临床样本分析
评估S1PR3表达与银屑病严重程度的关系。
收集银屑病患者和健康对照的皮肤活检标本,通过免疫荧光染色和生物信息学分析(scRNA-seq, RNA-seq)检测S1PR3表达与定位。
S1PR3-driven positive feedback loop sustains STAT3 activation and keratinocyte hyperproliferation in psoriasis.
研究包含临床样本(皮肤活检)、细胞系(HaCaT)、基因敲除小鼠、角质形成细胞特异性敲低模型、多种抑制剂和激动剂干预、ChIP-qPCR、RNA-seq、ATAC-seq等,既包含功能验证也包含机制验证。
HaCaT人永生化表皮角质形成细胞 IMQ诱导的银屑病样皮炎小鼠模型 S1pr3基因敲除小鼠 临床银屑病患者皮肤活检样本
临床样本S1PR3表达水平与疾病严重程度的相关性 IMQ诱导小鼠中S1pr3敲除对皮肤炎症和表皮增生的影响 角质形成细胞中S1PR3介导的STAT3激活机制(Gαi/PKA/Src) STAT3直接结合S1PR3启动子的验证(ChIP-PCR) 药理学抑制S1PR3对IMQ诱导皮炎的治疗效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估S1PR3表达与银屑病严重程度的关系。
收集银屑病患者和健康对照的皮肤活检标本,通过免疫荧光染色和生物信息学分析(scRNA-seq, RNA-seq)检测S1PR3表达与定位。
验证S1PR3在角质形成细胞中对STAT3激活和细胞增殖的作用。
使用HaCaT细胞,通过IL-6/IL-22刺激,以及S1PR3抑制剂(TY52156, FTY720)、siRNA敲低、STAT3C过表达等方法,检测STAT3磷酸化水平、增殖标志物和炎症因子表达。
评估S1PR3基因敲除或药理学抑制对IMQ诱导银屑病样皮炎的影响。
对S1pr3敲除小鼠或野生型小鼠经IMQ处理,并使用TY52156或FTY720治疗,通过组织学染色、免疫组化、Western blot和qRT-PCR评估表型和分子变化。
阐明S1PR3介导STAT3激活的具体分子机制。
通过RNA-seq、Western blot、Co-IP和ChIP-PCR等方法,鉴定Src、Gαi/PKA通路在其中的作用,以及STAT3对S1PR3的转录调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 白细胞介素-6 | Sino Biological | 10395-HNAE |
| 白细胞介素-22 | Sino Biological | 13059-HNAE | |
| 芬戈莫德 | MedChemExpress | HY-12005 | |
| TY52156 | MedChemExpress | HY-19736 | |
| Rhosin盐酸盐 | MedChemExpress | HY-12646 | |
| U73122 | MedChemExpress | HY-13419 | |
| Stattic | MedChemExpress | HY-13818 | |
| 替巴尼布林 | Selleck | S2700 | |
| 原钒酸钠 | MedChemExpress | HY-D0852 | |
| 咪喹莫特 | MedChemExpress | HY-B0180 | |
| 动物实验 | 咪喹莫特乳膏 | Mingxinlidi | -- |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化STAT3 (Tyr705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 12640 | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Beyotime | AF1738 |
| 抗细胞角蛋白16抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53255 | |
| 抗细胞角蛋白17抗体 | Cell Signaling Technology | 12509 | |
| 免疫印迹 | 抗CD130抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-28932 |
| 抗S1PR1抗体 | Abcam | ab11424 | |
| 抗S1PR2抗体 | Proteintech | 20442-1-AP | |
| 抗S1PR3抗体 | Abcam | ab108370 | |
| 抗GAPDH抗体 | Bioworld | BS60630 | |
| 免疫组织化学 | 抗CD31抗体 | Servicebio | GB11063-3-100 |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化Src (Y419)抗体 | Abways | CY5468 |
| 抗Src抗体 | Abcam | ab32102 | |
| 抗GAPDH抗体 | Fude | FD0063 | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Vazyme | R401-01 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Vazyme | R302-01 |
| 定量PCR | PowerUp SYBR预混液 | Applied Biosystems | A25742 |
| 转染 | 脂质体RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778030 |
| 质粒提取 | 无内毒素质粒中提试剂盒 | Omega Biotec | D6950 |
| EdU检测 | EdU检测试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| ChIP | 蛋白A/G磁珠 | MedChemExpress | HY-K0202 |
| 质谱 | C18柱 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 银屑病患者和健康对照的来源、样本量、疾病严重程度评分标准 阅读提示:Materials and methods: Clinical skin |
| 细胞培养与处理 | HaCaT细胞代数、培养条件、IL-6/IL-22浓度、抑制剂浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatments |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、IMQ剂量、给药时间、给药方式、S1pr3敲除小鼠品系背景 阅读提示:Materials and methods: Animal studies |
| S1PR3抑制实验 | FTY720给药剂量、TY52156给药剂量、给药途径和处理时长 阅读提示:Materials and methods: Animal studies; Results sections |
| 分子检测 | 抗体批号、稀释比例、蛋白上样量、qRT-PCR引物序列、ChIP实验条件 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis, Quantitative RT-PCR, Chromatin immunoprecipitation assays |