鉴定B7H3关键N-糖基化位点
确定哪些N-糖基化位点对B7H3细胞表面定位和稳定性至关重要。
在B7H3敲除细胞系中表达一系列B7H3突变体,通过流式细胞术检测细胞表面表达,通过CHX追踪和泛素化分析评估蛋白质稳定性。
Targeting site-specific N-glycosylated B7H3 induces potent antitumor immunity.
研究包含体外细胞模型(HEK293T、MDA-MB-231、A549等)、体内动物模型(BALB/c、C57BL/6、人源化小鼠)及患者TCGA数据分析,并通过糖基化突变体、抗体验证、机制研究(ERAD)等进行了功能与机制验证。
HEK293T细胞系 MDA-MB-231乳腺癌细胞系 A549肺癌细胞系 BALB/c小鼠移植瘤模型
B7H3糖基化位点突变体(N91/104/309/322Q等) B7H3基因敲除细胞系(HEK293T-B7H3KO等) T细胞共培养及杀伤实验(人T细胞、OT-1 T细胞) 体内肿瘤模型(4T1、E0771、A549异种移植) 抗B7H3抗体(Ab-82、Hu-Ab-82)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定哪些N-糖基化位点对B7H3细胞表面定位和稳定性至关重要。
在B7H3敲除细胞系中表达一系列B7H3突变体,通过流式细胞术检测细胞表面表达,通过CHX追踪和泛素化分析评估蛋白质稳定性。
探究关键位点突变是否影响B7H3的亚细胞定位和转运。
通过免疫荧光染色共定位B7H3与ER、ERGIC和高尔基体标志物,比较WT和突变体的定位差异。
确定突变B7H3是否通过ERAD途径降解。
使用IP-MS分析结合蛋白,用p97抑制剂和MG132处理检测B7H3降解,敲低或敲除HRD1/SEL1L观察B7H3稳定性变化。
体外验证关键N-糖基化位点对B7H3抑制T细胞功能的影响。
将肿瘤细胞与T细胞共培养,检测T细胞增殖、活化和杀伤能力。
评估关键N-糖基化位点是否影响体内抗肿瘤T细胞反应。
将表达不同B7H3突变体的肿瘤细胞植入免疫健全小鼠,比较肿瘤生长和TIL中T细胞活化情况。
开发优先识别N91/309和N104/322糖基化B7H3的单克隆抗体。
通过免疫兔子产生抗体,筛选特异性识别WT和关键位点糖基化突变体B7H3的抗体。
验证Ab-82在体内外的抗肿瘤效果及其诱导B7H3内化降解的机制。
在4T1-hB7H3肿瘤模型和A549人源化模型中评估Ab-82疗效,通过免疫组化分析免疫细胞浸润,并检测B7H3内化和降解。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | 12491015 |
| 胎牛血清 | Gibco | A5670701 | |
| 药物处理 | MG132 | Selleck Chemical | S2619 |
| NMS-873 | Selleck Chemical | S7285 | |
| CB-5083 | Selleck Chemical | S8101 | |
| 去糖基化处理 | PNGaseF | New England Biolab | P0704S |
| 内化实验 | 伯氨喹 | TargetMol | T0850-500 |
| pHrodo Red | Thermo Fisher Scientific | P36011 | |
| 缓冲液 | HEPES | Sigma | V900477 |
| 质粒构建 | ClonExpress II一步克隆试剂盒 | Vazyme | C112-01 |
| 基因敲除 | B7H3 CRISPR/Cas9敲除质粒(人) | Santa Cruz | sc-402032 |
| B7H3 CRISPR/Cas9敲除质粒(小鼠) | Santa Cruz | sc-430440 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668030 |
| 基因敲除 | 对照CRISPR/Cas9质粒 | Santa Cruz | sc-418922 |
| LentiCRISPR V2质粒 | Addgene | 52961 | |
| 转染 | lipofectamine RNAimax | Invitrogen | 13778030 |
| qRT-PCR | PrimeScript RT试剂盒(带gDNA Eraser) | Takara | RR047D |
| ChamQ SYBR qPCR绿色预混液 | Vazyme Biotech Co. | Q311-03 | |
| TRIzol | -- | -- | |
| 动物实验 | 抗小鼠CD4单克隆抗体GK1.5 | Selleck | A2101 |
| 抗小鼠CD8α单克隆抗体2.43 | Selleck | A2102 | |
| 大鼠IgG2b同型对照 | Selleck | A2116 | |
| T细胞分离 | Pan T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-535 |
| T细胞培养 | 白细胞介素-2 | Pepro Tech | 200-02 |
| T细胞激活 | 抗CD3抗体 | BioLegend | 300313 |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 302913 | |
| T细胞培养 | 小鼠白细胞介素-2 | Pepro Tech | 2121220 |
