PFKP表达与功能分析
确定PFKP在GBM细胞中的表达及其对糖酵解和肿瘤生长的必要性
比较NHA和GBM细胞中PFK活性及PFK1亚型表达,敲低PFKP后测定葡萄糖消耗、乳酸产生和细胞增殖,并进行颅内移植瘤实验评估肿瘤生长。
Stabilization of phosphofructokinase 1 platelet isoform by AKT promotes tumorigenesis.
包含细胞实验、体外激酶实验、体内小鼠颅内移植瘤模型及临床标本分析等独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
人胶质母细胞瘤细胞系(U251、U87、U87/EGFRvIII等) 正常人类星形胶质细胞(NHA) 小鼠颅内异种移植模型(U87/EGFRvIII细胞) 人胶质母细胞瘤临床标本
PFKP在GBM细胞中是主要PFK1亚型,其表达与总PFK活性相关,需验证亚型敲低效果。 AKT磷酸化PFKP S386,阻断TRIM21介导的降解,需验证磷酸化突变对蛋白稳定性的影响。 TRIM21介导PFKP K10多聚泛素化,需验证E3连接酶活性及泛素化位点。 PFKP S386磷酸化促进体内肿瘤生长,需验证小鼠颅内移植瘤模型中的肿瘤体积和增殖标志物。 临床标本中PFKP S386磷酸化与不良预后相关,需验证免疫组化评分和生存分析。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定PFKP在GBM细胞中的表达及其对糖酵解和肿瘤生长的必要性
比较NHA和GBM细胞中PFK活性及PFK1亚型表达,敲低PFKP后测定葡萄糖消耗、乳酸产生和细胞增殖,并进行颅内移植瘤实验评估肿瘤生长。
验证EGFR/PI3K/AKT通路是否通过增强稳定性上调PFKP表达
EGF刺激细胞检测PFKP表达,使用CHX和蛋白酶体抑制剂处理,以及AKT抑制剂或AKT敲低,分析PFKP半衰期。
确定AKT是否结合并磷酸化PFKP,以及具体的磷酸化位点
通过免疫共沉淀和GST pull-down验证AKT与PFKP的直接结合;通过体外激酶实验和质谱鉴定磷酸化位点,并使用突变体确认S386。
确定TRIM21是否作为E3连接酶介导PFKP的泛素化和降解,并定位泛素化位点
免疫共沉淀验证TRIM21与PFKP的结合,体外泛素化实验检测TRIM21的活性,使用TRIM21敲低或缺失细胞分析PFKP稳定性,并鉴定泛素化位点K10。
验证PFKP S386磷酸化是否抑制TRIM21与PFKP的结合
体外结合实验和细胞内免疫共沉淀检测在AKT激活或抑制条件下TRIM21与PFKP的相互作用。
验证S386磷酸化对糖酵解、细胞增殖和肿瘤生长的影响
在PFKP敲低细胞中回补WT或突变体,检测PFK活性、丙酮酸激酶活性、乳酸产生、细胞增殖和颅内肿瘤生长。
评估PFKP S386磷酸化与GBM患者预后的关系
对65例人GBM标本进行免疫组化染色,分析AKT磷酸化、PFKP S386磷酸化、PFKP表达与PTEN水平和患者生存期的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | PFKP抗体(12746) | Cell Signaling Technology | 12746 |
| 磷酸化PFKP S386抗体 | Signalway Biotechnology | -- | |
| AKT抗体(9272) | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| PTEN抗体(9559) | Cell Signaling Technology | 9559 | |
| FLAG抗体(F3165) | Sigma | F3165 | |
| His抗体(H1029) | Sigma | H1029 | |
| HA抗体(H6908) | Sigma | H6908 | |
| 微管蛋白抗体(T6074) | Sigma | T6074 | |
| Ki67抗体(AB9260) | EMD Millipore | AB9260 | |
| 细胞因子 | 表皮生长因子(01-407) | EMD Millipore | 01-407 |
| 胰岛素样生长因子(GF306) | EMD Millipore | GF306 | |
| 成纤维细胞生长因子(GF003) | EMD Millipore | GF003 | |
| 抑制剂 | MG132(1211877-36-9) | Sigma | 1211877-36-9 |
| LY294002(L-7988) | LC Laboratories | L-7988 | |
| SP600125(S-7979) | LC Laboratories | S-7979 | |
