鉴定14-3-3ζ为PDAC化疗耐药关键因子
寻找与PDAC不良预后和化疗耐药相关的关键分子
分析TCGA中PDAC转录组和蛋白质组,结合患者队列IHC,确认14-3-3ζ高表达与不良生存相关;构建KPC-ζfl/fl小鼠,观察吉西他滨治疗反应。
Targeting a chemo-induced adaptive signaling circuit confers therapeutic vulnerabilities in pancreatic cancer.
包含体外共培养、体内小鼠模型(KPC、原位移植瘤)、患者样本分析、scRNA-seq等多层级验证,并进行功能与机制研究。
KPC小鼠模型 Panc02原位移植瘤模型 PANC-1、Capan-1等PDAC细胞系 人胰腺星状细胞和NIH3T3成纤维细胞
细胞系中14-3-3ζ表达状态(敲低或过表达) Yap1和Cox2的靶向方式(shRNA、siRNA或药物抑制剂) 吉西他滨处理浓度及时间 体内实验中药物剂量及给药途径 患者队列中他汀类药物和Cox2抑制剂的使用情况
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找与PDAC不良预后和化疗耐药相关的关键分子
分析TCGA中PDAC转录组和蛋白质组,结合患者队列IHC,确认14-3-3ζ高表达与不良生存相关;构建KPC-ζfl/fl小鼠,观察吉西他滨治疗反应。
探究14-3-3ζ介导的化疗耐药是否通过肿瘤-基质互作中的Yap1和Cox2信号
通过共培养、Western blot、免疫荧光和RPPA检测,观察吉西他滨处理下PDAC细胞及成纤维细胞中Yap1和Cox2的表达变化。
确定同时靶向癌细胞Yap1和基质Cox2是否能逆转化疗耐药
在体外共培养和体内原位移植瘤模型中,通过shRNA或药物(PPIX、Cel)靶向Yap1和Cox2,评估对吉西他滨疗效的影响。
揭示应激诱导Yap1激活的分子机制及旁分泌信号
通过免疫沉淀、Western blot、ChIP-qPCR等,证明应激稳定NLK蛋白,促进Yap1 S128磷酸化,解除14-3-3ζ结合,促进Yap1核转位并上调CXCL2/5表达。
确定PDAC细胞分泌的CXCL2/5是否通过CXCR2-mTORC2-Cox2通路激活成纤维细胞,并反馈促进肿瘤细胞存活
用重组CXCL2/5或CM处理成纤维细胞,检测Cox2、PGE2水平及下游信号;通过敲低CXCR2或Rictor,验证通路依赖性,并检测PGE2对PDAC细胞增殖的影响。
评估Yap1和Cox2信号轴在人类PDAC中的临床相关性及联合用药的生存获益
IHC染色患者肿瘤组织,分析14-3-3ζ、Yap1、Cox2表达相关性;回顾性分析MDACC患者使用他汀和Cox2抑制剂的情况与生存期的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 吉西他滨盐酸盐 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 塞来昔布 | LC laboratories | -- | |
| 原卟啉IX | Sigma-Aldrich | -- | |
| 洛伐他汀 | ACROS Organics | -- | |
| 阿司匹林 | ACROS Organics | -- | |
| 蛋白检测 | PGE2 ELISA试剂盒 | R&D systems | -- |
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| Cultrex低生长因子基底膜提取物 | R&D systems | -- | |
| 细胞培养小室(12孔,1 µm孔径) | Greiner Bio-One | -- | |
| 细胞处理 | 重组小鼠CXCL2 | R&D systems | -- |
| 重组小鼠CXCL5 | R&D systems | -- | |
| Western blot | Yap1抗体(4912, 14074) | Cell Signaling Technology | 4912 |
| Cox2抗体(12282) | Cell Signaling Technology | 12282 | |
| NLK抗体(94350) | Cell Signaling Technology | 94350 | |
| 14-3-3ζ抗体(sc-1019) | Santa Cruz Biotechnology | sc-1019 | |
| GAPDH抗体(sc-32233) | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 免疫沉淀 | 抗HA磁珠 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin-V-FLUOS染色试剂盒 | Roche Life Science | -- |
| BD Pharmingen FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD biosciences | -- | |
| RNA提取和逆转录 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| RT-qPCR | iQ SYBR Green Supermix | Bio-Rad | -- |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ChIP-qPCR | Zymo-Spin ChIP试剂盒 | Zymo Research | -- |
| 细胞因子检测 | Milliplex MAP小鼠细胞因子/趋化因子磁珠panel | Millipore | -- |
| 体内实验 | 4.7 T小动物MRI系统 | MDACC small animal imaging facility | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养条件、应激条件(低血清、吉西他滨浓度和时间) 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines, plasmids, shRNA, and siRNA; Cell growth and apoptosis assay |
| 基因敲低/过表达 | shRNA/siRNA靶序列、转染方法、筛选标记 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines, plasmids, shRNA, and siRNA |
| 体外共培养 | 共培养比例、3D培养条件、基质胶浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell growth and apoptosis assay |
| 体内动物实验 | 小鼠品系、细胞注射数量、给药剂量和途径、治疗时间点 阅读提示:Materials and Methods: In vivo experiments |
| 患者数据分析 | 患者纳入标准、用药信息(他汀、Cox2抑制剂)、生存期计算方法 阅读提示:Materials and Methods: EHR analysis; Results: Patient cohort analysis |