临床样本分析
评估TREM2/sTREM2在卵巢癌患者中的表达与临床相关性
通过单细胞RNA测序、流式细胞术和ELISA检测患者样本中TREM2表达和sTREM2水平,并分析与腹水体积及预后的关系。
Soluble TREM2 engages cell-surface nucleolin to drive vascular permeability and malignant ascites in ovarian cancer.
包含患者样本分析、体外细胞模型、体内小鼠模型及机制验证(pull-down/质谱、敲低、抑制剂、抗体中和)。
患者腹水及卵巢组织样本 HUVEC和C166内皮细胞 Trem2fl/flLyz2Cre小鼠 ID8卵巢癌小鼠模型
sTREM2水平在恶性腹水中升高且与腹水量正相关 NCL作为sTREM2在内皮细胞上的受体 sTREM2激活AKT/eNOS通路 eNOS抑制剂L-NAME阻断sTREM2效应 抗sTREM2 scFv降低腹水和肿瘤负荷
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TREM2/sTREM2在卵巢癌患者中的表达与临床相关性
通过单细胞RNA测序、流式细胞术和ELISA检测患者样本中TREM2表达和sTREM2水平,并分析与腹水体积及预后的关系。
验证sTREM2对内皮细胞屏障完整性的直接影响
使用Transwell通透性实验、RTCA实时监测、Western blot和免疫荧光检测sTREM2处理后内皮细胞的通透性和VE-钙黏蛋白磷酸化。
鉴定内皮细胞上sTREM2的功能性受体
通过pull-down联合质谱鉴定NCL,并通过生物层干涉、共免疫沉淀、敲低和截短突变体验证其功能。
阐明sTREM2介导通透性的分子机制
RNA测序筛选通路,Western blot验证AKT/eNOS磷酸化,使用抑制剂验证其功能。
验证sTREM2在体内对血管通透性的影响
通过尾静脉注射TRITC-dextran,腹腔灌洗检测荧光强度,评估sTREM2及其抑制剂对血管通透性的影响。
评估sTREM2在卵巢癌腹水形成中的作用
使用ID8细胞腹腔注射建立小鼠模型,分别联合sTREM2、TREM2过表达/敲低巨噬细胞或抗sTREM2 scFv治疗,测量腹水体积和肿瘤负荷。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | ScienCell | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | -- | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Solarbio | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000-015 |
| Lipofectamine LTX与Plus试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15338100 | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778030 | |
| Western blot | Western及免疫沉淀裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Solarbio | -- |
| Triton X-100 | Solarbio | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | -- | |
| 抗磷酸化VE-钙黏蛋白(Tyr658)抗体 | Thermo Fisher | 44-1144 G | |
| DyLight 488标记的山羊抗兔二抗 | Abbkine | A23220 | |
| DyLight 649标记的山羊抗兔二抗 | Abbkine | A23620 | |
| 抗CD68抗体 | CST | 76437 | |
| 抗TREM2抗体 | Abcam | ab223684 | |
| 抗CD31抗体 | R&D Systems | AF3628 | |
| 驴抗兔IgG DyLight 488 | Boster | BA1146 | |
| 兔抗山羊IgG DyLight 649 | Abbkine | A23630 | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD可固定近红外活性染料 | Thermo Fisher | L34982 |
| 抗人CD45-BV605抗体 | BioLegend | 304042 | |
| 抗人CD68-PE抗体 | BioLegend | 333808 | |
| 抗人TREM2-APC抗体 | R&D Systems | FAB17291A | |
| 抗人CD45-FITC抗体 | BioLegend | 304006 | |
| 抗人CD45-BV711抗体 | BioLegend | 304049 | |
| 抗人CD14-PE抗体 | BioLegend | 325606 | |
| ELISA | 人TREM2 ELISA试剂盒 | Abcam | ab224881 |
| 人TREM2 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK1226-96 | |
| 小鼠TREM2 ELISA试剂盒 | Jonlnbio | JL20435-96T | |
| Pull-down | Pierce™链霉亲和素琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | 20347 |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 通透性实验 | TRITC-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | T1162 |
| 药物处理 | L-NAME | Selleck | S2877-100mg |
| MK2206 | Proteintech | CM00917-1MG | |
| Western blot | 抗磷酸化VE-钙黏蛋白(Tyr658)抗体 | Thermo Fisher | 44-1144 G |
| 抗VE-钙黏蛋白抗体 | Santa Cruz | (F-8): sc-9989 | |
| 抗核仁素抗体 | CST | 14574S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | CST | 4970S | |
| 抗ATP1A1抗体 | Thermo Fisher | MA3-928 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Affinity | AF5161-50 | |
| 免疫沉淀 | 抗生物素抗体 | CST | 7075S |
| 抗兔IgG抗体 | CST | 3900S | |
| 抗小鼠IgG抗体 | CST | 5415S | |
| 抗Flag标签抗体(兔) | Proteintech | 20543-1-AP | |
| 抗Flag标签抗体(小鼠) | ABclonal | AE005 | |
| Western blot | 抗eNOS抗体 | CST | 32027 T |
| 抗磷酸化eNOS(Ser1177)抗体 | CST | 9570S | |
| 抗AKT抗体 | CST | 4691 s | |
| 抗磷酸化AKT(Ser473)抗体 | CST | 4046 s | |
| 抗TREM2抗体 | Thermo Fisher | PA5119690 | |
| 抗HA标签抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗TREM2抗体 | R&D Systems | AF1729 | |
| 重组蛋白 | 人sTREM2-His重组蛋白 | Sino Biological | 11084-H08H |
| 小鼠sTREM2-His重组蛋白 | Sino Biological | 50149-M08H | |
| 生物素化人sTREM2-His重组蛋白 | Sino Biological | 11084-H49H-B | |
| 人核仁素重组蛋白 | OriGene | TP319082 | |
| 抗体 | 抗sTREM2单链抗体-His | Kairui Biotech | WO2020123664A |
| 重组蛋白 | 小鼠sTREM2-Flag重组蛋白 | Tsingke | UniProtKB Q99NH8 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者来源(卵巢癌 vs 良性),样本数量(n=8或11),sTREM2检测方法(ELISA),相关性分析 阅读提示:Methods: Human specimen collection; Results: Fig 1 |
| 体外通透性实验 | 细胞系(HUVEC或C166),sTREM2浓度(500 ng/mL),处理时间(12 h),通透性检测方法(TRITC-dextran) 阅读提示:Methods: Permeability assay; Results: Fig 2 |
| 受体鉴定 | NCL敲低效率(siNCL),截短突变体(FL、ΔGAR、ΔC、ΔN),结合检测方法(Co-IP, BLI) 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation, Bio-layer interferometry; Results: Fig 4 |
| 信号通路验证 | 抑制剂使用(L-NAME浓度1 mM,处理30分钟;MK2206浓度1 μM,处理1小时),蛋白检测(p-AKT, p-eNOS) 阅读提示:Methods: Western blot; Results: Fig 5, EV4 |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(Trem2fl/flLyz2Cre或WT C57BL/6),周龄(6-8周),给药方案(sTREM2 200 μg/剂量,L-NAME 625 μg/剂量),用于检测通透性的TRITC-dextran浓度(10 mg/mL) 阅读提示:Methods: Permeability assay in vivo, Establishment of OC mouse models; Results: Fig 2,3,5,6 |