计算预测pAzF掺入位点
确定最优偶联位点以保证高偶联效率和保持蛋白活性。
使用ColabFold预测4D5Albu结构,计算溶剂可及性和突变稳定性,筛选出9个候选位点。
Albubody: an engineered scFv variant platform for site-specific drug conjugation and enhanced tumor efficacy
包含体外细胞实验(细胞毒性、内化、球体穿透)、体内药代、分布、疗效及毒性实验,并进行了机制验证。
HER2阳性乳腺癌细胞系BT-474 HER2阳性乳腺癌细胞系SK-BR-3 HER2阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231 SK-BR-3异种移植小鼠模型
pAzF掺入位点选择(如G235)及其对偶联效率和蛋白稳定性的影响 偶联反应条件(蛋白与DBCO-MMAE摩尔比1:4,4°C过夜) HER2结合亲和力(EC50)和HSA结合效率 体内给药剂量方案(4D5Albu-MMAE给药280、168、84、28 nmol/kg,每3天一次,共4次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定最优偶联位点以保证高偶联效率和保持蛋白活性。
使用ColabFold预测4D5Albu结构,计算溶剂可及性和突变稳定性,筛选出9个候选位点。
制备含pAzF的Albubody变体用于后续偶联。
将pBAD表达载体与pEVOL-pAzF共转化至E. coli C321.ΔA.exp,诱导表达并纯化。
实现位点特异性药物偶联。
纯化的4D5Albu-pAzF与含DBCO的MMAE反应,通过SPAAC形成偶联物。
评估偶联物的HER2结合、细胞毒性、内化和穿透能力。
通过ELISA检测结合亲和力,CCK-8检测细胞毒性,共聚焦显微镜观察内化和球体穿透。
评估Albubody对半衰期和肿瘤蓄积的影响。
在小鼠中注射标记的分子,测定血清浓度和组织荧光。
验证4D5Albu-MMAE的疗效和安全性。
在SK-BR-3异种移植模型中比较不同剂量的肿瘤生长抑制,进行组织学检查。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 计算筛选位点 | 使用AlphaFold2预测结构,溶剂可及性大于80%,突变稳定性高,排除CDR区域 阅读提示:Computational analysis部分 |
| 蛋白表达 | E. coli C321.ΔA.exp菌株,pEVOL-pAzF共转化,1 mM pAzF,0.4%阿拉伯糖,23°C培养16-20h 阅读提示:Expression and purification部分 |
| 偶联反应 | 蛋白与DBCO-MMAE浓度分别为20 μM和80 μM,4°C过夜 阅读提示:Preparation of antibody-drug conjugates部分 |
| 体外细胞毒性 | 细胞密度5000或3000细胞/孔,处理3天,CCK-8检测 阅读提示:In vitro cytotoxicity assay部分 |
| 药代动力学 | BALB/c小鼠,40 nmol/kg静脉注射,采血时间点不同 阅读提示:In vivo pharmacokinetic study部分 |
| 体内疗效 | SK-BR-3异种移植模型,4D5Albu-MMAE剂量28-280 nmol/kg,每3天一次共4次 阅读提示:In vivo antitumor efficacy evaluation部分 |