临床样本中USP13表达检测
评估USP13在OSCC组织和癌旁组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
对50例OSCC和10例癌旁组织石蜡切片进行免疫组织化学染色,检测USP13蛋白表达,并统计其与临床分期的关联。
USP13 serves as a tumor suppressor via the PTEN/AKT pathway in oral squamous cell carcinoma.
包含免疫组化临床样本分析、体外细胞功能实验(增殖、糖酵解)、机制验证(PTEN/AKT通路)及体内裸鼠移植瘤实验,具备多个独立证据层级。
CAL27细胞 HSC4细胞 SCC15细胞 裸鼠皮下移植瘤模型
组织样本:50例人OSCC和10例癌旁组织,用于免疫组化分析 细胞系:CAL27、HSC4(低USP13表达)用于过表达实验,SCC15(高USP13表达)用于敲低实验 USP13过表达慢病毒和shRNA(shUSP13#1/#2/#3)的构建及敲低效率验证 体内实验:CAL27细胞皮下注射裸鼠(每组6只),肿瘤体积每3天监测,33天后取材 糖酵解检测:2-NBDG摄取和乳酸产生,处理48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估USP13在OSCC组织和癌旁组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
对50例OSCC和10例癌旁组织石蜡切片进行免疫组织化学染色,检测USP13蛋白表达,并统计其与临床分期的关联。
检测USP13过表达对OSCC细胞增殖和糖酵解(葡萄糖摄取和乳酸产生)的影响。
使用慢病毒在CAL27和HSC4细胞中过表达USP13,通过CCK-8实验检测细胞增殖,通过2-NBDG摄取和乳酸检测评估糖酵解水平。
验证USP13对糖酵解和细胞功能的影响是否通过PTEN/AKT通路介导。
在SCC15细胞中敲低USP13(shUSP13)并过表达PTEN,检测葡萄糖摄取、乳酸产生、AKT磷酸化及GLUT1和HK2表达。
验证USP13过表达在体内对OSCC肿瘤生长的影响。
将稳定过表达USP13的CAL27细胞皮下注射到裸鼠,监测肿瘤体积和重量,并通过Western blot检测肿瘤组织中相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 兔抗USP13抗体 | ProteinTech | 16840-1-AP |
| DAB显色试剂盒 | Long Island | -- | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | -- | |
| 慢病毒包装 | pLVX-puro载体 | Clontech | -- |
| psPAX2包装质粒 | Addgene | -- | |
| pMD2G包膜质粒 | Addgene | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 慢病毒介导RNAi | pLKO.1质粒 | Addgene | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Jrdun Biotech. | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| 抗USP13抗体 | Abcam | Ab109264 | |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | Ab115730 | |
| 抗HK2抗体 | Abcam | Ab104836 | |
| 抗PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9552 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 增强化学发光底物 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | SAB biotech. | CP002 |
| 葡萄糖摄取检测 | 2-NBDG荧光葡萄糖类似物 | Cayman | -- |
| 无糖培养基 | Gibco | -- | |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
| 实时荧光定量PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| ABI 7300实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | 组织样本来源、数量(50例OSCC和10例癌旁)、USP13抗体信息(ProteinTech 16840-1-AP)、染色和判读标准。 阅读提示:Materials and methods: Tissue samples and patient information; Immunohistochemical analysis; Figure 1; Table 1 |
| 细胞培养与处理 | 细胞系(CAL27、HSC4、SCC15)、培养条件(DMEM+10% FBS+双抗)、USP13过表达慢病毒和shRNA序列、MOI或感染效率、处理时间(48小时)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Lentivirus-mediated overexpression; Lentivirus-mediated RNAi; Figure 2A; Figure 3A |
| 体外功能检测 | CCK-8检测细胞数量、2-NBDG摄取实验条件(浓度100 μM、孵育45分钟)、乳酸检测试剂盒、统计方法(ANOVA)。 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation assay; Measurement of 2-NBDG uptake; Lactate production; Figure 2B-D; Figure 3C-D |
| 机制验证 | PTEN过表达慢病毒构建、shUSP13#2的靶序列、检测指标(PTEN、p-AKT、AKT、GLUT1、HK2)及Western blot条件。 阅读提示:Materials and methods: Lentivirus-mediated overexpression; Lentivirus-mediated RNAi; Protein extraction and Western blot analysis; Figure 3E-F |
| 动物实验 | 小鼠品系(雌性裸鼠)、细胞注射数量(5×10^6/只)、分组(每组6只)、监测频率(每3天)、终点时间(第33天)、肿瘤体积计算方式。 阅读提示:Materials and methods: Tumor growth; Figure 4A-B |