确认LPS诱导人巨噬细胞ISGylation和ISG15表达
验证LPS是否能诱导人巨噬细胞中ISGylation和ISG15表达
用LPS(1 µg/mL)处理分化的THP-1巨噬细胞16或24小时,收集全细胞裂解液,通过Western blot检测ISG15和Actin。
Extracellular Lipopolysaccharide Triggers the Release of Unconjugated Interferon-Stimulated Gene 15 (ISG15) Protein from Macrophages via Type-I Interferon/Caspase-4/Gasdermin-D Pathway.
包含细胞培养、抑制剂处理、Western blot、LDH检测、免疫沉淀等体外实验,验证了LPS、IFN、Casp4、GSDMD在ISG15释放中的作用,但缺乏体内或患者样本验证。
人THP-1单核细胞系分化巨噬细胞
LPS浓度1 µg/mL或0.5 µg/mL处理 IFN-β浓度1000 U/mL或500 U/mL处理 GSDMD抑制剂Disulfiram浓度30 µM Caspase-4抑制剂Ac-LEVD-CHO浓度4 µM IFN通路抑制剂B18R浓度0.25 µg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LPS是否能诱导人巨噬细胞中ISGylation和ISG15表达
用LPS(1 µg/mL)处理分化的THP-1巨噬细胞16或24小时,收集全细胞裂解液,通过Western blot检测ISG15和Actin。
验证LPS是否刺激巨噬细胞释放未结合型ISG15到胞外,并排除细胞裂解
收集LPS处理细胞的培养基上清,通过TCA沉淀和Western blot检测胞外ISG15,同时检测上清中Actin和LDH活性以排除细胞裂解。
探究LPS介导的ISG15释放是否依赖TLR4和GSDMD
使用TLR4抑制剂TAK-242或GSDMD抑制剂Disulfiram预处理细胞,然后加LPS刺激,检测胞外ISG15和细胞存活率。
确认Caspase-4是否参与LPS诱导的GSDMD切割和ISG15释放
使用Caspase-4抑制剂Ac-LEVD-CHO预处理细胞,加LPS刺激,检测胞外ISG15、GSDMD切割和细胞存活率。
探究IFN的自分泌/旁分泌作用是否参与LPS诱导的ISG15释放
使用IFN通路抑制剂B18R或JAK抑制剂Ruxolitinib预处理细胞,加LPS刺激,检测ISGylation、GSDMD切割和胞外ISG15;同时用IFN-β直接处理细胞,验证其对ISG15释放的作用。
验证自噬是否参与LPS诱导的ISG15释放
使用自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤(3MA)预处理细胞,加LPS刺激,检测胞外ISG15。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco-ThermoFisher Scientific | 11875093 |
| 胎牛血清 | 文中未明确说明 | -- | |
| β-巯基乙醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞处理 | 脂多糖 | InvivoGen | tlrl-3pelps |
| 干扰素-β | Sino Biological | 10704-HNAS | |
| 双硫仑 | MedChemExpress | HY-B0240 | |
| Ac-LEVD-CHO | Santa Cruz Biotechnology | 396109 | |
| B18R蛋白 | InvivoGen | inh-b18r | |
| TAK-242 | MedChemExpress | HY-11109 | |
| 鲁索替尼 | MedChemExpress | HY-50856 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | 5142-23-4 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | D2650 | |
| Western blot | ISG15抗体 | 文中未明确说明 | -- |
| Gasdermin D抗体 | Cell Signaling Technology | 39754S | |
| 肌动蛋白抗体 | Bethyl Laboratories | A300-491A | |
| 硝酸纤维素膜 | Amersham Protran-Cytiva | -- | |
| Western Lightning Plus-ECL化学发光系统 | PerkinElmer | 104001EA | |
| LDH检测 | LDH反应混合物 | abcam | ab65393 |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠 | ThermoFisher Scientific | 20398 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | THP-1细胞系来源(ATCC TIB-202),培养条件(RPMI-1640含10% FBS、100 IU/mL青霉素、100 µg/mL链霉素、1 mM丙酮酸钠、10 mM HEPES、50 µM β-巯基乙醇),分化条件(100 nM PMA处理24小时)。 阅读提示:2.1 Cell Culture |
| 细胞处理 | LPS浓度(1 µg/mL或0.5 µg/mL),IFN-β浓度(1000 U/mL或500 IU/mL),抑制剂浓度和预处理时间(2小时),处理时间(未明确,需参考图注)。 阅读提示:2.2 Cell Treatment |
| 胞外蛋白检测 | TCA沉淀步骤(20% TCA,4℃过夜),Western blot检测ISG15和Actin。 阅读提示:2.4 TCA Precipitation, 图1B |
| 细胞毒性检测 | LDH实验步骤(上清离心8000 rpm 10分钟,按试剂盒说明操作,450 nm吸光度)。 阅读提示:2.5 Lactate Dehydrogenase (LDH) Assay |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠与ISG15抗体偶联过夜,免疫沉淀步骤(洗脱,Western blot检测)。 阅读提示:2.6 Immunoprecipitation |