单细胞RNA测序鉴定双表型淋巴细胞
在小鼠骨髓、淋巴结和外周血中无偏见地识别共表达T和B细胞标志物的淋巴细胞亚群。
分离小鼠骨髓、淋巴结和外周血淋巴细胞,进行两轮单细胞RNA和免疫组库测序,整合分析后聚类鉴定细胞亚群。
A biphenotypic lymphocyte subset displays both T- and B-cell functionalities.
包含单细胞RNA测序和流式细胞术验证(体外模型和原代细胞),并进行了功能实验(TCR/BCR刺激)和体内疫苗免疫实验,证据层级独立。
小鼠CD3+CD19+双表型淋巴细胞(C57BL/6J和BALB/c) 小鼠脾细胞(功能实验) 人类外周血单个核细胞(PBMC)
样本新鲜分离处理(所有样本新鲜分离,避免存放影响表型) 使用CD3和CD19抗体克隆及荧光素标记组合(两套CD3和CD19抗体克隆,不同荧光素) 刺激条件:抗CD3/CD28(1μg/mL抗CD3,3μg/mL抗CD28)、抗IgM(10μg/mL)或R10培养,刺激时间7小时(小鼠) 免疫方案:SARS-CoV-2 S1 DNA疫苗(50μg/鼠),肌肉注射,间隔2周,共3次,第3次后4周检测 统计方法:t检验,P<0.05为显著(用于流式分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在小鼠骨髓、淋巴结和外周血中无偏见地识别共表达T和B细胞标志物的淋巴细胞亚群。
分离小鼠骨髓、淋巴结和外周血淋巴细胞,进行两轮单细胞RNA和免疫组库测序,整合分析后聚类鉴定细胞亚群。
用流式细胞术和免疫荧光证实CD3+CD19+细胞在小鼠组织中的存在,并分析其表面标志物表达。
从新鲜分离的小鼠骨髓、淋巴结、脾脏和外周血中染色CD3和CD19,分析CD3+CD19+细胞频率,并检测其他T/B细胞标志物表达;同时进行免疫荧光成像和CD5共表达分析。
测试CD3+CD19+细胞是否响应TCR和BCR刺激,并具有T和B细胞功能。
将小鼠脾细胞用抗CD3/CD28或抗IgM刺激,检测CD69表达和细胞因子(IFN-γ、IL-2、TNF-α)产生。
测试双表型淋巴细胞是否参与疫苗诱导的抗原特异性免疫应答。
用编码SARS-CoV-2 S1蛋白的DNA疫苗免疫小鼠,三次免疫后检测脾细胞中S1特异性细胞因子分泌细胞和S1结合B细胞的频率。
验证人外周血中是否存在CD3+CD19+细胞并具有类似功能。
从健康人外周血分离PBMC,用流式细胞术检测CD3+CD19+细胞频率,并用抗人CD3/CD28或抗人IgG/IgM刺激检测CD69表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 单细胞RNA测序 | 小鼠品系和性别(C57BL/6J雌性);组织来源(骨髓、淋巴结、外周血);细胞分选方法(BD FACSAria III);制备试剂盒(10x Genomics 5' kit) 阅读提示:Methods:Single cell RNA sequencing and T/B cells immune repertoire profiling |
| 流式分析表型确认 | 样本新鲜分离;抗体克隆和荧光素组合(CD3和CD19两套抗体组合);样品处理时间 阅读提示:Methods:Flow cytometric analysis; Results: Flow cytometry assays 部分 |
| 细胞刺激实验 | 刺激物及浓度(抗CD3 1μg/mL, 抗CD28 3μg/mL, 抗IgM 10μg/mL);刺激时间(7小时);布雷菲德菌素A浓度(1μg/ml)和加入时间 阅读提示:Methods:Cell stimulation; Results: CD3+CD19+ cells displayed functional characteristics 部分 |
| 疫苗接种实验 | 小鼠品系和年龄(6-8周龄雌性C57BL/6J);疫苗剂量(50μg/鼠);接种途径(肌肉注射);免疫次数和间隔(3次,间隔2周);检测时间点(第3次后4周) 阅读提示:Methods:Mouse vaccination; Results: 图5 |
| 人PBMC实验 | 外周血样本来源(健康成人);PBMC分离方法(Ficoll密度梯度);刺激条件(抗人CD3 1μg/mL, 抗人CD28 3μg/mL, 抗人IgG/IgM 10μg/mL);刺激时间(4小时) 阅读提示:Methods:Collection and detection of human peripheral blood samples |