鉴定CRP为荚膜结合蛋白
寻找识别肺炎链球菌23F荚膜的宿主受体。
通过CPS23F包被的微珠亲和沉降,结合质谱鉴定小鼠肝脏非实质细胞膜蛋白中与CPS23F结合的蛋白,并验证CRP与荚膜的特异性结合。
C-reactive protein is a broad-spectrum capsule-binding receptor for hepatic capture of blood-borne bacteria.
包含体外结合实验、细胞实验、基因敲除小鼠体内感染模型、活体成像、结构生物学等多层级证据,并进行功能验证和机制探究。
小鼠败血症模型 原代小鼠枯否细胞 人原代枯否细胞 人CRP转基因小鼠
小鼠品系及基因型(C57BL/6 WT、Crp−/−、C3−/−、CR3/CRIg−/−等) 细菌血清型(23F、8等)及感染剂量(106或5×107 CFU) CRP浓度(10 μg/ml)及孵育时间(5 min) 血液、肝脏等器官细菌载量检测时间点(5、30 min) IVM成像中枯否细胞标记(AF647抗F4/80)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找识别肺炎链球菌23F荚膜的宿主受体。
通过CPS23F包被的微珠亲和沉降,结合质谱鉴定小鼠肝脏非实质细胞膜蛋白中与CPS23F结合的蛋白,并验证CRP与荚膜的特异性结合。
证实CRP能直接结合完整的细菌荚膜。
采用ELISA、流式细胞术和免疫荧光显微镜检测重组小鼠或人CRP与游离荚膜多糖及完整细菌的结合。
确定CRP对血源性肺炎链球菌清除和宿主存活的影响。
感染野生型或CRP缺陷小鼠,监测血液中细菌载量、器官细菌分布和生存率。
观察CRP是否促进枯否细胞在肝血窦中捕获细菌。
通过活体显微镜检查感染后肝血窦中枯否细胞与细菌的关联,以及在体外用原代枯否细胞验证。
确定补体系统在CRP介导的细菌捕获中的作用。
使用C3、CR3、CRIg、C1q等基因缺陷小鼠,检测细菌清除;并检测C3在荚膜上的沉积。
阐明CRP如何识别结构多样的荚膜多糖。
通过等温滴定量热法测定结合亲和力,通过竞争ELISA评估PC和PG的抑制作用,分析突变体的结合变化,以及利用冷冻电镜解析CRP与CPS23F复合物的结构。
检验人CRP是否具有与小鼠CRP类似的荚膜结合和促进捕获功能。
用人CRP进行ELISA结合实验、补体沉积实验,并用人原代枯否细胞验证细菌结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1ACS | |
| 细菌培养 | Todd-Hewitt肉汤 | Oxoid | CM0189 |
| 胰蛋白大豆琼脂 | BD Difco | 211047 | |
| 脑心浸液 | BD Difco | 237500 | |
| 细胞因子处理 | 血红素 | Innochem | B95103 |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD) | Sigma-Aldrich | N7004 | |
| 亲和沉降 | Mem-PER Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Scientific | 89842 |
| ELISA | TMB显色底物 | Tiangen | PA107 |
| 脱脂奶粉 | BD Difco | 232100 | |
| 蛋白质纯化 | Strep-Tactin琼脂糖树脂 | IBA Lifesciences GmbH | 2-1201-010 |
| 脱硫生物素 | IBA Lifesciences GmbH | 2-1000-002 | |
| 3 kDa超滤离心管 | Merck Millipore | UFC800308 | |
| 流式细胞术 | PE标记抗补体C3b/iC3b抗体 | BioLegend | 846104 |
| FITC标记山羊抗小鼠IgG | EASYBIO | BE0111 | |
| 荧光显微镜 | AF647标记山羊抗兔IgG | Invitrogen | A27040 |
| AF647标记抗小鼠F4/80 IgG | BioLegend | 123121 | |
| AF594标记抗小鼠CD31 IgG | BioLegend | 102520 | |
| ELISA | HRP标记山羊抗小鼠IgG(H+L) | Huaxingbio | HX2032 |
| HRP标记山羊抗小鼠IgM(H+L) | Elabscience | E-AB-1008 | |
| 兔抗小鼠CRP IgG | Invitrogen | PA5-81363 | |
| HRP标记山羊抗小鼠C3 IgG | Cappel | 55557 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Invitrogen | A27040 | |
| 免疫沉淀 | Protein G树脂 | GenScript | L00209 |
| 竞争实验 | 磷酸胆碱 | Macklin | P912369 |
| β-甘油磷酸二钠盐 | Psaitong | G10340 | |
| 细胞分离 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 10104159001 | |
| Hanks平衡盐溶液 | Corning | 21-022-CV | |
| 红细胞裂解液(10×) | BioLegend | 420301 | |
| ISO | VP-ITC微量热仪 | Malvern Instruments Ltd | -- |
| 冷冻电镜 | Titan Krios显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Gatan K3探测器 | Gatan | -- | |
| 铜网(R1.2/1.3 300目) | Quantifoils | N-C14nCu30-01 | |
| 蛋白质表达 | SMM 293-TII表达培养基 | Sino Biological | M293TII |
| 聚乙烯亚胺(PEI) | Polysciences | 23966 | |
| 重组DNA构建 | ClonExpress Ultra一步克隆试剂盒 | Vazyme | C115 |
| 质谱 | Thermo-Dionex Ultimate 3000高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- |
| Thermo Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| 表面标记 | 异硫氰酸荧光素 | Sigma-Aldrich | F7250 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养 | 肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和肺炎克雷伯菌的培养条件(培养基、温度、CO2浓度) 阅读提示:Methods:Bacterial strains and cultivation |
| 蛋白表达与纯化 | 重组CRP的表达载体、表达系统、纯化方法(Strep-Tactin树脂、洗脱缓冲液) 阅读提示:Methods:Production of recombinant CRP |
| ELISA检测 | CPS包被浓度、封闭液、CRP浓度、抗体稀释度、TMB显色步骤 阅读提示:Methods:Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) |
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系和基因型、细菌菌株和剂量、接种途径、采血时间点、器官处理 阅读提示:Methods:Mouse infection |
| 活体显微镜成像 | 荧光标记抗体的使用、细菌标记方法、成像时间点、显微镜设置 阅读提示:Methods:Intravital microscopy (IVM) |
| 枯否细胞结合实验 | 枯否细胞分离方法、细菌感染复数(MOI)、血清浓度、孵育时间 阅读提示:Methods:Bacterial binding to primary Kupffer cells |
| 补体沉积检测 | 血清处理(热灭活)、C3检测抗体、孵育时间和温度 阅读提示:Methods:Detection of in vitro C3 activation |
| 等温滴定量热法 | 蛋白和配体浓度、缓冲液、滴定参数、分析软件 阅读提示:Methods:Isothermal titration calorimetry (ITC) |
| 冷冻电镜 | 样品制备浓度、冷冻条件、数据收集参数、数据处理流程 阅读提示:Methods:Cryo-EM sample preparation and data collection |