验证MUL1调控TBK1表达
确定MUL1是否作为E3连接酶调控TBK1的稳定性。
通过Western blot分析患者组织和细胞系中MUL1与TBK1表达,使用免疫沉淀和泛素化实验验证MUL1与TBK1的相互作用及泛素化类型。
TBK1 is a signaling hub in coordinating stress-adaptive mechanisms in head and neck cancer progression.
研究包含体外细胞实验、患者组织样本、异种移植瘤模型等多层级验证,并进行了机制研究如泛素化、自噬流和应激颗粒形成分析。
FaDu、SCC15等HNC细胞系 MUL1敲除FaDu细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型 HNC患者肿瘤及癌旁组织样本
MUL1与TBK1表达的相关性 TBK1 K584位点的泛素化 GSK8612对TBK1活性的抑制 自噬流的完整性 应激颗粒的形成
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MUL1是否作为E3连接酶调控TBK1的稳定性。
通过Western blot分析患者组织和细胞系中MUL1与TBK1表达,使用免疫沉淀和泛素化实验验证MUL1与TBK1的相互作用及泛素化类型。
确定MUL1介导的TBK1泛素化的具体赖氨酸残基。
通过构建TBK1截短突变体和点突变体,进行泛素化实验和蛋白质稳定性分析。
探究HSP90抑制剂如何影响TBK1的稳定性。
使用HSP90抑制剂处理细胞,观察TBK1蛋白水平变化,并通过免疫沉淀和泛素化实验分析机制。
研究TBK1在自噬体-溶酶体融合和选择性自噬中的作用。
利用western blot、mCherry-GFP-LC3报告基因、免疫荧光和电子显微镜分析TBK1抑制对自噬流的影响。
确定TBK1是否影响应激颗粒的形成。
通过免疫荧光检测G3BP1和PABP阳性应激颗粒,分析TBK1抑制或敲低对应激颗粒形成的影响。
评估GSK8612在体内对HNC肿瘤生长的抑制作用。
建立FaDu细胞皮下异种移植瘤模型,口服给予GSK8612,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫组化检测相关蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 硼替佐米 | Selleckchem | S1013 |
| 毒胡萝卜素 | Sigma-Aldrich | T9033 | |
| 乳胞素 | Sigma-Aldrich | L6785 | |
| 环氧霉素 | Sigma-Aldrich | E3652 | |
| MG132 | Selleckchem | S2619 | |
| 17AAG | Selleckchem | S1141 | |
| AUY922 | Selleckchem | S1069 | |
| HSP990 | Selleckchem | S7097 | |
| 巴弗洛霉素A1 | Selleckchem | S1413 | |
| 氯喹 | Selleckchem | S6999 | |
| GSK8612 | Selleckchem | S8872 | |
| 托林1 | Selleckchem | S2827 | |
| 化合物1 | Selleckchem | S8922 | |
| 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | P9620 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Selleckchem | S2767 | |
| 顺铂 | Selleckchem | S1166 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine LTX | Thermo Fisher Scientific | 15338100 |
| RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | |
| 抗体 | 抗p-TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 |
| 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 38066 | |
| 抗MYC标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 抗Flag标签抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗SQSTM1抗体 | Cell Signaling Technology | 88588 | |
| 抗MAP1LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| 抗G3BP1抗体 | Abcam | ab56574 | |
| 抗PABP抗体 | Abcam | ab21060 | |
| 试剂盒 | Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 |
| LIVE/DEAD细胞活力/细胞毒性试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L3224 | |
| 仪器 | 尼康A1R光谱共聚焦激光双扫描显微镜 | Nikon | -- |
| 蔡司LSM900共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 尼康A1R HD25 N-SIM系统 | Nikon | -- | |
| JEOL JEM-1011透射电子显微镜 | JEOL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养条件、转染试剂 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 药物处理 | 药物浓度、处理时间、溶剂 阅读提示:Materials and methods: Reagents |
| 蛋白检测 | 抗体稀释比例、孵育时间、洗涤条件 阅读提示:Materials and methods: Western blot |
| 免疫荧光 | 固定、通透、封闭、抗体浓度、图像采集参数 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence |
| 异种移植瘤模型 | 细胞数量、注射部位、动物品系、给药剂量和频率 阅读提示:Materials and methods: Xenograft in vivo tumor model |