抗体筛选与亲和力成熟
从酵母展示人抗体文库中筛选出特异性结合CD16a而低/不结合CD16b的抗体克隆。
使用重组CD16a和CD16b ECD进行酵母展示筛选,获得初始克隆A2,随后进行亲和力成熟获得#1A2和#2-2A2。
Identification of novel anti-CD16a antibody clones for the development of effective natural killer cell engagers.
研究包含抗体筛选与亲和力成熟、体外结合检测(ELISA、BLI)、表位作图和突变分析、原代NK细胞和中性粒细胞结合实验、多种双特异性抗体介导的体外细胞毒性及细胞因子释放实验,证据层级独立且包含功能验证。
人NK细胞 CD16表达293细胞 Raji细胞 NALM6细胞
CD16a-F和V变体的重组蛋白及细胞系 CD16b-NA1和NA2变体的交叉反应性 存在10 mg/mL人IgG时的结合竞争 NK细胞与靶细胞的效靶比(5:1)和孵育时间(20小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从酵母展示人抗体文库中筛选出特异性结合CD16a而低/不结合CD16b的抗体克隆。
使用重组CD16a和CD16b ECD进行酵母展示筛选,获得初始克隆A2,随后进行亲和力成熟获得#1A2和#2-2A2。
评估抗体克隆对CD16a和CD16b各变体的结合亲和力和特异性。
通过ELISA和BLI测量抗体克隆与重组CD16的结合,并在存在或不存在10mg/mL人IgG的条件下检测。
确定抗体克隆在CD16a上的结合表位及其与Fc结合位点的关系。
通过表位分箱和点突变分析,确定结合依赖于Y158残基,且与3G8抗体的表位不重叠。
验证抗体克隆与原代NK细胞和中性粒细胞的结合特性。
将抗体克隆与原代NK细胞和中性粒细胞孵育,在有无hIgG下检测结合。
评估双特异性NK细胞衔接器介导的肿瘤细胞杀伤效果。
构建靶向CD16a和CD19(或BCMA、Her2)的BiKE、BiKE-IgG4和IgG-like BsAb,与原代NK细胞和肿瘤细胞共培养,测定杀伤率。
验证NK细胞衔接器激活NK细胞并导致细胞因子释放。
将BiKE-IgG4与NK细胞和NALM6细胞共培养,检测培养上清中IFN-γ和TNF的水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质生产 | CD16a-F176胞外域 | Acrobiosystems | CDA-H82E8 |
| CD16a-V176胞外域 | Acrobiosystems | CDA-H82E9 | |
| CD16b-NA1胞外域 | Acrobiosystems | CDB-H82E4 | |
| CD16b-NA2胞外域 | Acrobiosystems | CDB-H82Ea | |
| 食蟹猴CD16胞外域 | Acrobiosystems | FC6-C52H9 | |
| 生物素化人CD32a胞外域 | Acrobiosystems | CDA-H82E6 | |
| 生物素化人CD32b胞外域 | Acrobiosystems | CDB-H82E0 | |
| 生物素化人CD64胞外域 | Acrobiosystems | FCA-H82E8 | |
| CD16a-F表达质粒 | Sino Biological | HG10389-UT | |
| CD16b-SH表达质粒 | Sino Biological | HG11046-UT | |
| pcDNA3.4载体 | Life Technologies | -- | |
| Gibson组装预混液 | New England Biolabs | E2611 | |
| 蛋白质纯化 | 蛋白A树脂 | Cytiva | 17519902 |
| 镍树脂 | ThermoFisher Scientific | 88221 | |
| HiLoad 16/600 Superdex 200 pg 层析柱 | Sigma-Aldrich | 28-9893-35 | |
| 蛋白质分析 | 高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| SEC单克隆抗体柱 | BioResolve | 186009439 | |
| 细胞培养 | Raji细胞 | ATCC | CCL-86 |
| NALM6细胞 | ATCC | CRL-3273 | |
| H929细胞 | ATCC | CRL-3580 | |
| SKBR3细胞 | ATCC | HTB-30 | |
| RPMI-1640培养基 | ThermoFisher Scientific | 11875-085 | |
| McCoy's 5A培养基 | ATCC | 30-2007 | |
| 胎牛血清 | ThermoFisher Scientific | 10437028 | |
| 超低IgG胎牛血清 | ThermoFisher Scientific | 16250078 | |
| NK细胞分离 | 原代NK细胞 | Astarte Biologics | PB56NV-2 |
| 原代NK细胞 | ALLCELLS | 260370.9 | |
| 蛋白质生产 | Expi293F细胞 | ThermoFisher Scientific | A14635 |
| ExpiCHO-S细胞 | ThermoFisher Scientific | A29133 | |
| Expi293F培养基 | ThermoFisher Scientific | A14351-01 | |
| ExpiCHO-S培养基 | ThermoFisher Scientific | A29100-01 | |
| ELISA | 96孔高结合微孔板 | Greiner | 655061 |
| HRP标记的山羊抗人κ轻链抗体 | Bethyl Laboratories | A80-115A | |
| HRP标记的山羊抗人λ轻链抗体 | Bethyl Laboratories | 80-116A | |
