体外验证HMGB1/TLR4在肝细胞炎症和纤维化中的作用
评估HMGB1是否通过TLR4激活诱导肝细胞炎症和纤维化。
原代肝细胞用HMGB1处理,并与JS-1细胞共培养,用ELISA检测炎症因子,用Western blot检测纤维化标志物;使用TLR4抑制剂TAK-242验证TLR4的介导作用。
CRISPLD2 protects against liver inflammation and fibrosis via GRP78 to repress HMGB1/TLR4 axis-mediated STING palmitoylation.
包含体外细胞共培养、分子互作机制验证、体内CCl4小鼠模型及人肝样本分析等多个独立证据层级,并进行功能获得与缺失验证。
原代小鼠肝细胞 JS-1细胞 HEK293T细胞 CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 人肝组织样本(非纤维化与纤维化)
HMGB1处理浓度5 μg/mL CRISPLD2处理浓度1、5、10、20 μg/mL TAK-242(TLR4抑制剂)浓度10 nM CCl4诱导肝纤维化小鼠模型(0.5 mL/g腹腔注射,每周两次,共5周) CRISPLD2重组蛋白体内给药剂量(100 ng/g,静脉注射,每周三次,共5周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HMGB1是否通过TLR4激活诱导肝细胞炎症和纤维化。
原代肝细胞用HMGB1处理,并与JS-1细胞共培养,用ELISA检测炎症因子,用Western blot检测纤维化标志物;使用TLR4抑制剂TAK-242验证TLR4的介导作用。
探究HMGB1/TLR4轴是否通过STING棕榈酰化介导炎症和纤维化,并验证C64位点的关键作用。
通过ABE和Acyl-RAC实验测定STING棕榈酰化水平;用2-BP和palmostatin B处理调节棕榈酰化;在HEK293T细胞中过表达STING-WT或STING-C64A;在原代肝细胞中敲低STING并回补STING-WT或STING-C64A,检测炎症因子和纤维化标志物。
确定CRISPLD2是否能阻止HMGB1/TLR4轴介导的STING棕榈酰化及随后的炎症和纤维化。
用HMGB1和不同浓度CRISPLD2处理原代肝细胞,与JS-1细胞共培养,检测炎症因子和纤维化标志物,并通过ABE测定STING棕榈酰化。
阐明CRISPLD2下调TLR4蛋白的机制。
用CRISPLD2处理原代肝细胞,结合CQ或MG132处理,检测TLR4蛋白水平;检测自噬相关蛋白ATG7、LC3、p62;通过Co-IP检测TLR4与LC3/p62的相互作用。
探究CRISPLD2是否通过招募GRP78促进TLR4降解。
用CRISPLD2和/或HMGB1处理原代肝细胞,通过Co-IP、生物素pull-down、GST pull-down和免疫荧光检测CRISPLD2与GRP78的相互作用、GRP78的膜转位及与TLR4的关联。
确认GRP78敲低是否能阻断CRISPLD2的保护作用。
在原代肝细胞中敲低GRP78,用CRISPLD2处理,检测TLR4、自噬相关蛋白、STING棕榈酰化、炎症因子和纤维化标志物。
评估CRISPLD2在动物模型中对肝脏炎症和纤维化的治疗效果。
C57BL/6J小鼠腹腔注射CCl4诱导肝纤维化,同时静脉注射CRISPLD2重组蛋白,检测肝功能、组织病理、炎症因子、纤维化标志物、STING棕榈酰化及关键蛋白共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞处理 | 重组小鼠HMGB1蛋白 | Sino Biological | 50913-M01H |
| 重组小鼠CRISPLD2蛋白 | Cusabio | CSB-YP805372MO | |
| 重组小鼠IgG3蛋白 | Sino Biological | 51096-MNAH | |
| 药物处理 | TAK-242 | MCE | HY-11109 |
| 2-溴棕榈酸酯 | MCE | HY-111770 | |
| Palmostatin B | MCE | HY-120911 | |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| 氯喹 | MCE | HY-17589A | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot分析 | 蛋白提取试剂盒 | KeyGEN | KGB5303 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGEN | KGB2101 | |
| New Super ECL检测试剂盒 | KeyGEN | KGC4602 | |
| 蛋白质印迹抗体 | 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 |
| 抗FN抗体 | Abcam | ab2413 | |
| 抗col1a1抗体 | Abcam | ab279711 | |
| 抗CRISPLD2抗体 | Biorbyt | orb478011 | |
| 抗TLR4抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-16216 | |
| 抗ATG3抗体 | Thermo Fisher Scientific | 720056 | |
| 抗ATG7抗体 | Abcam | ab133528 | |
| 抗ATG12抗体 | Abcam | ab155589 | |
| 抗ATG16L1抗体 | Abcam | ab233796 | |
| 抗LC3抗体 | Abcam | ab192890 | |
| 抗p62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗STING抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-83404 | |
