Lys150对MITA铰链区GOFs活性的影响
验证Lys150是否为MITA铰链区GOFs激活所必需
在HEK293细胞中进行IFN-β启动子报告基因实验,并在Mita−/− MLFs中重建mMITAN153S及其K150N突变体,检测下游基因表达和细胞因子产生。
An additional site mutation in MITA/STING gain-of-function mutants abolishes the autoimmune SAVI phenotypes and directs a therapeutic strategy.
包含体外细胞实验(报告基因、免疫共沉淀)、体内小鼠模型(基因敲入、骨髓嵌合)、结构生物学(冷冻电镜)及治疗性肽干预,多层次验证。
Mita−/−小鼠肺成纤维细胞(MLFs) MITAN153S/WT小鼠 MITANS/NS小鼠 骨髓嵌合小鼠(MITAN153S/WT→WT) HEK293细胞
Lys150突变对MITA铰链区GOFs活性的影响 MITA铰链区GOFs与iRhom2的相互作用 ER-高尔基体转位是否发生 cGAMP诱导的MITA激活不受Lys150影响 SIP肽对MITA铰链区GOFs-iRhom2复合物的抑制效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Lys150是否为MITA铰链区GOFs激活所必需
在HEK293细胞中进行IFN-β启动子报告基因实验,并在Mita−/− MLFs中重建mMITAN153S及其K150N突变体,检测下游基因表达和细胞因子产生。
评估Lys150突变对MITA铰链区GOFs引起的体内自身免疫表型的影响
通过CRISPR/Cas9生成MITAN153S/WT和MITANS/NS敲入小鼠,分析存活率、脾重、组织病理、血清细胞因子和免疫细胞亚群。
确定MITANS是否仍能响应cGAMP并转位至高尔基体
在Mita−/− MLFs中重建FLAG标记的MITA、MITAK150N、MITAN153S或MITANS,用cGAMP处理,通过免疫荧光和RT-qPCR分析定位和下游基因表达。
解析apo-MITANS和cGAMP/MITANS的结构,揭示其构象变化
表达并纯化人MITANS,通过冷冻电镜获取apo-MITANS和cGAMP结合状态的结构。
确定iRhom2是否与MITA铰链区GOFs结合,并受Lys150影响
通过共转染和免疫共沉淀筛选MITA互作蛋白,比较不同突变体与iRhom2的结合强度。
验证iRhom2是否是MITA GOFs激活和SAVI进展所必需的
在iRhom2敲除的MLFs中检测MITA GOFs的定位和下游基因表达;通过骨髓嵌合小鼠评估iRhom2缺失对SAVI表型的影响。
开发选择性抑制MITA铰链区GOFs-iRhom2相互作用的肽,并评估其治疗效果
合成TAT融合肽(TAT-WT, TAT-SIP1/2等),在细胞和动物模型中评估其对MITA GOFs活性和SAVI表型的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 链霉素-青霉素 | -- | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | CHAMOT Biotechnology | #CM060-20 MP | |
| 药物处理 | 环状GMP-AMP | InvivoGen | #1441190-66-4 |
| 生物素标记的cGAMP | BIOLOG | C196 | |
| 蛋白表达与纯化 | SMM 293-TI表达培养基 | Sino Biological | -- |
| 十二烷基-β-D-麦芽糖苷 | -- | -- | |
| 胆固醇半琥珀酸酯 | -- | -- | |
| 4-(2-氨乙基)苯磺酰氟 | -- | -- | |
| 氯化钠 | -- | -- | |
| 氯化钙 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| Superdex 200 Increase 10/300 凝胶过滤柱 | Cytiva | -- | |
| 冷冻电镜制样 | Quantifoil R2/1 多孔碳支持膜 | -- | -- |
| Vitrobot Mark IV 冷冻制样仪 | Thermo Fisher | -- | |
| 冷冻电镜数据采集 | Titan Krios 透射电子显微镜 | Thermo Fisher | -- |
| GIF-Quantum 能量过滤器 | Gatan | -- | |
| K2 直接电子探测器 | Gatan | -- | |
| 分子克隆 | 聚乙烯亚胺转染试剂 | Poly Sciences | 24765-1 |
| RNA提取 | TRIzol 试剂 | Life Technologies | 15596026 |
| 氯仿 | -- | -- | |
| 异丙醇 | -- | -- | |
| RT-qPCR | All-in-One cDNA合成预混液 | Aidlab Biotechnologies | -- |
| Hieff® qPCR SYBR Green 预混液 | Yeasen Biotechnology | 11201ES08 | |