| HRP标记的山羊抗人Fcγ片段抗体 | Jackson ImmunoResearch | 109-035-008 | |
| HRP标记的链霉亲和素 | Jackson ImmunoResearch | 016-030-084 | |
| FilterMax F5酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| BLI | Gator Prime系统 | Gator Bio | -- |
| Gator抗人IgG Fc生物传感器 | Gator Bio | PL168-160003 | |
| 链霉亲和素生物传感器 | Gator Bio | 160002 | |
| 竞争实验 | 人多克隆IgG | Athens Research & Technology | 16-16-090,707 |
| BLI | 3G8抗体 | BioLegend | 302002 |
| 细胞结合实验 | FITC标记的山羊抗人Fc F(ab)2片段 | Invitrogen | A24477 |
| Alexa Fluor 647偶联的兔抗His标签单克隆抗体(D3I1O) | Cell Signaling Technology | 14931 | |
| APC标记的链霉亲和素 | Jackson ImmunoResearch | 016-130-084 | |
| FITC标记的3G8抗体 | ThermoFisher Scientific | MHCD1601 | |
| 96孔IntelliCyt iQue Screener PLUS流式细胞仪 | Sartorius | -- | |
| NK细胞分离 | 淋巴细胞分离液 | Stemcell Technologies | 07851/07861 |
| SepMate-50分离管 | Stemcell Technologies | 85450 | |
| NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-657 | |
| CD56抗体 | ThermoFisher Scientific | MHCD5604 | |
| CD16抗体 | ThermoFisher Scientific | MHCD1601 | |
| CD3抗体 | BD Biosciences | 555329 | |
| 基因分型 | Puregene血液核心试剂盒A | Qiagen | 1042604 |
| JumpStart Taq DNA聚合酶 | Sigma | D9307 | |
| 中性粒细胞分离 | EasySep中性粒细胞分离试剂盒 | Stemcell Technologies | 19666 |
| APC标记的HI98克隆(抗CD15) | BioLegend | 301908 | |
| PE标记的CD16克隆3G8 | BioLegend | 302056 | |
| 细胞毒性实验 | 羧基荧光素琥珀酰亚胺酯 | Invitrogen | C34554 |
| 96孔组织培养处理测定板 | Corning Incorporated | 3610 | |
| CountBright绝对计数微球 | Invitrogen | C36950 | |
| ADCC报告实验 | ADCC报告生物测定核心试剂盒 | Promega | G7010 |
| Bio-Glo荧光素酶检测底物 | Promega | -- | |
| 细胞因子释放实验 | 人IFN-γ Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | DIF50C |
| 人TNF Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | DTA00D |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体筛选 | 筛选库类型、CD16a和CD16b ECD蛋白来源及浓度 阅读提示:Materials and Methods: Production of recombinant CD16 and antibodies; Results: Identification of a specific anti-CD16a antibody clone |
| 结合动力学 | BLI传感器类型、是否使用生物素化CD16、加入hIgG的浓度和时间 阅读提示:Materials and Methods: Determination of binding kinetics and competition using BLI; Figure 3 legend |
| 表位作图 | CD16a突变体G147D和Y158H的构建和表达 阅读提示:Results: Defining the #1A2 and #2-2A2 epitope binding site on CD16a; Figure 4 legend |
| 细胞结合实验 | NK细胞和中性粒细胞的供体数量、基因型、细胞密度、抗体孵育时间、hIgG浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell binding assays and flow cytometric analysis; Results: Binding activity to primary NK cells and neutrophils; Figure 5 legend |
| 体外细胞毒性实验 | 靶细胞系、效靶比、孵育时间、CFSE和7-AAD浓度、读板仪器 阅读提示:Materials and Methods: Cytotoxicity and ADCC reporter assays; Figure 7 legend |
| 细胞因子释放 | 靶细胞和NK细胞比例、孵育时间、细胞因子检测试剂盒 阅读提示:Materials and Methods: Cytokine release assay; Figure 9 legend |