| 抗GRP78抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-27686 | |
| 抗PCNA抗体 | Abcam | ab29 | |
| 抗Calnexin抗体 | Abcam | ab22595 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab6276 | |
| 山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Abcam | ab205719 | |
| Acyl-RAC分析 | 巯基丙基琼脂糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| ABE分析 | 抗STING抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA562089 |
| Co-IP分析 | 膜和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0033 |
| 抗LC3抗体 | Abcam | ab229327 | |
| 抗p62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗TLR4抗体 | Thermo Fisher Scientific | 48-2300 | |
| 抗GRP78抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-85169 | |
| 邻近连接分析 | Duolink邻近连接检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | DUO92007 |
| 组织病理学 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 天狼星红染色试剂盒 | Solarbio | G1472 | |
| ELISA分析 | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0007 |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0002 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0034 | |
| 仪器设备 | 自动生化分析仪 | Sysmex | BX-3010 |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 激光共聚焦显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 光学显微镜 | Olympus | -- | |
| 试剂 | 嘌呤霉素 | MCE | -- |
| 分子实验 | 异丙基-β-D-1-硫代半乳糖苷 | 文中未明确说明 | -- |
| pGEX-4T-1载体 | 文中未明确说明 | -- | |
| 谷胱甘肽磁珠 | 文中未明确说明 | -- | |
| 抗GST标签磁珠 | 文中未明确说明 | -- | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488) | Abcam | ab150077 |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (Cy5) | Abcam | ab6563 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 原代肝细胞来源(C57BL/6J小鼠,8周龄);HMGB1浓度5 μg/mL;处理时间3-48小时;CRISPLD2浓度1-20 μg/mL;TAK-242浓度10 nM;2-BP浓度100 μM;palmostatin B浓度10 μM;MG132浓度20 μM;CQ浓度10 mM 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| 细胞转染 | HEK293T细胞密度(5×10^5细胞/孔);Lipofectamine 2000使用;慢病毒感染复数MOI 30;嘌呤霉素筛选浓度2 μg/mL 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| ABE和Acyl-RAC实验 | NEM封闭游离巯基;羟胺浓度(2 M);Biotin-BMCC加入;ABE中抗STING抗体(MA562089) 阅读提示:Methods: Acyl-resin-assisted capture (Acyl-RAC) 和 Acyl-biotin exchange (ABE) |
| 分子互作实验 | Co-IP中抗体(LC3、p62、TLR4、GRP78);生物素pull-down中生物素标记CRISPLD2;GST pull-down中GST-GRP78蛋白 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP), Biotin pull-down assay, GST pull-down assay |
| 动物实验 | 小鼠品系C57BL/6J,8周龄;CCl4剂量0.5 mL/g,腹腔注射,每周两次,共5周;CRISPLD2剂量100 ng/g,静脉注射,每周三次,共5周;分组(sham、CCl4、CCl4+CRISPLD2等)每组6只 阅读提示:Methods: Animal model |
| 组织病理 | 切片厚度4 μm;HE、Masson、Sirius Red染色试剂盒;炎症半定量评分0-3 阅读提示:Methods: Histopathological examination |
| 统计分析 | 学生t检验(两组)或单因素方差分析(三组及以上),p<0.05为显著 阅读提示:Methods: Statistical analysis |