评估IL-16的肿瘤抑制作用
验证IL-16对肿瘤生长的影响
在E0771乳腺癌、LLC肺癌和MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠模型中,腹腔注射IL-16或PBS,监测肿瘤生长并称重;使用抗IL-16抗体中和内源性IL-16,观察肿瘤生长变化。
Interleukin-16 enhances anti-tumor immune responses by establishing a Th1 cell-macrophage crosstalk through reprogramming glutamine metabolism in mice.
包含细胞分化实验、代谢组学、动物模型(E0771、LLC、MMTV-PyMT)、患者样本分析及ICB联合治疗,且涉及功能验证和机制验证。
E0771乳腺癌小鼠模型 LLC肺癌小鼠模型 MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠模型 人乳腺癌组织及血清样本
IL-16给药剂量和频率(1μg/只,每周两次,腹腔注射) 抗IL-16中和抗体剂量(150μg/只,每周两次) PD-L1阻断剂量(150μg/只,每周两次) CD4+ T细胞耗竭方法(200μg抗CD4抗体,每周两次) 谷氨酰胺缺乏饮食处理时间(肿瘤接种前一周开始)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IL-16对肿瘤生长的影响
在E0771乳腺癌、LLC肺癌和MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠模型中,腹腔注射IL-16或PBS,监测肿瘤生长并称重;使用抗IL-16抗体中和内源性IL-16,观察肿瘤生长变化。
确定IL-16是否建立Th1优势的免疫微环境
通过流式细胞术分析肿瘤浸润免疫细胞比例,包括CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、Th1细胞(IFN-γ+CD4+)及功能标志物(GZMB、perforin);通过QPCR检测肿瘤组织中相关基因表达。
验证IL-16的抗肿瘤作用是否依赖于CD4+ T细胞
使用裸鼠和抗CD4抗体耗竭CD4+ T细胞的小鼠,评估IL-16对肿瘤生长、CD8+ T细胞比例和细胞毒性基因表达的影响。
验证IL-16是否直接促进Th1细胞分化
从小鼠脾脏分选初始CD4+ T细胞,在Th1条件下用IL-16处理,通过RNA-seq、QPCR、流式和ELISA检测Th1标志物(IFN-γ、T-bet)的表达;同时检测对Th2、Th17和Treg分化的影响。
确定IL-16是否通过谷氨酰胺代谢调控Th1分化
对IL-16处理的Th1细胞进行代谢组学分析,检测细胞内谷氨酰胺和谷氨酸水平;通过QPCR和RNA-seq检测谷氨酰胺代谢基因表达;使用谷氨酰胺缺乏培养基和GLS抑制剂CB-839验证IL-16的效应;在体内使用谷氨酰胺缺乏饮食和CB-839处理。
验证IL-16是否通过IFN-γ将TAM重编程为M1样表型
从IL-16处理的肿瘤中分离TAM,检测M1/M2标志物表达;用肿瘤间质液处理巨噬细胞,并加入IFN-γ中和抗体;在体内中和IFN-γ;将IL-16处理的TAM与肿瘤细胞共接种,观察肿瘤生长。
验证IL-16是否增强PD-L1阻断的治疗效果
在E0771和LLC模型中,单独或联合使用IL-16和抗PD-L1抗体,监测肿瘤生长;使用CXCR3抑制剂NBI-74330验证CXCR3配体的必要性;使用氯膦酸脂质体耗竭巨噬细胞,观察联合治疗效果的变化。
验证IL-16水平与患者预后及免疫治疗反应的相关性
分析癌症患者血清IL-16水平与生存和ICB治疗反应的关系;使用TCGA和GEO数据库分析IL16表达与预后的关联;检测血清中CXCL9和CXCL10水平。
确定肿瘤微环境中IL-16表达下调的原因
通过STITCH数据库预测IL-16与组胺的相互作用;检测癌症患者血清组胺水平;在动物模型中给予组胺或使用肥大细胞稳定剂DSCG,评估IL-16表达、Th1比例和肿瘤生长;使用肥大细胞缺陷小鼠和scRNA-seq分析HDC表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | E0771细胞 | American Type Culture Collection | CRL-3461 |
| LLC细胞 | American Type Culture Collection | CRL-1642 | |
| 药物处理 | 白介素-16 | Novus Biologicals | NBP2-35104 |
| 抗IL-16抗体 | Biolegend | 519108 | |
| 抗CD4抗体 | Biolegend | 100457 | |
| 抗IFN-γ抗体 | BioXCell | 505847 | |
| 抗PD-L1抗体 | BioXCell | BE0101 | |
| NBI-74330 | MedChemExpress | HY-15320 | |
| 组胺 | Aladdin | H111796 | |
| 细胞培养 | 抗CD3抗体 | BioXCell | BE0001-1 |
| 抗CD28抗体 | BioXCell | BE0015-5 | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Serana | S-FBS-SA-015 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15070063 | |
| HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630106 | |
| 白细胞介素-12 | Peprotech | 577002 | |
| 抗IL-4抗体 | Biolegend | 504122 | |
| 白细胞介素-2 | Biolegend | 575402 | |
