Nsp14对NF-κB和MAPK信号通路的激活
验证Nsp14是否激活NF-κB和MAPK信号通路,并确定所需结构域和酶活性。
在HEK293-hTLR4-MD2-CD14细胞中转染Nsp14及其突变体,通过报告基因和免疫印迹检测NF-κB和MAPK激活。
SARS-CoV-2 Nsp14 binds Tollip and activates pro-inflammatory pathways while downregulating interferon-α and interferon-γ receptors.
包含细胞模型(HEK293T、Huh7、A549-ACE2)的体外实验、SARS-CoV-2感染实验、Nsp14突变体功能验证、Tollip相互作用域作图及siRNA敲低研究,涵盖信号通路、受体表达和功能验证。
HEK293T细胞 HEK293-hTLR4-MD2-CD14细胞 Huh7细胞 A549-ACE2细胞
Nsp14 N7-MTase活性(D331A突变)对NF-κB和MAPK激活及IFNAR1/IFNGR1下调的关键作用 IFNAR1和IFNGR1下调的溶酶体途径(巴弗洛霉素A1处理恢复表达) Tollip与Nsp14的相互作用(需要C2结构域及C端序列) Tollip敲低对SARS-CoV-2感染细胞中IFNAR1和IFNGR1下调的逆转效应 Nsp14突变体(H268A、D331A)对信号通路和受体表达的表型差异
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Nsp14是否激活NF-κB和MAPK信号通路,并确定所需结构域和酶活性。
在HEK293-hTLR4-MD2-CD14细胞中转染Nsp14及其突变体,通过报告基因和免疫印迹检测NF-κB和MAPK激活。
验证Nsp14是否下调干扰素受体表达,并影响干扰素信号传导。
在Huh7和HEK293T细胞中表达Nsp14-GFP或HA-Nsp14,通过免疫荧光、免疫印迹和报告基因检测IFNAR1、IFNGR1表达及STAT1磷酸化。
确定受体下调是否通过转录或翻译后机制,并鉴定涉及的降解途径。
通过RT-qPCR检测mRNA水平,使用巴弗洛霉素A1和MG132抑制溶酶体和蛋白酶体,并通过去糖基化酶处理分析IFNGR1的糖基化状态。
鉴定Nsp14的宿主相互作用蛋白Tollip,并验证其在Nsp14介导的先天免疫调节中的作用。
通过共免疫沉淀和免疫荧光验证Nsp14与Tollip的相互作用,进行结构域作图,并通过报告基因和siRNA敲低评估Tollip对NF-κB激活和受体下调的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 巴弗洛霉素A1 | Invivogen | tlrl-baf1 |
| MG132 | Sigma-Aldrich | M7449 | |
| 脂多糖 | Invivogen | tlrl-pb5lps | |
| 通用I型干扰素(人IFN-Alpha杂交蛋白) | PBL Assay Science | 11200-1 | |
| 人IFN-γ | PeproTech | 300-02-100ug | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668500 |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778-150 | |
| 报告基因检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1960 |
| 被动裂解缓冲液 | Promega | -- | |
| Agilent BioTek Cytation C10共聚焦成像仪 | Agilent | -- | |
| 共免疫沉淀 | 抗HA磁珠 | Pierce | 88836 |
| 免疫印迹 | Bolt 4-12% Bis-Tris凝胶 | Invitrogen | NW04120BOX |
| PVDF膜 | Sigma-Aldrich | 03010040001 | |
| 5%封闭缓冲液 | Bio-Rad | 1706404 | |
| 蛋白质印迹化学发光HRP底物 | Perkin Elmer | NEL104001EA | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 去糖基化 | Endo H糖苷内切酶 | New England Biolabs | P0702L |
| PNGase F糖苷酶 | New England Biolabs | P0704S | |
| RNA提取 | DirectZol RNA提取试剂盒 | Zymo Research | R2052 |
| 逆转录 | SuperScript IV VILO预混液(含ezDNase) | Invitrogen | 11766050 |
| RT-qPCR | PerfeCTa SYBR Green快速混合液 | Quantabio | 101414-272 |
| Bio-Rad CFX Opus 96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | ProLong Glass防淬灭封片剂(含NucBlue染色) | Thermo Fisher Scientific | P36981 |
| Zeiss LSM980共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss | -- | |
| siRNA敲低 | Tollip SMARTpool siRNA | Dharmacon | L-016930-00-0005 |
| NON-TARGETplus非靶向对照siRNA | Dharmacon | D-001810-01-05 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Nsp14表达和突变体 | 质粒构建、突变位点(ExoN: D90A/E92A, E191A, H268A, D273A; N7-MTase: N306A, D331A)、转染剂量 阅读提示:Materials and Methods: Plasmids; Results: Figure 1A |
| NF-κB和MAPK信号通路检测 | 细胞系(HEK293-hTLR4-MD2-CD14)、LPS浓度、报告基因质粒、转染试剂、处理时间 阅读提示:Materials and Methods: DNA transfection and dual luciferase assays; Results: Figure 1B-C |
| 干扰素受体表达和信号检测 | 细胞系(Huh7, HEK293T)、Nsp14-GFP或HA-Nsp14转染、IFNα/IFNγ浓度、处理时间、抗体 阅读提示:Materials and Methods: Immunoblotting; Results: Figures 2A-B, 3A-D |
| 受体降解机制 | BafA1和MG132浓度及处理时间、去糖基化酶处理条件 阅读提示:Materials and Methods: Deglycosidase treatments; Results: Figure 4B-D |
| Tollip相互作用和功能 | Tollip过表达或siRNA敲低浓度、共转染条件、共免疫沉淀方法 阅读提示:Materials and Methods: Co-immunoprecipitation assays, siRNA gene silencing; Results: Figures 5A-E, 6A-D |
| SARS-CoV-2感染实验 | 病毒株(USA-WA1/2020)、感染复数(MOI=1)、感染时间、细胞系(A549-ACE2)、抑制剂处理 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines and viruses; Results: Figure 7A-D |