验证HSV-1感染激活MAPK/JNK通路
确认HSV-1感染是否诱导JNK等MAPK的磷酸化激活。
HeLa细胞感染HSV-1(MOI=0.3)不同时间点,免疫印迹检测JNK、p38、ERK磷酸化水平。
Activation of the stress-activated protein kinase JNK in response to herpes simplex virus-1 infection coordinates transition of BRD4 from chromosome association to transcription elongation.
包含体外细胞感染模型(HeLa、JNK敲除、siRNA)、生化分析(免疫共沉淀、分级分离、ChIP-qPCR)及体内小鼠模型(急性感染和潜伏期再激活)的功能和机制验证。
HeLa细胞(HSV-1感染模型) JNK1/2敲除HeLa细胞 Balb/C小鼠角膜划痕感染模型 Balb/C小鼠潜伏感染模型
HSV-1感染MOI(0.3或1)及感染时间 JNK抑制剂SP600125浓度(5、10 μM)及处理时间 JNK1/2敲除HeLa细胞及siRNA敲低 HMBA浓度(3 mM)及处理时间 bortezomib剂量(1.5 mg/kg)及给药途径(ip)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认HSV-1感染是否诱导JNK等MAPK的磷酸化激活。
HeLa细胞感染HSV-1(MOI=0.3)不同时间点,免疫印迹检测JNK、p38、ERK磷酸化水平。
检测JNK活性对HSV-1感染的影响。
使用JNK抑制剂SP600125处理或JNK1/2敲除HeLa细胞,检测HSV-1蛋白(ICP4)表达和病毒滴度,并通过外源表达JNK进行回补。
检测HSV-1感染是否导致BRD4从染色质释放,并验证其依赖JNK。
使用细胞分级分离实验检测BRD4在低盐组分(LSF)和低盐提取核组分(LSEN)中的分布,并用SP600125或siRNA处理验证JNK的作用。
确认HSV-1感染是否促进BRD4与转录延伸因子复合物的形成并关联病毒DNA。
通过免疫共沉淀检测BRD4与CDK9(P-TEFb亚基)和Pol II(Rpb-1)的相互作用,并使用改良的ChIP-qPCR检测BRD4等蛋白在病毒基因启动子区域的富集。
测试JNK激动剂及化疗药物是否能通过激活JNK增强HSV-1感染。
感染细胞后分别用JNK激动剂(如anisomycin)和化疗药物(cisplatin、paclitaxel、bortezomib、HMBA)处理,检测JNK磷酸化、病毒蛋白表达和病毒滴度;并用SP600125抑制验证JNK依赖性。
在动物模型中验证JNK激活剂bortezomib是否促进HSV-1急性感染和潜伏期再激活。
Balb/C小鼠角膜划痕感染HSV-1后给予bortezomib,检测泪液病毒DNA和滴度、脑组织病理及脑内JNK磷酸化;在潜伏感染模型中检测三叉神经节病毒基因表达和LAT水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| JNK抑制 | SP600125(JNK抑制剂) | -- | -- |
| p38抑制 | SB203580(p38抑制剂) | -- | -- |
| ERK途径抑制 | U0126(ERK途径抑制剂) | -- | -- |
| JNK激活 | 茴香霉素 | -- | -- |
| 化疗药物 | 顺铂 | Selleck Chemicals | -- |
| 紫杉醇 | -- | -- | |
| 硼替佐米 | Selleck Chemicals | -- | |
| 抗病毒对照 | 阿昔洛韦 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白检测 | JNK1/2抗体 | BD Bioscience | 554285 |
| p38抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Erk2抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Rpb-1 CTD抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| CDK9抗体 | Santa Cruz | sc-13130 | |
| BRD4抗体 | Abcam | ab128874 | |
| Lamin B1抗体 | Beyotime | AF5222 | |
| ICP0抗体 | Santa Cruz | sc-53070 | |
| GAPDH抗体 | Bioworld Technology | MB001 | |
| HEXIM1抗体 | Cell Signaling Technology | 9064 | |
| FLAG抗体 | Beyotime | AF519 | |
| 质粒构建 | pcDNA5-CMV-FLAG-BRD4野生型质粒 | Miaoling | P29409 |
| pcDNA5-CMV-FLAG-BRD4-T1186A/T1212A突变体质粒 | GenScript | -- | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Beyotime | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| DNA/RNA提取 | MiniBEST病毒RNA/DNA提取试剂盒 | TaKaRa | 9766 |
| 逆转录 | HiScript逆转录预混液 | Vazyme | R323-01 |
| qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Vazyme | Q141-02/03 |
| ABI 7300实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 显微镜 | Olympus VS200玻片扫描仪 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HSV-1感染 | MOI、感染时间、细胞类型 阅读提示:Methods 'Cells and virus' 和 'Infection and titration assay' |
| JNK抑制 | SP600125浓度(5,10μM)、处理时间(1h预先处理) 阅读提示:Figure 1B 图注和Methods 'Infection and titration assay' |
| JNK敲除 | JNK1/2敲除HeLa细胞构建方法、sgRNA序列 阅读提示:Methods 'Cells and virus' |
| BRD4释放检测 | 细胞分级分离方法(buffer组成、提取次数) 阅读提示:Methods 'Fractionation assay' |
| 复合物形成检测 | 免疫共沉淀抗体、样本制备 阅读提示:Methods 'Immunoprecipitation and immunoblotting studies' |
| 病毒DNA结合检测 | ChIP-qPCR方法、引物序列 阅读提示:Methods 'Chromatin immunoprecipitation (ChIP)' 和 Table S1 |
| 动物实验 | 小鼠品系、HSV-1感染剂量及途径、bortezomib剂量及给药方案、UVB剂量 阅读提示:Methods 'Animal studies' |