临床样本分析
评估TRIM14在CRC组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。
对74例CRC组织和12例非癌组织进行IHC染色,分析TRIM14表达与临床病理参数的相关性,并进行生存分析。
TRIM14 promotes cell proliferation and inhibits apoptosis by suppressing PTEN in colorectal cancer.
包含临床样本分析、体外细胞功能实验、动物异种移植模型、机制验证(Western blot、RT-qPCR、免疫荧光、免疫沉淀)等多个层级。
结直肠癌细胞系HT-29 结直肠癌细胞系SW620 结直肠癌细胞系LoVo BALB/c裸鼠异种移植瘤模型 74例结直肠癌患者肿瘤及癌旁组织
TRIM14表达与肿瘤大小(P=0.0023)、临床分期(P=0.0377)显著相关 使用shTRIM14-1敲低HT-29和SW620细胞中的TRIM14,效率验证 使用pLVX-TRIM14过表达LoVo细胞中的TRIM14 HT-29细胞(2×10^6)皮下注射至4周龄BALB/c裸鼠,每组6只 PTEN过表达逆转TRIM14促增殖作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TRIM14在CRC组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。
对74例CRC组织和12例非癌组织进行IHC染色,分析TRIM14表达与临床病理参数的相关性,并进行生存分析。
验证TRIM14对CRC细胞增殖和凋亡的影响。
在HT-29和SW620细胞中敲低TRIM14,在LoVo细胞中过表达TRIM14,通过CCK-8和Annexin V流式实验检测增殖和凋亡。
验证TRIM14敲低对CRC肿瘤生长的影响。
将稳定表达shTRIM14或shNC的HT-29细胞皮下注射到裸鼠,测量肿瘤生长,并进行Ki67 IHC染色。
探讨TRIM14调控增殖和凋亡的分子机制,特别是PTEN/AKT通路。
通过Western blotting和RT-qPCR检测PTEN、p-AKT、AKT、Bcl-2、Cyclin D1、p27的表达;免疫荧光观察TRIM14和PTEN共定位;免疫共沉淀检测PTEN泛素化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗TRIM14抗体 | Abcam | ab185349 |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| 抗PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9552 | |
| 抗p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗CyclinD1抗体 | Cell Signaling Technology | 2922 | |
| 抗p27抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-130307 | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂 | SAB biotech | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-异硫氰酸荧光素 | Beyotime | -- |
| 碘化丙啶溶液 | Beyotime | -- | |
| 动物实验 | 嘌呤霉素 | Sigma | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| SYBR Green qPCR预混液 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫荧光 | 抗PTEN抗体 | Abcam | ab79156 |
| 抗TRIM14抗体 | Invitrogen | PA5-62761 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG (H+L) | Beyotime | A0423 | |
| Alexa Fluor 555驴抗小鼠IgG (H+L) | Beyotime | A0460 | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | Roche | -- |
| 抗泛素抗体 | Abcam | Ab7780 | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | -- | -- |
| 免疫组织化学 | 酶标仪 | Labsystems | -- |
| 凋亡检测 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | Accuri |
| RT-qPCR | NanoDrop分光光度计 | Thermo Scientific | ND-1000 |
| ABI 7300系统 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 样本量(74例CRC,12例非癌)、组织类型(石蜡包埋)、抗体(ab185349)、IHC评分标准 阅读提示:Materials and methods: Patient information, Immunohistochemistry (IHC) analysis |
| 细胞培养 | 细胞系(LoVo, HT-29, SW620)、培养基(RPMI-1640 + 10% FBS)、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 基因敲低和过表达 | shRNA序列(shTRIM14-1,2,3)、过表达载体(pLVX-TRIM14)、感染时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: RNA interference-mediated knockdown...; Results: TRIM14 expression affected proliferation |
| 体外增殖和凋亡检测 | CCK-8检测时间点(0,24,48,72小时)、细胞数(2×10^3/孔)、凋亡检测时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell Counting Kit-8 (CCK-8) proliferation and apoptosis assays |
| 动物实验 | 细胞系(HT-29)、细胞数(2×10^6)、动物品系(BALB/c nude mice)、周龄(4周)、每组数量(6)、观察时间(33天) 阅读提示:Materials and methods: Tumor xenograft model |
| 分子机制验证 | 抗体(TRIM14, PTEN, p-AKT等)、RT-qPCR引物序列、免疫荧光和免疫沉淀的条件 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis, Real-time PCR analysis, Immunofluorescence staining, Immunoprecipitation; Results: TRIM14 regulated PTEN/AKT signaling |