ANXA2表达与临床相关性分析
评估ANXA2在HCC中的表达及其与预后的关系
使用TIMER2.0和TCGA数据库分析ANXA2表达,并在组织芯片中进行IHC验证,同时分析其与CD8+ T细胞浸润和生存期的相关性。
Targeting the ANXA2-CD63-exosomal PD-L1 axis in hepatocellular carcinoma: A novel mechanism of immune evasion and its implications for precision immunotherapy.
结合生物信息学分析、体外细胞实验、共培养杀伤实验、外泌体功能实验、体内小鼠模型及机制验证,包含多种证据层级和功能验证。
小鼠肝癌细胞系Hepa1-6 人肝癌细胞系Huh7、JHH7 C57BL/6J小鼠同系移植瘤模型 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
ANXA2敲除对体外增殖无影响,但在免疫活性小鼠中抑制肿瘤生长,需验证免疫依赖性 外泌体PD-L1水平及功能,需验证ANXA2敲除外泌体对T细胞活化的影响 CD63蛋白稳定性及其调控机制,需验证溶酶体抑制或泛素化抑制对CD63和外泌体PD-L1的恢复作用 体内外泌体给药剂量为20 μg,每周两次,持续21天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ANXA2在HCC中的表达及其与预后的关系
使用TIMER2.0和TCGA数据库分析ANXA2表达,并在组织芯片中进行IHC验证,同时分析其与CD8+ T细胞浸润和生存期的相关性。
在体外和体内模型中研究ANXA2缺失对肿瘤进展和免疫的影响
通过CRISPR/Cas9构建ANXA2敲除的Hepa1-6和Huh7细胞系,并进行体外增殖和体内肿瘤生长实验。
评估ANXA2对T细胞介导的杀伤作用的影响
通过TIMER3.0分析免疫浸润,并将ANXA2敲除的HCC细胞与激活的T细胞共培养,检测肿瘤细胞存活率。
探究ANXA2是否调控PD-L1的表达和亚细胞定位
检测ANXA2敲除后PD-L1的mRNA、总蛋白和膜表面水平,并通过免疫荧光观察细胞内PD-L1的分布。
验证ANXA2是否影响外泌体分泌和外泌体PD-L1的功能
通过超速离心分离外泌体,使用NTA、TEM、Western blot和流式细胞术分析外泌体及其PD-L1水平,并进行PD-L1与PD-1结合实验和T细胞抑制实验。
评估肿瘤来源外泌体对ANXA2敲除肿瘤免疫微环境的影响
在携带ANXA2敲除肿瘤的C57BL/6J小鼠中,瘤内注射野生型或敲除外泌体,观察肿瘤生长、CD8+ T浸润和PD-L1/PD-1表达变化。
确定ANXA2调控CD63稳定性的分子机制
在ANXA2敲除细胞中过表达CD63,检测外泌体PD-L1水平和T细胞抑制功能;RNA-seq和药理学实验验证溶酶体或泛素化途径的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | BI | 01-100-1ACS |
| DMEM培养基 | BI | 01-051-1ACS | |
| 胎牛血清 | BI | 01-052-1 | |
| 基因敲除 | 单向导RNA | -- | -- |
| 慢病毒包装 | pLV-Puro慢病毒载体 | Genechem | -- |
| 外泌体定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| ANXA2抗体 | Cell Signaling Technology | #8235 | |
| CD63抗体 | Abcam | ab59479 | |
| ALIX/PDCD6IP抗体 | Cell Signaling Technology | #2171 | |
| PD-L1抗体 | Proteintech | 28076-1-AP | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记的抗兔IgG | Cell Signaling Technology | #7074 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | #7076 | |
| ECL发光液 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green预混液 | -- | -- |
| 外泌体分析 | 纳米流式分析仪 | Flow Nano Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 外泌体检测 | 小鼠CD63捕获微球(流式检测) | Immunostep | MO63CB-25 |
| 流式检测 | PE标记的大鼠抗小鼠PD-L1抗体 | BD Pharmingen | 568085 |
| PE标记的大鼠IgG2b同型对照 | BD Pharmingen | 555848 | |
| 外泌体检测 | CD63外泌体捕获微球 | Abcam | ab239686 |
| 流式检测 | PE标记的抗人PD-L1抗体 | BD | 557924 |
| PE标记的IgG同型对照 | BD | 556650 | |
| PD-1/PD-L1结合实验 | 人PD-1-Fc融合蛋白 | SinoBiological | 10377-H02H |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 | |
| 外泌体标记 | PKH26荧光染料 | Sigma | MINI26-1KT |
| T细胞分离 | 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 |
| GlutaMAX补充剂 | Gibco | 35050-061 | |
| ACK裂解缓冲液 | Gibco | A10492-01 | |
| T细胞激活 | Dynabeads小鼠T细胞激活磁珠CD3/CD28 | Thermo Fisher Scientific | 11456D |
| T细胞培养 | 重组小鼠IL-2 | PeproTech | 212-12 |
| 流式染色 | 抗小鼠CD16/32(Fc阻断) | BioLegend | 101320 |
| Zombie Aqua可固定活力染料 | BioLegend | 423101 | |
| CD3ε-APC抗体 | BioLegend | 100311 | |
| CD8α-PE-Cy7抗体 | BioLegend | 100721 | |
| CD69-PE抗体 | BioLegend | 104508 | |
| 外泌体标记 | Vybrant DiO细胞标记液 | Invitrogen | V22886 |
| 细胞因子检测 | IL-2 ELISA MAX Deluxe试剂盒 | BioLegend | 431004 |
| IFN-γ ELISA MAX Deluxe试剂盒 | BioLegend | 430804 | |
| TNF-α ELISA MAX Deluxe试剂盒 | BioLegend | 430904 | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | -- | -- |
| 抗荧光淬灭封片剂 | -- | -- | |
| Leica TCS SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Leica STELLARIS 8 STED共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫组化 | Leica Aperio VERSA 8扫描仪 | Leica Biosystems | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 美洛昔康 | -- | -- | |
| 药理学处理 | 巴弗洛霉素A1 | -- | -- |
| TAK-243 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基类型、血清浓度、培养条件 阅读提示:Methods:Cell Culture |
| ANXA2敲除 | sgRNA序列、载体、病毒包装、筛选方法 阅读提示:Methods:Establishment of ANXA2 KO Cell Lines |
| 外泌体分离与鉴定 | 离心条件、超速离心参数、标记物检测 阅读提示:Methods:Isolation of exosomes by ultracentrifugation;Transmission electron microscopy;Nanoparticle tracking analysis |
| T细胞功能实验 | T细胞来源、激活方式、外泌体剂量、共培养时间、检测指标 阅读提示:Methods:Primary mouse T-cell isolation and activation;EV dose normalization in functional assays |
| 动物实验 | 小鼠品系、年龄、性别、细胞注射数量、分组、样本量、外泌体给药剂量和频率 阅读提示:Methods:Animal studies |