临床样本中硬化蛋白表达分析
评估硬化蛋白在不同乳腺癌亚型中的表达及其与增殖标志物的相关性
通过免疫组化(IHC)对293例乳腺癌组织(100例TNBC,94例HER2阳性,99例luminal)进行硬化蛋白表达评分,并分析其与Ki-67的相关性。
Intracellular sclerostin promotes tumor progression and metastasis as a potential therapeutic target in triple-negative breast cancer.
包含临床样本分析、体外细胞功能实验、体内异种移植和PDX模型,并通过基因敲除、PROTAC降解、机制验证等形成多层级证据。
MDA-MB-231和4T1细胞系 MDA-MB-231和4T1细胞原位移植瘤模型 三阴性乳腺癌患者来源异种移植(PDX)模型
SOST基因敲除的TNBC细胞系(231-SOSTKO和4T1-sostKO) Apc101处理的浓度和时间(如0.7 μM处理6小时) CDK1和cyclin B1 mRNA的稳定性检测 caprin1相互作用区域(249-290氨基酸)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估硬化蛋白在不同乳腺癌亚型中的表达及其与增殖标志物的相关性
通过免疫组化(IHC)对293例乳腺癌组织(100例TNBC,94例HER2阳性,99例luminal)进行硬化蛋白表达评分,并分析其与Ki-67的相关性。
确定硬化蛋白对TNBC细胞增殖、迁移和侵袭的影响
使用MDA-MB-231和4T1细胞及其SOST敲除(KO)或过表达细胞内硬化蛋白的变异株,进行集落形成、细胞生长、transwell迁移和侵袭实验。
验证硬化蛋白对TNBC肿瘤生长和转移的影响
将WT和SOST-KO细胞接种于裸鼠或BALB/c小鼠的乳腺脂肪垫(原位)或心脏(转移模型),监测肿瘤生长并计数肺转移结节。
证实硬化蛋白的肿瘤促进作用主要来自细胞内形式
使用sclerostin抗体(Scl-Ab)和重组蛋白处理细胞和动物,以及SOST敲除小鼠模型,观察对肿瘤进展的影响。
开发并优化靶向细胞内硬化蛋白的PROTAC分子
设计基于aptamer的PROTAC(Apc101),通过SPR验证三元复合物形成,并检测其降解细胞内硬化蛋白的效率、选择性和机制。
评估Apc101对TNBC肿瘤生长和转移的治疗效果
在MDA-MB-231和4T1细胞原位及转移模型中,给予PBS、紫杉醇、Scl-Ab或Apc101,比较肿瘤体积、重量和肺转移结节。
评估Apc101在患者来源异种移植模型中的疗效
将sclerostin阳性或阴性的临床TNBC组织移植到NCG小鼠,建立PDX模型,并给予Apc101或紫杉醇,比较肿瘤生长。
阐明细胞内硬化蛋白促进TNBC进展的分子机制
通过pull-down鉴定相互作用蛋白caprin1,并验证其与CDK1和cyclin B1 mRNA的相互作用及mRNA稳定性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗Sclerostin抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-113315 |
| 抗Ki-67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ATCC | 30-2002 |
| RPMI-1640培养基 | ATCC | 30-2001 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Western blot | PVDF转印膜 | Thermo Scientific | 88518 |
| Pull-down | His标签重组人硬化蛋白 | Sino Biological | 10593-H07H-B |
| RNA免疫沉淀 | Magna RIP试剂盒 | Sigma-Aldrich | 17-700 |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Vazyme | TL301-01 |
| 免疫组织化学 | GTVisionTM Ⅲ检测系统 | Gene Tech | GK500710 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:STAR Methods: Cell lines and cell culture |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、细胞接种数量和部位 阅读提示:STAR Methods: Animal experiments |
| PROTAC处理 | Apc101浓度(0.05-0.7 μM)、处理时间(6小时)、对照(Apc101ˆ) 阅读提示:Results: The role of intracellular sclerostin in TNBC proliferation and migration in vitro and Figure 3 |
| 基因敲除/敲降 | SOST敲除细胞系构建方法(CRISPR等),siRNA序列 阅读提示:STAR Methods: Genotyping, 转染 |
| 机制实验 | RIP实验中的抗体、细胞裂解条件、洗涤次数 阅读提示:STAR Methods: RNA immunoprecipitation (RIP) |