临床和动物模型验证炎症和相关蛋白表达
确认DN患者和大鼠中炎症因子、PTP1B、p-p65、CREB和KMT5A的表达变化。
检测DN患者和大鼠血浆炎症因子水平(ELISA),肾组织病理染色(HE、Masson),免疫组化检测p-p65、PTP1B、CREB、KMT5A表达。
The CREB/KMT5A complex regulates PTP1B to modulate high glucose-induced endothelial inflammatory factor levels in diabetic nephropathy.
包含患者样本、大鼠体内模型及HUVECs体外实验等多层次验证,并进行了功能获得与缺失、机制研究和回补实验。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 糖尿病肾病大鼠模型 糖尿病肾病患者肾活检样本
HUVECs在5mM或25mM葡萄糖DMEM中培养6天 DN大鼠模型使用STZ(50mg/kg)注射和高糖高脂饮食诱导 siRNA/shRNA转染序列及效率验证 ChIP实验中PTP1B启动子引物序列
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认DN患者和大鼠中炎症因子、PTP1B、p-p65、CREB和KMT5A的表达变化。
检测DN患者和大鼠血浆炎症因子水平(ELISA),肾组织病理染色(HE、Masson),免疫组化检测p-p65、PTP1B、CREB、KMT5A表达。
确定高糖是否通过上调PTP1B诱导内皮炎症。
HUVECs在高糖(25mM)处理6天,检测炎症因子表达、p-p65和PTP1B水平;使用si-PTP1B敲低验证功能。
验证CREB和KMT5A在高糖诱导的炎症中的作用。
高糖处理HUVECs,检测CREB和KMT5A表达;过表达或敲低CREB/KMT5A,检测PTP1B、p-p65和炎症因子;并用si-PTP1B进行回补实验。
阐明CREB和KMT5A如何协同调节PTP1B转录。
通过CoIP和免疫荧光验证CREB与KMT5A相互作用;ChIP检测CREB和H4K20me1在PTP1B启动子的富集;双荧光素酶报告基因检测启动子活性。
验证DN患者和大鼠肾组织中CREB和KMT5A的下调。
免疫染色和Western blot/qPCR检测肾或主动脉组织中CREB和KMT5A的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 动物模型 | 链脲佐菌素 | -- | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| β-actin抗体 | ProteinTech | 60004-1-Ig | |
| KMT5A抗体 | ProteinTech | 14063-1-AP | |
| CREB抗体 | Cell Signalling Technology | #9197 | |
| PTP1B抗体 | ProteinTech | 11334-1-AP | |
| p-p65抗体 | Signalway antibody | #11014 | |
| H4K20me1抗体 | Abcam | ab9051 | |
| RNA提取和qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT试剂 | TaKaRa | -- | |
| qPCR | Hieff UNICON® qPCR TaqMan探针预混液 | Yeasen | -- |
| ABI7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | Thermo Fisher | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| CHIP | Simple ChIP Plus超声染色质IP试剂盒 | Cell Signalling Technology | -- |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 生化检测 | 肌酐检测试剂盒 | Jiancheng Bio | -- |
| 尿素氮检测试剂盒 | Jiancheng Bio | -- | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | -- | -- |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | HUVEC培养基中葡萄糖浓度(5mM或25mM)及处理时间(6天)、渗透压对照(甘露醇20mM)。 阅读提示:Methods中的Cell culture and reagents |
| 动物模型建立 | 大鼠品系(Sprague-Dawley)、体重(180-200g)、高糖高脂饮食成分及时间、STZ剂量(50mg/kg)及注射方式、实验周期。 阅读提示:Methods中的Rat model of DN and samples |
| 基因敲低和过表达 | siRNA/shRNA序列(si-CREB、si-PTP1B、sh-KMT5A)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、敲低/过表达效率验证。 阅读提示:Methods中的siRNA, shRNA and KMT5A mutant treatments |
| 机制研究 | ChIP实验中的抗体(anti-CREB、anti-H4K20me1)、PTP1B启动子引物序列;双荧光素酶报告基因中启动子构建和共转染质粒。 阅读提示:Methods中的Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay和Dual-luciferase assay |
| 统计方法 | 样本量(体外n=5,体内n=10)、统计方法(双尾非配对t检验或单因素方差分析)、显著性水平(P<0.05)。 阅读提示:Methods中的Statistical analysis |