临床样本和数据库分析
评估白癜风皮损组织中铁死亡相关标志物和信号通路的激活情况。
分析GSE65127和GSE80009数据集,进行KEGG富集分析;通过免疫组化检测HSP70、GPX4、FSP1、TLR2在皮损和正常皮肤中的表达,并通过免疫荧光检测GPX4与MITF共定位。
Heat shock protein 70/toll-like receptor 2 orchestrates melanocyte ferroptosis in the onset of vitiligo
体外细胞实验为主,包括基因敲低/过表达、信号通路抑制剂和组学分析,但缺乏体内动物模型验证。
正常人表皮黑素细胞 白斑周缘皮肤组织样本 GSE65127和GSE80009微阵列数据集
HSP70处理NHEM的浓度(0, 0.5, 1, 5 μg/ml)和时间(72小时) TLR2敲低或过表达对铁死亡标志物(GPX4、SLC7A11、FSP1)的影响 MAPK通路抑制剂(SB203580和U0126)的浓度(5 μM)和预处理时间(2小时) 临床皮肤样本的样本量(每组5例)和来源(白斑周缘及正常皮肤)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估白癜风皮损组织中铁死亡相关标志物和信号通路的激活情况。
分析GSE65127和GSE80009数据集,进行KEGG富集分析;通过免疫组化检测HSP70、GPX4、FSP1、TLR2在皮损和正常皮肤中的表达,并通过免疫荧光检测GPX4与MITF共定位。
验证HSP70是否直接诱导黑素细胞铁死亡。
使用不同浓度HSP70处理NHEM 72小时,检测细胞形态、铁死亡相关基因和蛋白表达、ROS、脂质过氧化、Fe2+浓度、线粒体超微结构,以及凋亡水平。
确定介导HSP70诱导铁死亡的主要受体。
检测HSP70处理对多种受体表达的影响,通过慢病毒介导的基因敲低筛选关键受体,并验证TLR2敲低/过表达对铁死亡的影响。
确认TLR2在HSP70诱导铁死亡中的必要性。
通过TLR2敲低或过表达,检测HSP70处理下铁死亡标志物(GPX4、SLC7A11、FSP1)蛋白表达和Fe2+浓度的变化。
阐明HSP70-TLR2轴下游的MAPK信号通路在铁死亡中的作用。
通过RNA测序和蛋白质谱分析MAPK通路变化,Western blot检测ERK1/2、p38和JNK磷酸化,使用SB203580(p38抑制剂)和U0126(ERK1/2抑制剂)处理,评估对铁死亡的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 分散酶 | Roche | -- |
| 胰蛋白酶-EDTA溶液 | -- | -- | |
| 70μm细胞筛网 | BD Falcon | -- | |
| 黑素细胞培养基(2201) | ScienCell | -- | |
| 药物处理 | HSP70蛋白 | Sino Biological | 11660-H07B |
| 信号通路抑制 | SB203580(p38抑制剂) | Sigma | -- |
| U0126(ERK1/2抑制剂) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 免疫组化 | 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 |
| 抗FSP1抗体 | Proteintech | 20886-1-AP | |
| 抗HSP70抗体 | Proteintech | 10995-1-AP | |
| 抗TLR2抗体 | Proteintech | 66645-1-lg | |
| 免疫荧光 | 抗MITF抗体 | Abcam | ab303530 |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 蛋白提取 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013B |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 无蛋白快速封闭液 | EpiZyme | -- | |
| 抗ACSL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| 抗TfR抗体 | Abcam | ab214039 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Abcam | ab184699 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Abcam | ab201015 | |
| 抗TLR2抗体 | Cell Signaling Technology | 12276 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Proteintech | 26864-1-AP | |
| 抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | 9211 | |
| 抗CD91抗体 | Abcam | ab92544 | |
| 抗FEEL-1抗体 | biorbyt | orb100187 | |
| 抗SRA1抗体 | Proteintech | 24655-1-AP | |
| 抗SREC-1抗体 | Proteintech | 13702-1-AP | |
| 抗CD40抗体 | Proteintech | 28158-1-AP | |
| 抗TLR4抗体 | Proteintech | 19811-1-AP | |
| 抗CD36抗体 | Proteintech | 18836-1-AP | |
| 抗CD14抗体 | Cell Signaling Technology | 56082 | |
| 抗LOX-1抗体 | Abcam | ab317689 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| HRP标记二抗 | Beyotime | A0208 | |
| P-ECL化学发光试剂盒 | EpiZyme | -- | |
| LAS-3000发光图像分析仪 | Fujifilm | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| Hifair II逆转录试剂盒 | Yeasen Biotech | 11139ES10 | |
| Hieff Universal Blue qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen Biotech | 11184ES03 | |
| Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA测序 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| 无RNase的DNase试剂盒 | Qiagen | 79254 | |
| TruSeq RNA样本制备试剂盒v2 | Illumina | -- | |
| Illumina HiSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM减血清培养基 | Invitrogen | -- | |
| 慢病毒包装 | pGMLV-SC5慢病毒载体 | Genomeditech | -- |
| PGMLV-CMV-EF1-ZsGreen1-T2A-Puro质粒 | Genomeditech | -- | |
| 慢病毒浓缩液 | Yisheng | -- | |
| 细胞培养 | 角质形成细胞生长培养基2 | PromoCell | 20011 |
| 铁浓度检测 | FerroOrange荧光探针 | Dojindo Laboratories | -- |
| 脂质过氧化检测 | Liperfluo荧光探针 | Dojindo Laboratories | -- |
| 凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒(含PI) | BioLegend | 640914 |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Beyotime | -- |
| 流式分析 | BD FACS Canton流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 电镜样本制备 | Eponate 12包埋试剂盒 | Ted Pella | 18010 |
| 电镜观察 | 透射电子显微镜(Talos L120C) | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和HSP70处理 | NHEM来源(3个供体)、HSP70浓度(0, 0.5, 1, 5 μg/ml)和处理时间(72小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and treatment; Figure 2 legend |
| 受体敲低和过表达 | 慢病毒载体和shRNA序列(见补充表S1)、TLR2敲低或过表达效率 阅读提示:Materials and Methods: Lentivirus packaging and transduction; Supplementary Table S1 |
| MAPK通路抑制 | SB203580浓度(5 μM)、U0126浓度(5 μM)和预处理时间(2小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and treatment; Figure 6 legend |
| 临床样本分析 | 样本类型(白斑周缘皮肤和正常皮肤,每组5例) 阅读提示:Materials and Methods: Immunohistochemical staining; Figure 1 legend |