| MK-2206(S1078) | Selleck Chemicals | S1078 | |
| 酶 | 活性GST-AKT1(A16-10G) | Signalchem | A16-10G |
| 重组蛋白 | 重组人TRIM21(pro-328) | BIOTREND Chemicals | pro-328 |
| 转染 | HyFect转染试剂(E2650) | Denville Scientific | E2650 |
| 试剂盒 | PFK活性比色测定试剂盒 | BioVision | -- |
| PK活性比色测定试剂盒 | BioVision | -- | |
| 葡萄糖测定试剂盒 | Sigma | -- | |
| 乳酸测定试剂盒 | Eton Bioscience | -- | |
| 培养基 | DMEM培养基 | -- | -- |
| DMEM/F-12 50/50培养基 | -- | -- | |
| 血清 | 牛血清 | HyClone | -- |
| 工具酶 | 牛小肠碱性磷酸酶(M0290) | New England Biolabs | M0290 |
| 抗体 | 正常兔免疫球蛋白(sc-2027) | Santa Cruz Biotechnology | sc-2027 |
| TRIM21抗体(sc-21367) | Santa Cruz Biotechnology | sc-21367 | |
| PFKM抗体(sc-67028) | Santa Cruz Biotechnology | sc-67028 | |
| c-Jun抗体(sc-822) | Santa Cruz Biotechnology | sc-822 | |
| GST抗体(sc-138) | Santa Cruz Biotechnology | sc-138 | |
| Myc抗体(sc-40) | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 | |
| PFKP抗体(ab137636) | Abcam | ab137636 | |
| TRIM21抗体(ab91423) | Abcam | ab91423 | |
| 抗生素 | 潮霉素(400053) | EMD Biosciences | 400053 |
| 嘌呤霉素(540222) | EMD Biosciences | 540222 | |
| G418(345810) | EMD Biosciences | 345810 | |
| 质粒提取 | QuikChange定点突变试剂盒 | Stratagene | -- |
| 蛋白质表达 | Bugbuster蛋白提取试剂 | EMD | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | EMD | -- | |
| Ni-NTA His结合树脂 | EMD | -- | |
| 质谱分析 | Obitrap-Elite质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Rapigest(质谱兼容表面活性剂) | Waters Corp. | -- | |
| 免疫组化 | VECTASTAIN Elite ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| 动物实验 | 通用封片剂 | Research Genetics | -- |
| 细胞培养 | B27补充剂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PFKP表达与功能分析 | 细胞系类型(NHA和GBM细胞系)、PFKP敲低效率、PFK活性测定方法、葡萄糖消耗和乳酸产生的测定条件 阅读提示:图1及结果部分:PFKP表达与功能分析;Methods:代谢测定 |
| AKT激活与PFKP稳定性 | EGF浓度和时间、CHX浓度、AKT抑制剂浓度(MK-2206、LY294002)、AKT敲低效率 阅读提示:图2及Results;Methods:细胞培养和处理 |
| AKT与PFKP相互作用及磷酸化 | 免疫沉淀条件、GST pull-down条件、体外激酶反应条件、质谱参数、磷酸化位点突变体的使用 阅读提示:图3及Methods:免疫沉淀和免疫印迹分析、质谱分析 |
| TRIM21介导的泛素化与降解 | TRIM21敲低或缺失细胞系、MG132浓度、泛素化实验条件(体外和体内)、泛素化位点突变体 阅读提示:图5及Methods:体外泛素化实验、体内泛素化实验 |
| 临床标本分析 | 标本数量(65例)、IHC评分标准、抗体浓度、生存分析统计方法 阅读提示:图7及Methods:IHC分析、统计方法 |