构建WNT报告系统
标记和追踪WNT-S和WNT-R细胞亚群
在KPC细胞中敲入Porcn-DMA报告基因(DTR-mScarlet-AkaLuc)和7TCF荧光报告基因,用于标记WNT-S和WNT-R细胞。
Disruption of WNT/Notch signaling in pancreatic cancer reveals tumors depend on the intricate equilibrium of malignant cell states.
包含体外细胞系报告系统、原位同种移植瘤模型、遗传工程小鼠模型、谱系追踪、细胞消融、遗传扰动、数学建模及人类样本验证,且包括功能验证和机制验证。
KPC基因工程小鼠模型 原位同种移植瘤模型 KPC4662细胞系 患者组织样本
WNT-S细胞消融(DT处理)对WNT-R细胞比例的影响 Porcn基因敲除或过表达对肿瘤生长的影响 Dll1或Nrarp敲低对WNT-R和WNT-S细胞比例的影响 Notch信号抑制(LY-411575或DAPT)对细胞状态的影响 人类PDAC组织中PORCN+和LGR5+细胞的共定位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
标记和追踪WNT-S和WNT-R细胞亚群
在KPC细胞中敲入Porcn-DMA报告基因(DTR-mScarlet-AkaLuc)和7TCF荧光报告基因,用于标记WNT-S和WNT-R细胞。
追踪WNT-R和WNT-S细胞的分化方向
使用7TCF-CreER或Porcn-DMAC系统,通过他莫昔芬诱导标记WNT-R或WNT-S细胞,观察其命运。
验证WNT-S细胞对肿瘤生长的必要性
通过白喉毒素(DT)消融WNT-S细胞,或通过shRNA敲低/CRISPRa过表达Porcn,评估对肿瘤生长和转移的影响。
验证Notch信号在维持WNT-R状态中的作用
通过shRNA敲低Dll1或Nrarp,或使用γ-分泌酶抑制剂(LY-411575或DAPT),观察对细胞状态和肿瘤生长的影响。
验证小鼠模型的发现是否保守于人类
通过免疫组化、RNA原位杂交和scRNA-seq分析人类PDAC样本,检测PORCN、LGR5、DLL1和NRARP的表达模式。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco | 11875119 |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634028 | |
| 胎牛血清 | Hyclone | SH30910.03 | |
| 3D肿瘤球培养 | 基质胶 | Fisher Scientific | CB-40230C |
| 细胞消融 | 白喉毒素 | Millipore Sigma | D2189 |
| 药物处理 | LGK974 | -- | -- |
| Notch抑制 | DAPT | Millipore Sigma | D5942 |
| LY-411575 | Millipore Sigma | SML0506 | |
| WNT刺激 | 重组小鼠Wnt3a | R&D Systems | 1324-WN |
| 重组小鼠R-spondin-1 | SinoBiological | 50316-M08 | |
| 流式分析 | CD16/CD32抗体 | BD Biosciences | 553142 |
| 免疫组化 | PORCN抗体 | Abcam | ab201793 |
| 免疫荧光 | Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-5698-82 |
| RNA提取 | RNeasy Plus Micro试剂盒 | Qiagen | 74034 |
| qPCR | PowerUP SYBR混合液 | Applied Biosystems | A25778 |
| RNA原位杂交 | RNAscope 2.5 HD检测试剂盒 | ACD | 322360 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| WNT-S细胞消融 | DT给药剂量和频率,肿瘤起始时间 阅读提示:STAR Methods,Ablation of WNT-S cells |
| Porcn功能研究 | shRNA或CRISPRa的敲低/过表达效率,体内诱导时间 阅读提示:STAR Methods,Gene knockdown in vivo, Gene overexpression in vivo |
| 谱系追踪 | 他莫昔芬剂量和给药方式,标记时间窗口 阅读提示:STAR Methods,Lineage-tracing |
| Notch通路抑制 | DAPT或LY-411575的浓度和给药方案 阅读提示:STAR Methods,In vitro Notch pathway inhibition, In vivo Notch pathway inhibition |
| 人类样本 | 组织微阵列的构建和染色评分标准 阅读提示:STAR Methods,Immunohistochemistry |