YAP在CRPC细胞中的表达及功能验证
评估YAP在CRPC细胞中的表达水平及其对细胞增殖的必要性
通过Western blot检测PC3、DU145、LNCaP和22Rv1细胞中YAP蛋白水平;使用siRNA敲低YAP后通过MTT实验检测细胞增殖。
Activation of the Hippo Pathway by ATN Suppresses Cancer Stem-Like Properties and EGFR-Associated Signaling in Castration-Resistant Prostate Cancer Cells in vitro.
研究基于体外细胞实验,包括细胞活力、集落形成、凋亡、肿瘤球、迁移、Western blot和免疫荧光,并通过YAP过表达及CA-Akt进行功能验证,但缺乏体内模型验证。
PC3人前列腺癌细胞系 DU145人前列腺癌细胞系 CCD966SK人皮肤成纤维细胞系
PC3和DU145细胞系(来源BCRC) ATN处理浓度:PC3 IC50 1.13 μM,DU145 IC50 0.43 μM ATN处理时间:细胞活力72小时,Western blot 48小时,免疫荧光24小时 对照:DMSO(终浓度0.1%) 统计分析:Student's t检验和双因素方差分析(Sidak事后检验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估YAP在CRPC细胞中的表达水平及其对细胞增殖的必要性
通过Western blot检测PC3、DU145、LNCaP和22Rv1细胞中YAP蛋白水平;使用siRNA敲低YAP后通过MTT实验检测细胞增殖。
评估ATN对CRPC细胞活力的抑制效果及对Hippo-YAP通路的影响
MTT实验检测不同浓度ATN对PC3、DU145和CCD966SK细胞活力的影响;Western blot检测YAP及其靶蛋白(c-Myc、NFkB)表达;免疫荧光检测YAP核定位;Western blot检测YAP磷酸化及Hippo激酶磷酸化。
评估ATN对CRPC细胞集落形成和凋亡的影响
集落形成实验检测ATN对克隆形成能力的影响;流式细胞术(Annexin V-FITC/PI双染)检测凋亡;Western blot检测凋亡相关蛋白(PARP-1, cleaved caspase-9/3)。
评估ATN对CRPC细胞肿瘤球形成和CSC标志物表达的影响
肿瘤球形成实验(超低附着板)检测ATN对肿瘤球形成能力的影响;流式细胞术检测CD44+/CD24-群体;Western blot检测CSC相关蛋白(CD133, CD44, Oct4, SOX2, Nanog)。
评估ATN对CRPC细胞迁移能力和EMT蛋白表达的影响
Transwell迁移实验检测ATN对细胞迁移的影响;Western blot检测EMT相关蛋白(N-cadherin, Twist, YB-1, Snail)。
评估ATN对EGFR及其下游信号通路的影响,并验证Akt在其中的作用
Western blot检测YAP、AREG、EGFR及下游MEK/ERK、Akt/mTOR/p70S6K表达;通过CA-Akt过表达检测细胞活力和凋亡标志物的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | Cat#23400021 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | Cat#A5670701 | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | Cat#15140122 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | Cat#D8418 | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | Biomatik | Cat#A3338 |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | Cat#11668019 |
| Western blot | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | Cat#78440 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | Cat#23227 | |
| 硝酸纤维素膜 | Sigma-Aldrich | Cat#GE10600002 | |
| 脱脂牛奶 | Sigma-Aldrich | Cat#M7409 | |
| 化学发光试剂 | PerkinElmer | Cat#PK-NEL105 | |
| 集落形成实验 | 甲醛 | Sigma-Aldrich | Cat#252549 |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | Cat#C6158 | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | Cat#556547 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488二抗 | Thermo Fisher Scientific | Cat#A-11008 |
| DAPI染料 | Sigma-Aldrich | Cat#D9542 | |
| Fluoromount封片剂 | Sigma-Aldrich | Cat#F4680 | |
| Nikon ECLIPSE 80i荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| DS-Qi1MC CCD相机 | Nikon | -- | |
| 肿瘤球形成实验 | 超低吸附24孔板 | Corning Inc. | Cat#3473 |
| MammoCult™人培养基 | STEMCELL Technologies | Cat#05620 | |
| 迁移实验 | 8µm孔径Transwell小室 | Millipore | Cat#SCWP09025 |
| Giemsa染液 | Sigma-Aldrich | Cat#32884 | |
| 细胞因子处理 | 重组人EGF | Sino Biological | Cat#10605-HNAE |
| 转染 | YAP-Flag表达质粒 | Addgene | plasmid #66853 |
| CA-Akt质粒 | Addgene | plasmid #10841 | |
| 乱序siRNA | Dharmacon (Horizon Discovery) | Cat#D-001206-13-05 | |
| YAP siRNA | Santa Cruz Biotechnology | Cat#sc-38637 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(BCRC)及培养条件(RPMI 1640、10% FBS、1% Pen/Strep、37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Cell lines, cell culture, and antibodies |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度5000细胞/孔,ATN浓度梯度(PC3 IC50 1.13μM,DU145 0.43μM),处理72小时,DMSO对照终浓度0.1% 阅读提示:Materials and Methods, Cell viability assay; Figure 2B |
| 蛋白质免疫印迹 | ATN处理浓度及时间(48小时),抗体来源及稀释比例 阅读提示:Materials and Methods, Western blot analysis; Figure Legends 2C, 2E, 2F, 3E, 4E, 5C, 6B |
| 凋亡检测 | ATN处理浓度及时间(72小时),Annexin V-FITC/PI染色步骤 阅读提示:Materials and Methods, Apoptosis assays by flow cytometry; Figure 3C-D |
| 肿瘤球形成实验 | 细胞接种密度5000细胞/孔,处理8-12天,MammoCult™培养基,ATN浓度(0-1μM) 阅读提示:Materials and Methods, Cancer stem cells tumorsphere formation assay; Figure 4A-B |
| 迁移实验 | 细胞密度、ATN浓度(0-2μM),处理16-24小时,8µm Transwell小室 阅读提示:Materials and Methods, Transwell cell migration assay; Figure 5A-B |
| 转染实验 | 质粒来源(Addgene #66853, #10841),siRNA来源(Dharmacon, Santa Cruz),Lipofectamine 2000转染,细胞活力测定时间(72小时) 阅读提示:Materials and Methods, Transient transfection; Figure 2G, 6C-D |