体外激酶实验和质谱分析验证c-Kit磷酸化PHB Y259
验证c-Kit是否能直接磷酸化PHB的Y259位点。
使用c-Kit激酶酶系统与重组PHB蛋白进行激酶反应,通过ADP-Glo检测磷酸化,并通过LC/MS/MS质谱分析确证磷酸化位点。
A novel c-Kit/phospho-prohibitin axis enhances ovarian cancer stemness and chemoresistance via Notch3-PBX1 and β-catenin-ABCG2 signaling.
包含体外激酶实验、细胞功能实验(迁移、集落、成球)、信号通路验证(Co-IP、降解实验)及体内异种移植模型和化疗耐药实验,多层次验证。
人卵巢癌细胞系SKOV3及转移亚系SKOV3GL-G4 人卵巢癌细胞系KURAMOCHI 裸鼠皮下移植瘤模型
c-Kit对PHB Y259的磷酸化(体外激酶实验) 膜筏域中c-Kit与PHB的共定位和正相关(人卵巢癌组织芯片) c-Kit/PHB轴对Notch3和β-catenin信号通路的影响(Western blot、Co-IP) raft-phospho-PHBY259对肿瘤起始和化疗耐药的影响(体内实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证c-Kit是否能直接磷酸化PHB的Y259位点。
使用c-Kit激酶酶系统与重组PHB蛋白进行激酶反应,通过ADP-Glo检测磷酸化,并通过LC/MS/MS质谱分析确证磷酸化位点。
探究c-Kit和PHB在人卵巢癌中的表达和共定位。
利用组织芯片(OV807和OV803b)进行荧光免疫组化,检测c-Kit和PHB的分布。
验证c-Kit是否在细胞中调控PHB的磷酸化及迁移能力。
通过过表达c-Kit(SKOV3_c-Kit)和抑制c-Kit(imatinib或siRNA)处理,检测PHB磷酸化和迁移能力。
获得具有不同转移潜能的卵巢癌细胞亚系。
将SKOV3GL细胞注入裸鼠卵巢,收集腹水分离细胞,反复传代获得G1-G4。
探究c-Kit/PHB轴是否激活Notch3和β-catenin信号通路。
通过过表达或敲低c-Kit、转染野生型或突变型PHB质粒,检测Notch3、PBX1、β-catenin和ABCG2的表达。
评估raft-phospho-PHBY259对卵巢癌细胞干性和化疗耐药的影响。
通过集落形成、成球实验和细胞活力实验(CCK-8)检测。
验证raft-phospho-PHBY259在体内对肿瘤形成和化疗耐药的作用。
将SKOV3GL-G4细胞注射裸鼠皮下,用carboplatin治疗,测量肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 伊马替尼甲磺酸盐 | Santa Cruz Biotechnology | sc-202,180 |
| 卡铂 | Selleckchem | S1215 | |
| 氯喹二磷酸盐 | Selleckchem | S4157 | |
| MG132 | MilliporeSigma | M7449 | |
| Western blot | c-Kit抗体(3074) | Cell Signaling Technology | 3074 |
| PHB抗体(GTX101105) | GeneTex | GTX101105 | |
| 磷酸化PHBY259抗体(11,587) | Signalway Antibody | 11,587 | |
| 磷酸化PHBT258抗体(11,588) | Signalway Antibody | 11,588 | |
| Notch3抗体(5276) | Cell Signaling Technology | 5276 | |
| β-catenin抗体(GTX101435) | GeneTex | GTX101435 | |
| ABCG2抗体(GTX100437) | GeneTex | GTX100437 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 22,400,089 |
| McCoy's 5A培养基 | Gibco | 16,600,082 | |
| 转染 | TransIT-X2转染试剂 | Mirus Bio | -- |
| 质粒构建 | QuikChange定点突变试剂盒 | Stratagene | -- |
| 体外激酶实验 | c-Kit激酶酶系统 | Promega | V4498 |
| ADP-Glo激酶检测试剂盒 | Promega | V9101 | |
| 重组PHB蛋白 | USBiological | 137,155 | |
| Western blot | Luminata Forte Western HRP底物 | Millipore | -- |
| RNA提取 | RNeasy小型试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 逆转录 | ToolsQuant II快速逆转录试剂盒 | Biotools | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green qPCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ABI Prism 7500快速检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 迁移实验 | Transwell聚碳酸酯膜插入物(8μm孔径) | Corning | -- |
| Liu's染色A和B试剂 | TonYar Biotech | -- | |
| 细胞活力 | CCK-8溶液 | Dojindo | -- |
| 酶标仪(BioTek ELx800) | BioTek | -- | |
| 集落形成 | 结晶紫 | Sigma-Aldrich | HT-90132 |
| 成球 | 超低吸附六孔板 | Corning | -- |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | 11,330,032 | |
| N2添加剂 | Gibco | 17,502,048 | |
| 人重组表皮生长因子 | eBioscience | BMS320 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | eBioscience | 68-8785-39 | |
| 免疫荧光 | 罗丹明标记的CKGGRAKDC肽 | Genemed Synthesis | -- |
| DAPI Fluoromount-G封片剂 | Southern Biotech | -- | |
| 共聚焦显微镜(Zeiss LSM 780 + ELYRA) | Carl Zeiss | -- | |
| 体内实验 | 基质胶 | BD Biosciences | 354,234 |
| IVIS成像系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外激酶实验 | c-Kit激酶结构域用量、PHB蛋白量、ATP浓度、反应时间 阅读提示:Methods: In vitro kinase assays |
| 细胞处理 | imatinib、carboplatin、cycloheximide、chloroquine、MG132的浓度和处理时间 阅读提示:Methods: Materials |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度 阅读提示:Methods: Cells and cell culture |
| 转染 | 转染试剂、质粒、转染时间 阅读提示:Methods: Plasmid constructs, reagents and transfection |
| 体内实验 | 小鼠品系、周龄、细胞注射数量、Matrigel比例、carboplatin剂量和给药方式、肿瘤测量时间 阅读提示:Methods: In vivo tumor initiation and chemoresistance assay |