鉴定14-3-3为SCMC组分
验证14-3-3是否与SCMC在体内及体外结合。
通过阴离子交换色谱和质谱鉴定14-3-3;通过pull-down和Co-IP验证内源结合;通过免疫荧光观察共定位。
The subcortical maternal complex modulates the cell cycle during early mammalian embryogenesis via 14-3-3.
包含体外重建与冷冻电镜结构、细胞共转染与Co-IP、小鼠卵母细胞/受精卵功能实验(Trim-Away、mRNA补充)及人类卵母细胞/胚胎验证等多层级验证。
小鼠GV卵母细胞与受精卵 HEK-293F细胞 Tle6缺失小鼠来源卵母细胞/受精卵 Floped缺失小鼠来源卵母细胞/受精卵 人类卵母细胞与胚胎
TLE6 Ser139和Ser209磷酸化位点:突变后影响与14-3-3结合及胚胎发育 SCMC缺失(Tle6Null或FlopedNull)对14-3-3和CDC25B蛋白水平的影响 14-3-3补充对SCMC缺失受精卵发育的挽救效果 CDC25B补充对TLE6敲低受精卵发育及CDK1活性的挽救效果 SCMC-14-3-3γ冷冻电镜结构:分辨率3.0Å
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证14-3-3是否与SCMC在体内及体外结合。
通过阴离子交换色谱和质谱鉴定14-3-3;通过pull-down和Co-IP验证内源结合;通过免疫荧光观察共定位。
确定14-3-3与SCMC的结合方式。
体外重组SCMC(MATER、TLE6、FLOPED、FILIA)与14-3-3γ复合物,进行冷冻电镜数据采集和结构解析。
验证TLE6特定磷酸化位点是否对14-3-3结合及胚胎发育至关重要。
构建TLE6磷酸化位点突变体,进行Co-IP、ITC;在受精卵中通过Trim-Away敲低TLE6并补充mRNA观察发育。
验证SCMC是否维持14-3-3蛋白水平。
比较Tle6Null或FlopedNull卵母细胞/受精卵中14-3-3蛋白水平;进行mRNA检测;在HEK-293F细胞中测试SCMCcore对14-3-3γ降解的影响;补充14-3-3观察对发育的挽救。
验证14-3-3是否增强SCMC与CDC25B结合。
通过PLA检测TLE6和CDC25B原位互作;在HEK-293F细胞中进行Co-IP检测SCMC与CDC25B结合及14-3-3的促进作用。
验证SCMC是否通过稳定CDC25B调控CDK1活性。
检测Tle6Null或FlopedNull卵母细胞/受精卵中CDC25B蛋白水平、CDK1总水平和Tyr15磷酸化;在TLE6敲低受精卵中补充Cdc25b mRNA观察发育和CDK1活性。
验证人源SCMC是否也存在与14-3-3和CDC25B的分子联系。
在HEK-293F细胞中验证人SCMC与14-3-3γ和CDC25B互作;在人受精卵和胚胎中检测TLE6与14-3-3及CDC25B的定位和互作。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质纯化 | Ni-NTA树脂 | Qiagen | 30250 |
| 免疫共沉淀 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | -- | -- |
| 细胞培养 | SMM 293-TII表达培养基 | Sino Biological | M293TII |
| SIM SF表达培养基 | Sino Biological | MSF1 | |
| 哺乳动物细胞转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966 |
| 昆虫细胞转染 | Cellfectin II试剂 | ThermoFisher Scientific | 10362100 |
| 蛋白质纯化 | 谷胱甘肽琼脂糖4B | GE Healthcare | 17075601 |
| SOURCE 15Q | GE Healthcare | 17094705 | |
| Superose 6 Increase 10/300 GL | GE Healthcare | 29091596 | |
| Superdex 200 Increase 10/300 GL | GE Healthcare | 28990944 | |
| Pull-down | Strep-Tactin树脂 | IBA Life Sciences | 2-4030-025 |
| 免疫沉淀 | Pierce Protein A/G磁珠 | ThermoFisher Scientific | 88802 |
| 免疫印迹 | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| G:BOX Chemi XRQ成像系统 | Syngene | -- | |
| 兔抗14-3-3(pan)抗体 | Cell Signaling Technology | 8312 | |
| 兔抗14-3-3 pan多克隆抗体 | ThermoFisher Scientific | 51-0700 | |
| 小鼠抗NLRP5抗体 | Novus Biologicals | NBP1-76289 | |
| 小鼠抗TLE6抗体 | Abmart | M034864 | |
| 兔抗TLE6抗体 | Abmart | PU440858 | |
| 小鼠抗CDC25B单克隆抗体 | Proteintech | 67145-1-Ig | |
| 兔抗CDK1特异性多克隆抗体 | Proteintech | 19532-1-AP | |
| 兔抗磷酸化cdc2 (Tyr15)抗体 | Cell Signaling Technology | 9111S | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 兔抗DDDDK标签单克隆抗体 | ABclonal | AE063 | |
| 兔抗HA标签多克隆抗体 | ABclonal | AE036 | |
| 小鼠抗strep标签单克隆抗体 | Huaxingbio | HX1816 | |
| HRP标记兔抗β-Actin单克隆抗体 | ABclonal | AC028 | |
| HRP标记山羊抗豚鼠IgG(H+L) | ABclonal | AS025 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (HRP) | ZenBio | 511103 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) | ZenBio | 511203 | |
| 细胞培养 | G-MOPS plus培养基 | Vitrolife | 10130 |
| 胚胎培养 | G1-plus培养基 | Vitrolife | 10128 |
| G2-plus培养基 | Vitrolife | 10132 | |
| 卵母细胞采集 | M2培养基 | Sigma-Aldrich | M7167 |