| T细胞杀伤实验 | FITC活性caspase-3凋亡试剂盒 | BD Biosciences | 550480 |
| 流式细胞术 | Cytofix/CytoPerm固定/透化试剂盒 | BD Bioscience | 554714 |
| IV型胶原酶 | Sigma | -- | |
| I型脱氧核糖核酸酶 | Sigma | -- | |
| CFSE | -- | -- | |
| OVA肽(SIINFEKL) | -- | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806s |
| Pierce IP裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag亲和凝胶 | Selleck | B23102 |
| 免疫荧光 | 抗Flag亲和凝胶 | Selleck | B23102 |
| 抗ERGIC-3抗体 | Santa Cruz | sc-514611 | |
| 抗TGN38抗体 | Santa Cruz | sc-166594 | |
| 抗B7H3抗体 | abcam | ab312274 | |
| Alexa Fluor 488偶联抗小鼠IgG | Thermo Scientific | A-11001 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | |
| 抗体生成 | 人4Ig-B7H3-His融合蛋白 | Sino Biological | 11188-H08H |
| 流式细胞术 | Alexa Fluor-647偶联抗兔二抗 | Invitrogen | A21244 |
| 商品化抗B7H3抗体 | eBioscience | 17-2769-42 | |
| 亲和力检测 | Biacore T200 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| 内化实验 | TrypLE Express | GIBCO | 12604013 |
| 细胞增殖 | MTT | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| SpectraMax Plus 384 | MD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源(ATCC)、培养基(DMEM+10%FBS)、培养条件(37°C,5% CO2)、化合物浓度(MG132、NMS-873、CB-5083)、CHX处理时间 阅读提示:Methods - Cell culture and compounds |
| B7H3敲除细胞模型构建 | CRISPR/Cas9质粒来源、转染试剂、筛选方法(嘌呤霉素)、敲除克隆鉴定 阅读提示:Methods - CRISPR–Cas9-mediated gene disruption |
| 关键糖基化位点鉴定 | 质粒构建(B7H3突变体)、转染量、检测方法(流式、免疫印迹) 阅读提示:Methods - Plasmids, Results - Identification of the vital N-glycosylation sites |
| ER-高尔基体转运分析 | 细胞系、荧光标记(mNeogreen、mRuby)、共定位标志物(KDEL、ERGIC、TGN38)、显微镜型号 阅读提示:Methods - Immunofluorescence, Results - The N-glycans attached to N91/302 and N104/322 sites of B7H3 trigger its ER-to-Golgi translocation |
| ERAD验证 | IP-MS条件、p97抑制剂浓度(NMS-873 2μM、CB-5083 5μM)、MG132处理时间、siRNA/sgRNA序列 阅读提示:Methods - Liquid chromatography-mass spectrometry, Results - The N-glycans attached to N91/302 and N104/322 sites of B7H3 block its ERAD |
| T细胞功能实验 | T细胞分离方法、共培养比例、刺激条件(抗CD3/抗CD28)、OVA肽浓度、细胞毒性实验时间 阅读提示:Methods - T lymphocytes preparations, T-cell killing assay |
| 体内动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞接种数量、抗体清除T细胞方案(剂量和时间)、肿瘤测量频率 阅读提示:Methods - Animal treatment protocol |
| 抗体生成与鉴定 | 免疫原(人4Ig-B7H3-His)、免疫方案、单B细胞筛选方法、ELISA条件、SPR亲和力测定 阅读提示:Methods - Generation of Ab-82 and Hu-Ab-82 antibody |
| 抗体内化实验 | pHrodo标记方法、温度变化方案、primaquine浓度(50μM)、时间点 阅读提示:Methods - Internalization assay based on temperature change, pHrodo Red |