| 细胞分选 | EasySep小鼠初始CD4+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19765 |
| EasySep人初始CD4+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19555 | |
| EasySep小鼠初始CD8+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19858 | |
| EasySep小鼠F4/80阳性分选试剂盒 | STEMCELL | 100-0659 | |
| EasySep生物素阳性分选试剂盒 | STEMCELL | 17683 | |
| 流式细胞术 | CD45-APC/CY7抗体 | Biolegend | 103116 |
| IFNγ-PE抗体 | Biolegend | 505808 | |
| T-bet-AF647抗体 | Biolegend | 644804 | |
| F4/80-FITC抗体 | Biolegend | 123107 | |
| CD11b-PE抗体 | Biolegend | 101207 | |
| CD8-FITC抗体 | Biolegend | 100706 | |
| CD4-PE/CY7抗体 | Biolegend | 100422 | |
| IL-17A-FITC抗体 | Biolegend | 506907 | |
| IL-4-PE抗体 | Biolegend | 504103 | |
| Foxp3-AF647抗体 | Biolegend | 126407 | |
| Zombie Violet活力染料 | Biolegend | 423114 | |
| CFSE | Thermo Fisher Scientific | C34554 | |
| NovoCyte流式细胞仪 | Agilent | -- | |
| 免疫印迹 | GSK-3α/β抗体 | Cell Signaling Technology | 5676T |
| p-GSK-3α/β抗体 | Cell Signaling Technology | 9331S | |
| ELISA | 人IL-16 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0178 |
| 人CXCL9 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0008 | |
| 人CXCL10 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0102 | |
| 小鼠IL-16 ELISA试剂盒 | Sino Biological | KIT51303 | |
| 人IFN-γ ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-7316-77 | |
| 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-7314-88 | |
| 组胺ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0032 | |
| 代谢组学 | Q300试剂盒 | Metabo-Profile Corp. | -- |
| 超高效液相色谱-串联质谱 | Waters Corp. | -- | |
| 谷氨酰胺/谷氨酸检测 | 谷氨酰胺/谷氨酸-Glo检测试剂盒 | Promega | J8021 |
| GLS抑制 | CB-839 | MedChemExpress | HY-12248 |
| RNA提取与反转录 | Trizol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | RR036B | |
| QPCR | SYBR Green试剂 | CwBio | CW0955M |
| 单细胞RNA测序 | sCelLive组织保存液 | Singleron Biotechnologies | -- |
| sCelLive组织解离液 | Singleron Biotechnologies | -- | |
| GEXSCOPE单细胞RNA文库试剂盒 | Singleron Biotechnologies | -- | |
| Singleron Matrix自动化单细胞处理系统 | Singleron Biotechnologies | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序系统 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、性别;细胞系及接种数量;接种部位;肿瘤体积测量方法 阅读提示:Methods:Mice and tumor models |
| IL-16治疗 | IL-16剂量、给药途径、频率 阅读提示:Methods:Mouse IL-16 administration |
| CD4+ T细胞耗竭 | 抗CD4抗体剂量、给药时间 阅读提示:Methods:T cell depletion |
| IFN-γ中和 | 抗IFN-γ抗体剂量、给药途径 阅读提示:Methods:IFN-γ neutralization |
| PD-L1阻断 | 抗PD-L1剂量、给药频率 阅读提示:Methods:PD-L1 blockade |
| CXCR3抑制 | NBI-74330剂量、给药方式 阅读提示:Methods:For CXCR3 inhibition |
| 谷氨酰胺缺乏饮食 | 饮食开始时间、持续时间 阅读提示:Methods:Glutamine deprivation |
| GLS抑制 | CB-839剂量、给药频率 阅读提示:Methods:GLS inhibition |
| 巨噬细胞耗竭 | 氯膦酸脂质体剂量、给药方案 阅读提示:Methods:Macrophage depletion |
| 组胺给药 | 组胺剂量、给药频率 阅读提示:Methods:Histamine administration |