| ELISA | LEGENDplex™ 多因子流式检测试剂盒小鼠抗病毒反应组(13因子) | BioLegend | 740622 |
| 免疫印迹 | 抗MITA抗体 | Cell Signaling Technology | #13647 |
| 抗MITA抗体 | ABclonal | A3575 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F3165 | |
| 抗HA抗体 | ABclonal | AE105 | |
| 抗Tubulin抗体 | ABclonal | A12289 | |
| 抗RHBDF2(iRhom2)抗体 | Abcepta | #AP13588A | |
| 免疫荧光 | 抗GOLGA2/GM130抗体 | Proteintech | 11308-1-AP |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD19-APC抗体 | BioLegend | 152409 |
| 抗小鼠CD3-FITC抗体 | BioLegend | 100306 | |
| 抗小鼠CD3-APC抗体 | BioLegend | 100312 | |
| 抗小鼠FAS-PE抗体 | BioLegend | 152608 | |
| 抗小鼠GL7-Percp抗体 | BioLegend | 144610 | |
| 抗小鼠CD11b-PE抗体 | BioLegend | 101208 | |
| 抗小鼠CD11c-Percp抗体 | BioLegend | 117328 | |
| 抗小鼠F4/80-BV421抗体 | BioLegend | 123137 | |
| 抗小鼠Ly6G-Apc-Cy7抗体 | BioLegend | 127624 | |
| 抗小鼠CD4-FITC抗体 | BioLegend | 100406 | |
| 抗小鼠CD8-BV510抗体 | BioLegend | 100751 | |
| 抗小鼠CD62L-Percp抗体 | BioLegend | 104432 | |
| 抗小鼠IFNγ-Percp抗体 | BioLegend | 505822 | |
| 抗小鼠GzmB-PE抗体 | BioLegend | 372208 | |
| 抗小鼠CD4-BV421抗体 | BioLegend | 100427 | |
| 抗小鼠Sca-1-APC抗体 | BioLegend | 108111 | |
| 抗小鼠谱系生物素抗体 | BD Biosciences | 559971 | |
| 链霉亲和素-APC-Cy7 | BD Biosciences | 554063 | |
| 抗c-Kit-PE抗体 | BioLegend | 105807 | |
| 细胞计数试剂盒-8(CCK-8) | TargetMbl | C0005 | |
| 细胞处理 | 二甲基亚砜 | Sigma | #D8418 |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma | P8139 | |
| 离子霉素 | Sigma | I0634 | |
| 高尔基体转运抑制剂 | BD Biosciences | 554724 | |
| 免疫共沉淀 | Nonidet P-40裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | APExBIO | K1015 | |
| 蛋白G琼脂糖 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | VECTASHIELD® 抗荧光淬灭封片剂(含DAPI) | Vector | H-1200 |
| 流式细胞术 | FACS Celesta 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| LSR FortessaX20 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 组织染色 | Aperio VERSA 8 多功能扫描仪 | Leica | -- |
| 免疫荧光 | Zeiss LSM880 荧光显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞实验 | Mita−/− MLFs的分离和培养条件;慢病毒转导效率;cGAMP处理浓度和时间 阅读提示:Cell culture 和 Lentivirus-mediated gene transfer 部分 |
| 动物实验 | 小鼠品系、基因型、年龄匹配;骨髓移植的照射剂量和细胞数量;SIP肽的给药剂量和方案 阅读提示:Mice 和 Bone marrow transfer 部分 |
| 生化实验 | 免疫共沉淀的抗体和裂解液;cGAMP结合实验的生物素化cGAMP浓度 阅读提示:Coimmunoprecipitation and immunoblotting 和 cGAMP binding ability analysis 部分 |
| 结构生物学 | 蛋白表达系统、纯化缓冲液、冷冻电镜样品制备参数 阅读提示:Protein expression and purification 和 Cryo-EM sample preparation and data collection 部分 |