临床牙龈组织病理检测
评估NLRP3炎症小体相关蛋白在严重慢性牙周炎组织中的表达水平,以探索其临床相关性。
收集健康对照和重度牙周炎患者的牙龈组织标本,固定后进行免疫组化染色,检测NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP6、NLRP12、AIM2、IL-1β、ASC、Caspase-1和Caspase-4的表达,并定量分析阳性染色面积百分比。
Porphyromonas gingivalis-Induced NLRP3 Inflammasome Activation and Its Downstream Interleukin-1β Release Depend on Caspase-4.
包含临床牙龈组织免疫组化、THP-1细胞系体外感染模型、siRNA基因敲低和ELISA/免疫印迹功能验证,多层级证据支持机制结论。
严重慢性牙周炎患者牙龈组织 PMA分化的THP-1巨噬细胞样细胞 P. gingivalis ATCC 33277 S. mitis ATCC 49456
P. gingivalis ATCC 33277和S. mitis ATCC 49456菌株及培养条件 THP-1细胞PMA分化浓度(100 nM)和感染MOI(50)及时间(2 h) siRNA敲低效率(NLRP3 57.8%、CASP1 69.6%、CASP4 94.6%) MCC950抑制NLRP3的浓度(1和10 μM) ATP共刺激浓度(5 mM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NLRP3炎症小体相关蛋白在严重慢性牙周炎组织中的表达水平,以探索其临床相关性。
收集健康对照和重度牙周炎患者的牙龈组织标本,固定后进行免疫组化染色,检测NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP6、NLRP12、AIM2、IL-1β、ASC、Caspase-1和Caspase-4的表达,并定量分析阳性染色面积百分比。
比较P. gingivalis和S. mitis对THP-1细胞IL-1β表达和NLRP3炎症小体成分的影响,以揭示病原菌和共生菌的差异应答。
PMA分化的THP-1细胞以不同MOI和时间感染P. gingivalis或S. mitis,检测IL-1β mRNA、前体蛋白和分泌水平,以及NLRP3、Caspase-1、ASC等表达和活性。
确定NLRP3、Caspase-1和Caspase-4在P. gingivalis和S. mitis诱导IL-1β产生中的必要性和特异性。
使用siRNA分别敲低NLRP3、CASP1、CASP4和ASC,然后感染细菌或联合ATP刺激,检测IL-1β、活性Caspase-1和Caspase-4的表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 脑心浸液琼脂 | -- | -- |
| 胰蛋白胨大豆肉汤 | -- | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | EveryGreen, TianhangBio | -- | |
| 细胞分化 | 佛波酯 | Sigma | -- |
| 细胞刺激 | 三磷酸腺苷 | Sigma | -- |
| NLRP3抑制 | MCC950 | Selleck | S7809 |
| siRNA转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT预混液 | Takara | -- |
| qRT-PCR | SYBR预混液 | Takara | -- |
| ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | -- |
| PVDF膜 | R&D System Inc. | -- | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34087 | |
| 抗体 | 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 13158 |
| 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| 抗ASC抗体 | Proteintech | 10500-1-AP | |
| 抗pro-Caspase-1抗体 | Abcam | ab179515 | |
| 抗Caspase-4抗体 | Proteintech | 11856-1-AP | |
| 抗NLRP1抗体 | Proteintech | 12256-1-AP | |
| 抗NLRP2抗体 | Proteintech | 15182-1-AP | |
| 抗NLRP3抗体 | Proteintech | 19771-1-AP | |
| 抗NLRP6抗体 | Signalway Antibody | 37752 | |
| 抗NLRP12抗体 | Signalway Antibody | 37750 | |
| 抗AIM2抗体 | Abcam | ab93015 | |
| 抗ASC抗体 | Proteintech | 10500-1-AP | |
| 抗Caspase-1抗体 | Abcam | ab62698 | |
| ELISA检测 | IL-1β ELISA试剂盒 | R&D System Inc. | -- |
| 活性Caspase-1 ELISA试剂盒 | R&D System Inc. | -- | |
| 微孔板读数 | 酶标仪 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养 | P. gingivalis和S. mitis的培养条件(培养基、厌氧环境、温度)以及细菌悬液制备(OD值对应的CFU/ml) 阅读提示:Methods: Bacterial Culture |
| 细胞培养和分化 | THP-1细胞培养条件(RPMI 1640、10% FBS),PMA分化浓度(100 nM)和时间(过夜),细胞数量(约2×10^6/孔) 阅读提示:Methods: THP-1 Cell Culture |
| 细菌感染 | 感染复数(MOI)和时间点(0.5、5、50;2、6、24小时),以及后续实验选择的MOI=50和2小时感染时间 阅读提示:Methods: THP-1 Cell Culture, Figure Legends 3-7 |
| siRNA敲低 | siRNA序列效率(NLRP3、CASP1、CASP4、ASC敲低效率),转染浓度和时间(300 pmol;24/48小时) 阅读提示:Methods: RNA Interference Assay, Supplementary Figure 3 |
| 抑制剂处理 | MCC950预处理浓度和时间(10 μM,1小时;或1和10 μM) 阅读提示:Methods: THP-1 Cell Culture, Figure Legends 5E,F |
| 检测方法 | ELISA试剂盒(R&D System)、Western blot一抗和二抗信息、qRT-PCR引物序列 阅读提示:Methods: Cytokine Analysis, Western Blot Analysis, qRT-PCR |