新型EGFR抗体的筛选与亲和力成熟
从噬菌体展示文库中筛选出能结合EGFR ECD且具有中和活性的抗体,并通过亲和力成熟提高其结合亲和力。
使用人源抗体噬菌体展示文库,以EGFR胞外区域为靶标进行筛选。通过VL链改组进行亲和力成熟,获得A02和H10两个改进的抗体。
Novel bispecific T-cell engagers overcoming acquired EGFR resistance.
包含抗体筛选与表征、表位定位、体外细胞功能验证、T细胞杀伤实验及体内同基因小鼠模型等多个独立验证层级,并有明确的功能和机制验证。
NIH-3T3细胞(表达野生型或突变型EGFR) CT-26同基因小鼠肿瘤模型(表达人EGFR) 癌症细胞系(如FaDu、DiFi、HCT-116等)
抗体对EGFR ECD逃逸突变体(S492R、G465R等)的结合能力 TCE介导的T细胞杀伤活性(效靶比10:1) 体内实验中TCE的给药剂量(H10-sTCE1+1:25、2.5、0.25 μg;H10-sTCE2+1:30、3、0.3 μg) EGFR表达水平不同的细胞系中的杀伤效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从噬菌体展示文库中筛选出能结合EGFR ECD且具有中和活性的抗体,并通过亲和力成熟提高其结合亲和力。
使用人源抗体噬菌体展示文库,以EGFR胞外区域为靶标进行筛选。通过VL链改组进行亲和力成熟,获得A02和H10两个改进的抗体。
评估新型抗体对野生型和突变型EGFR的结合能力,并确定其结合表位是否与已批准的抗体不同。
通过ELISA、生物层干涉测量法(BLI)分析抗体的亲和力。构建EGFR ECD III突变体,通过ELISA检测抗体结合。进行表位作图、AlphaFold3结构预测和HADDOCK分子对接。
验证新型抗体能否抑制EGFR及其下游信号通路的磷酸化以及肿瘤细胞增殖。
在多种表达不同水平野生型EGFR的细胞系(LIM1215、FaDu、A431、DiFi)中,通过Western blot检测EGFR和ERK的磷酸化水平,并通过CellTiter-Glo实验检测细胞增殖。
建立稳定表达野生型或突变型EGFR的细胞模型,用于评估新型抗体和TCE对耐药突变体的活性。
通过逆转录病毒转导建立稳定表达野生型EGFR、EGFR-G465R或EGFR-S492R的NIH-3T3和CT-26细胞系,并通过Western blot和流式细胞术验证表达。
生成基于新型抗体的EGFR×CD3 TCE,并评估其介导T细胞杀伤表达野生型或突变EGFR的肿瘤细胞的能力。
使用eIg平台生成1+1和2+1格式的TCE。通过流式细胞术检测TCE与CD3和EGFR的结合。在体外细胞毒性实验中,以人PBMC为效应细胞,评估TCE对多种肿瘤细胞系的杀伤活性。
在体内模型中验证基于H10的TCE是否能抑制肿瘤生长。
使用表达人野生型EGFR的CT-26细胞建立BALB/c小鼠同基因肿瘤模型。分别使用H10-sTCE1+1和H10-sTCE2+1进行治疗,评估肿瘤生长抑制效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 表皮生长因子 | PeproTech | #100-15 |
| 肝素结合表皮生长因子样生长因子 | Sino Biological | #10325-HNAB | |
| 抗体检测 | HRP偶联抗人Fab抗体 | Sigma-Aldrich | #A0293 |
| HRP偶联抗人Fc抗体 | Sigma-Aldrich | #A0170 | |
| 流式细胞术 | R-PE偶联抗人Fc抗体 | Jackson ImmunoResearch | #109-115-098 |
| 抗EGFR抗体(克隆AY13) | BioLegend | #352902 | |
| FITC偶联抗小鼠IgG抗体 | Agilent | #D0479 | |
| Western blot | 抗EGFR抗体 | Santa Cruz | #sc-03 |
| 抗pEGFR Y1068抗体 | Cell Signaling | #3777 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling | #9107 | |
| 抗pERK T202/Y204抗体 | Cell Signaling | #9101 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | #05-829 | |
| HRP偶联抗兔IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch | #111-035-144 | |
| HRP偶联抗小鼠IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch | #115-035-062 | |
| 细胞分离 | 淋巴细胞分离液1077 | Promocell | C-44010 |
| 分子生物学 | 定点诱变试剂盒 | New England Biolabs | #E0554S |
| 蛋白纯化 | 蛋白A树脂 | Cytiva | #17-1279-03 |
| CH1-XL树脂 | Thermo Scientific | #1943462010 | |
| Ni-NTA树脂 | Macherey-Nagel | 745,400.100 | |
| 抗体噬菌体展示 | M-280磁珠 | Thermo Scientific | #11206D |
| 抗体结合分析 | FAB2G传感器 | ForteBio | -- |
| 生物层干涉测量法 | Octet QKe系统 | ForteBio | -- |
| 流式细胞术 | MACSQuant VYB | Miltenyi Biotec | -- |
| 细胞分选 | FACSAria III细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞增殖检测 | CellTiter-Glo 2.0试剂 | Promega | -- |
| PBMC分离 | Ficoll密度梯度离心 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD3抗体(FITC) | Miltenyi Biotec | #130-119-758 |
| 抗小鼠CD4抗体 | Miltenyi Biotec | #130-118-568 | |
| 抗小鼠CD8抗体 | Miltenyi Biotec | #130-123-781 | |
| 抗小鼠CD69抗体 | Miltenyi Biotec | #130-115-461 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Sigma Aldrich | -- |
| 抗体结合分析 | 重组小鼠EGFR(His标签) | Sino Biological | #1091-M08H |
| 重组食蟹猴EGFR(His标签) | Sino Biological | #90285-C08H |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体筛选与亲和力成熟 | 噬菌体展示文库的多样性;生物淘选策略(抗原浓度、孵育时间);亲和力成熟方法 阅读提示:Methods: Library generation, Antibody-phage selection and antibody characterization |
| 抗体结合与功能验证 | ELISA中EGFR ECD的包被浓度;BLI实验的抗原浓度范围;细胞增殖实验中IgG的浓度(10或100 nM)及刺激配体浓度 阅读提示:Methods: ELISA, Determination of KD using BLI, Inhibition of cell proliferation |
| 表位作图与结构分析 | ECD III突变体的具体氨基酸替换;HADDOCK docking参数(活性残基定义) 阅读提示:Methods: Structure prediction and docking; Figure 2 |
| TCE的构建与体外杀伤实验 | TCE格式(1+1和2+1);效应细胞(人PBMC)与靶细胞的效靶比(10:1);共培养时间 阅读提示:Methods: In vitro cytotoxicity assay of TCEs; Figure 4, 5 |
| 体内抗肿瘤实验 | CT-26 EGFRwt细胞接种数量(1×10^6);给药剂量和频率;治疗开始的肿瘤体积(~100 mm³) 阅读提示:Methods: In vivo tumor model; Figure 6 |