| 小鼠促排卵 | 孕马血清促性腺激素 | Nanjing Aibei Biotechnology | M2630 |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Nanjing Aibei Biotechnology | M2530 | |
| 体外受精 | 改良Krebs-Ringer碳酸氢盐培养基(TYH) | Nanjing Aibei Biotechnology | M2030 |
| 人输卵管液培养基(HTF) | Nanjing Aibei Biotechnology | M1130 | |
| 胚胎培养 | KSOM培养基 | Nanjing Aibei Biotechnology | M1430 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma–Aldrich | 9036-19-5 |
| 牛血清白蛋白 | Biofroxx | 4240GR025 | |
| 染色 | DAPI | Beyotime | C1006 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠IgG(H+L) | Jackson ImmunoResearch | 115-545-062 |
| 罗丹明Red-X标记山羊抗兔IgG(H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-295-144 | |
| 抗体标记 | Apex Alexa Fluor 647抗体标记试剂盒 | ThermoFisher Scientific | 10359016 |
| Alexa Fluor 488抗体标记试剂盒 | ThermoFisher Scientific | A20181 | |
| 冷冻电镜 | Titan Krios Gi3冷冻电镜 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Gatan K3 Summit探测器 | Gatan | -- | |
| GIF Quantum能量过滤器 | Gatan | -- | |
| 冷冻电镜样品制备 | Quantifoil Au200 R1.2/1.3载网 | Quantifoil | -- |
| Vitrobot Mark IV | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 质谱分析 | Q Exactive Plus质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
| EASY-nanoLC 1200系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Q Exactive HF-X质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 等温滴定量热 | MicroCal ITC200等温滴定量热仪 | Malvern | -- |
| mRNA体外转录 | SP6 message mMACHINE试剂盒 | ThermoFisher Scientific | AM1340 |
| 卵母细胞培养 | 异丁基甲基黄嘌呤 | GLPBIO | GC11730 |
| 抑制剂处理 | H89 | Selleck | S1582 |
| 邻近连接分析 | Duolink PLA荧光检测 | Sigma-Aldrich | -- |
| qRT-PCR | EasyScript一步法基因组DNA去除和cDNA合成预混液 | Transgene | AE311-03 |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q311-02 | |
| CFX Connect实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| DNA合成检测 | BeyoClick EdU细胞增殖检测试剂盒(Alexa Fluor 488) | Beyotime | C0071 |
| DNA染色 | Hoechst 33342 | -- | -- |
| 统计 | GraphPad Prism | GraphPad Software, Inc. | -- |
| 蛋白质纯化 | 抑肽酶 | Sangon Biotech | A600153 |
| 胃蛋白酶抑制剂A | Sangon Biotech | A610583 | |
| 亮抑酶肽 | Sangon Biotech | A600580 | |
| 咪唑 | Sigma–Aldrich | 288-32-4 | |
| 二硫苏糖醇 | INALCO | 1758-9030 | |
| 蛋白质表达 | 异丙基β-D-硫代半乳糖苷 | BLUEPUS | 3001858 |
| 蛋白质纯化 | 还原型谷胱甘肽 | -- | -- |
| Nonidet P-40去垢剂 | Sangon Biotech | A600385-0100 | |
| 免疫沉淀 | 生物素 | -- | -- |
| Flag肽 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | 吐温-20 | Sigma-Aldrich | 9005-64-5 |
| 脱脂奶粉 | -- | -- | |
| ECL化学发光底物 | Biosharp | BL520B | |
| qRT-PCR | 脱氧核苷三磷酸 | TIANGEN | CD111-03 |
| RNA酶抑制剂 | Sangon Biotech | B600478 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 冷冻电镜结构解析 | SCMC-14-3-3γ复合物组装方法、蛋白片段、分辨率 阅读提示:Methods: Recombinant protein expression and purification、Cryo-electron microscopy sample preparation and data collection |
| TLE6磷酸化突变体构建 | TLE6突变体种类(S139A、S209A等) 阅读提示:Results: Site-specific phosphorylation of TLE6 is essential for 14-3-3 recruitment, Fig. 2d |
| 受精卵Trim-Away | Trim21 mRNA、抗TLE6或抗pan 14-3-3抗体、注射时间 阅读提示:Methods: In vitro transcription and microinjection of oocytes and zygotes |
| 胚胎发育评估 | 观察时间点(24, 48, 72, 96 h pMI)、发育阶段分类 阅读提示:Figure legends: Fig. 2f, Fig. 3i, Fig. 5i |
| SCMC缺失模型 | Tle6Null和FlopedNull小鼠品系 阅读提示:Methods: Mouse lines |
| DNA合成检测 | EdU处理时间窗口、浓度(10 μM) 阅读提示:Methods: Measurement of DNA synthesis in embryos |