胞中回补WT或Y64F突变体,过表达HIF-1α或CA β-catenin,检测VEGF表达;使用HIF-1α抑制剂。
评估PFKP Y64磷酸化在体内对HIF-1α、β-catenin、VEGF表达及血管形成的作用。
颅内注射表达PFKP shRNA和回补WT或Y64F突变体(有无AKT活性形式)的细胞,进行IHC和生存分析。
评估PFKP Y64磷酸化水平与人GBM标本中HIF-1α、β-catenin S552磷酸化和VEGF表达的相关性。
使用25例人GBM标本进行IHC染色和评分,进行相关性分析。
探究VEGF是否通过PFKP S386磷酸化影响PFKP表达、糖酵解和增殖。
用VEGF刺激GBM细胞,检测葡萄糖消耗、乳酸分泌、增殖;检测PFKP表达和PFK活性;使用AKT和VEGFR2抑制剂。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Capricorn Scientific | -- | |
| Neurobasal Plus培养基 | ThermoFisher | -- | |
| B-27补充剂 | ThermoFisher | -- | |
| 表皮生长因子 | -- | -- | |
| 成纤维细胞生长因子 | PeproTech | -- | |
| 转染 | Lipofectamine2000转染试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | ThermoFisher | -- | |
| Western blot | PFKP抗体 | Cell Signaling Technology | 12746 |
| β-catenin (pS552)抗体 | Cell Signaling Technology | 9566 | |
| AKT (pS473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| VEGF抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7269 | |
| HIF-1α抗体 | Abcam | ab51608 | |
| PFKP (pY64)抗体 | Signalway Antibody | -- | |
| 药物处理 | MK-2206 | Selleck Chemicals | S1078 |
| LY294002 | LC Laboratories | L-7988 | |
| SU1498 | -- | -- | |
| HIF-1α抑制剂 | Selleck Chemicals | S7612 | |
| 信号通路抑制 | PD98059 | LC Laboratories | P-4313 |
| SP600125 | LC Laboratories | S-7979 | |
| SB203580 | LC Laboratories | S-3400 | |
| NF-κB抑制剂 | EMD Biosciences | 481412 | |
| 重组蛋白 | 重组人VEGF165 | Peprotech Korea | 100-20 |
| 转染 | SP1 siRNA | ThermoFisher Scientific | 116546 |
| Western blot | EGFR抗体 | BD Biosciences | 610016 |
| FLAG抗体 | Sigma | F3165 | |
| HA抗体 | Sigma | H6908 | |
| 微管蛋白抗体 | Sigma | T6074 | |
| 细胞培养 | 潮霉素B | Sigma | H3274 |
| 嘌呤霉素 | Sigma | P8833 | |
| G418 | Roche | 4727878001 | |
| Western blot | 山羊抗小鼠IgG(HRP) | BioActs | RSA1122 |
| 山羊抗兔IgG(HRP) | BioActs | RSA1221 | |
| 定量PCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 荧光素酶报告 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质IP试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 管形成 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| EBM-2培养基 | Lonza | -- | |
| 糖代谢检测 | 葡萄糖(GO)检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 乳酸检测试剂盒 | Eton Bioscience | -- | |
| PFK活性检测 | PFK活性比色检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 细胞增殖 | Quanti-Max WST-8细胞活力检测试剂盒 | BIOMAX | -- |
| 动物实验 | 甲醛 | -- | -- |
| Mayer苏木素 | Biogenex Laboratories | -- | |
| 伊红 | Biogenex Laboratories | -- | |
| IHC | VECTASTAIN Elite ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| DAB显色液 | Vector Laboratories | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基和添加剂;EGF和VEGF浓度;血清饥饿条件。 阅读提示:Materials and methods 中的 Cell culture 和 Results 图例 |
| 基因敲低与回补 | shRNA序列、转染试剂和条件;回补构建体的类型(WT、突变体)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Transfection 和 DNA constructs and mutagenesis |
| 信号通路抑制 | 抑制剂名称、浓度和预处理时间。 阅读提示:Materials and methods 中列出抑制剂的段落及图例 |
| 体内实验 | 动物品系、性别、年龄、每组数量;注射细胞数和体积;观察时间点。 阅读提示:Materials and methods 中的 Intracranial implantation 和 Results 图例 |
| 临床样本分析 | 样本来源和数量;IHC评分标准。 阅读提示:Materials and methods 中的 IHC analysis and scoring |