验证体内TNF-α依赖性CEACAM1上调
验证衰老相关的内皮CEACAM1上调是否依赖TNF-α。
比较2月龄和9月龄WT及Tnf−/−小鼠胸主动脉切片的CEACAM1免疫荧光染色。
Vascular inflammaging: Endothelial CEACAM1 expression is upregulated by TNF-α via independent activation of NF-κB and β-catenin signaling.
体内基因敲除小鼠验证、体外细胞系和原代细胞功能实验、药理和siRNA机制干预、免疫共沉淀和核转位分析。
野生型及TNF-α敲除小鼠主动脉内皮细胞 EA.hy926内皮细胞系 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)
TNF-α刺激浓度50 ng/mL及时间点(24h、48h) NF-κB抑制剂Bay11-7085浓度10 μM β-catenin抑制剂PNU-74654浓度20 μM Akt抑制剂MK-2206浓度2 μM TCF4 siRNA敲低效率约65%
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证衰老相关的内皮CEACAM1上调是否依赖TNF-α。
比较2月龄和9月龄WT及Tnf−/−小鼠胸主动脉切片的CEACAM1免疫荧光染色。
确定TNF-α在体外上调CEACAM1的时间过程及涉及的信号通路。
EA.hy926细胞用TNF-α(50 ng/mL)刺激0、6、24、48小时,检测CEACAM1蛋白表达;使用NF-κB抑制剂Bay11-7085、β-catenin抑制剂PNU-74654、Akt抑制剂MK-2206处理,观察对CEACAM1表达的影响。
验证TNF-α诱导的CEACAM1延迟上调是否依赖β-catenin信号。
通过siRNA敲低TCF4,检测CEACAM1表达变化;同时检测β-catenin靶基因CCND1、AXIN2、MYC的转录。
验证TNF-α诱导的CEACAM1转录是否需要新蛋白合成。
在放线菌酮(100 nM)存在下,检测TNF-α(50 ng/mL)刺激24h和48h后CEACAM1 mRNA和蛋白水平。
验证TNF-α导致β-catenin从粘附连接释放并核转位。
用免疫共沉淀(β-catenin抗体沉淀)检测VE-cadherin共沉淀量变化;分离核提取物检测核内β-catenin水平;Transwell实验检测内皮通透性。
验证TNF-α是否通过Akt激酶调节β-catenin稳定性及转录活性。
检测TNF-α刺激后Akt(Ser473)、GSK3β(Ser9)、β-catenin(Ser552)的磷酸化水平;使用AKT抑制剂MK-2206验证其依赖性。
验证NF-κB和β-catenin通路是否独立发挥作用。
检测MK-2206存在下TNF-α诱导的NF-κB激活(p65磷酸化、IκB降解);检测Bay11-7085存在下TNF-α诱导的β-catenin Ser552磷酸化。
在HUVEC中确认主要结果的可靠性和普适性。
HUVEC用TNF-α(50 ng/mL)刺激,检测CEACAM1表达、抑制剂的效应及NF-κB、β-catenin、VE-cadherin的亚细胞定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| B6.129S-Tnftm1Gkl/J小鼠 | The Jackson Laboratory | -- | |
| 细胞培养 | EA.hy926细胞系 | CLS Cell Lines Service | -- |
| 人脐静脉内皮细胞 | Cell Lines Service | -- | |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher | -- | |
| 胎牛血清 | Biochrom GmbH | -- | |
| 内皮细胞生长培养基MV | PromoCell | -- | |
| 药物处理 | TNF-α | Thermo Fisher | -- |
| Bay11-7085 | Cayman Chemical | -- | |
| PNU-74654 | Absource Diagnostics GmbH | -- | |
| MK-2206 | Biomol GmbH | -- | |
| 转染 | TCF4 siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-43525 |
| 对照siRNA-A | Santa Cruz Biotechnology | sc-37007 | |
| siRNA转染试剂 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| siRNA转染培养基 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G UltraLink树脂珠 | Thermo Fisher | -- |
| 免疫印迹 | 抗pS473-Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 |
| 免疫印迹/免疫荧光 | 抗β-catenin抗体 | BD Biosciences | BD-610153 |
| 免疫沉淀 | 抗β-catenin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7963 |
| 免疫印迹 | 抗pS552-β-catenin抗体 | Cell Signaling Technology | 5651 |
| 抗CEACAM1抗体 | Cell Signaling Technology | 14771 | |
| 免疫荧光 | 抗CEACAM1抗体 | Sino Biological | 50571-R030 |
| 免疫印迹 | 抗Fibrillarin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-374022 |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| 抗pS9-GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9323 | |
| 免疫组化 | 抗4-HNE抗体 | Bioss | BS-6313R |
| 免疫印迹 | 抗IκB-α抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1643 |
| 抗pS536-p65 NF-κB抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 免疫荧光 | 抗NF-κB p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8008 |
| 免疫印迹 | 抗TCF4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166699 |
| 免疫组化 | 抗TNF-α抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-52746 |
| 免疫印迹 | 抗β-tubulin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-58886 |
| 免疫印迹/免疫荧光 | 抗VE-cadherin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9989 |
| 免疫印迹 | 二抗 | Dako (Agilent Technologies) | -- |
| 二抗 | Pierce (Thermo Fisher) | -- | |
| 核提取 | 细胞过滤器 | pluriSelect | -- |
| RIPA裂解液 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| Transwell实验 | 24孔细胞培养插入小室(PET膜,1 μm孔径) | Cellqart, Sabeu | -- |
| FITC-葡聚糖(70 kDa) | Merck | -- | |
| FLUOstar Omega酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| 组织染色 | Direct Red 80 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA提取 | Qiazol裂解液 | Qiagen | -- |
| RT-PCR | DNase I | Promega | -- |
| SuperScript II逆转录酶 | Thermo Fisher | -- | |
| GoTaq qPCR预混液 | Promega | -- | |
| PCR引物 | Invitrogen (Thermo Fisher) | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系(WT和Tnf−/−)、年龄(2个月和9个月)、饲养条件、伦理审批 阅读提示:Methods 2.1 动物实验 |
| 细胞培养 | 细胞系(EA.hy926和HUVEC)、培养基、血清浓度、培养条件、细胞代数 阅读提示:Methods 2.2 细胞培养 |
| 药物处理 | TNF-α浓度(50 ng/mL)、刺激时间(24h、48h等)、抑制剂浓度(Bay11-7085 10 μM、PNU-74654 20 μM、MK-2206 2 μM)、抑制剂预处理时间(24h) 阅读提示:Methods 2.2 细胞培养 |
| TCF4敲低 | siRNA序列(sc-43525)、转染试剂、转染时间、敲低效率(约65%)、TNF-α刺激时间(48h) 阅读提示:Methods 2.3 siRNA介导的TCF4敲低 |
| 免疫沉淀 | 裂解液成分、蛋白量(500 μg)、抗体量(2 μg)、孵育条件、洗涤步骤 阅读提示:Methods 2.4 免疫沉淀和免疫印迹 |
| 核提取 | 裂解缓冲液配方、离心条件、细胞过滤器孔径(40 μm和20 μm) 阅读提示:Methods 2.5 核提取 |
| Transwell通透性实验 | Transwell膜孔径(1 μm)、FITC-dextran浓度(1 mg/mL)、检测波长(485/520 nm) 阅读提示:Methods 2.6 Transwell实验 |
| 实时定量PCR | 引物序列、PCR循环参数、内参基因(GAPDH) 阅读提示:Methods 2.9 实时定量RT-PCR,表2 |