细胞系构建与验证
建立AZGP1敲除和过表达的前列腺癌细胞系,以研究其在细胞功能中的作用
使用慢病毒系统在LNCaP、PC3、DU145、LNCaP和LuCaP147细胞中敲除或过表达AZGP1,并通过Western blot和qPCR验证表达水平。
AZGP1 deficiency promotes angiogenesis in prostate cancer.
包含细胞增殖、迁移、侵袭实验,基因敲除小鼠组织学分析,异种移植瘤模型,蛋白质组学,人组织芯片验证。
PC3细胞和DU145细胞异种移植瘤模型 AZGP1敲除小鼠 HUVEC细胞体外血管生成模型 人前列腺癌组织微阵列
AZGP1敲除和过表达细胞系的构建与验证 异种移植瘤模型中AZGP1对肿瘤生长和微血管密度的影响 AZGP1对HUVEC增殖、迁移、管形成的影响 人前列腺癌组织中AZGP1表达与微血管密度的相关性 蛋白质组学分析鉴定血管生成相关蛋白的变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立AZGP1敲除和过表达的前列腺癌细胞系,以研究其在细胞功能中的作用
使用慢病毒系统在LNCaP、PC3、DU145、LNCaP和LuCaP147细胞中敲除或过表达AZGP1,并通过Western blot和qPCR验证表达水平。
评估AZGP1表达变化对前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
通过细胞增殖实验、集落形成实验、伤口愈合实验、Transwell迁移和侵袭实验评估AZGP1敲除或过表达的影响。
研究AZGP1缺失对正常小鼠前列腺形态和间质组成的影响
收集AZGP1−/−和野生型小鼠在2、6、10个月的前列腺组织,进行H&E、Sirius red和CD31免疫荧光染色。
评估AZGP1过表达对前列腺癌肿瘤生长和血管生成的影响
将对照或AZGP1过表达的PC3和DU145细胞皮下植入NSG小鼠,监测肿瘤体积和重量,并通过CD31免疫组化评估微血管密度。
鉴定AZGP1过表达后肿瘤中蛋白质表达变化,特别是与血管生成相关的蛋白
对对照和AZGP1过表达的PC3异种移植瘤进行质谱分析,比较蛋白表达差异并进行通路富集分析。
验证AZGP1对内皮细胞功能(增殖、迁移、管形成)的直接抑制作用
用重组AZGP1蛋白处理HUVECs,分别评估增殖(LDH法)、迁移(Transwell)和管形成(Matrigel)能力。
验证AZGP1表达与微血管密度在临床样本中的相关性
使用含215例前列腺癌样本的组织微阵列,通过多重免疫荧光染色定量AZGP1表达和微血管密度,并分析相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Invitrogen Inc. | -- |
| DMEM培养基 | Invitrogen Inc. | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 人大血管内皮细胞基础培养基 | ThermoFisher Scientific | M200500 | |
| 低血清生长添加物 | ThermoFisher Scientific | S00310 | |
| StemPro® hESC SFM培养基 | Invitrogen Inc. | -- | |
| R1881 | -- | -- | |
| Y-27632 | -- | -- | |
| 质粒和抗体 | 对照sgRNA | Applied Biological Materials USA Inc. | K010 |
| sgAZGP1质粒 | Applied Biological Materials USA Inc. | 12907111 | |
| 对照GFP | Sino Biologicals US Inc. | LVCV-0 | |
| AZGP1 cDNA | Sino Biologicals US Inc. | HG13242-ACGLN | |
| Western blot | 抗AZGP1抗体 | OriGene | -- |
| 免疫组化 | 抗Ki67 | Cell Signaling | 12202 |
| 抗CD31 | Abcam | ab182981 | |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 质粒提取 | E.Z.N.A.®质粒DNA大提试剂盒 | Omega Bio-tek | -- |
| 病毒纯化 | PEG-it™病毒沉淀溶液 | System Biosciences | -- |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-PCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞增殖 | Accutase | Innovative Cell Technologies | AT104 |
| CellTiter-Glo® 3D细胞活力检测试剂盒 | Promega | G96821 | |
| CyQUANT™ LDH细胞毒性检测试剂盒 | ThermoFisher Scientific | C20300 | |
| 细胞处理 | AZGP1蛋白 | Sino Biological | 13242-H08H |
| 迁移实验 | Transwell™可渗透聚酯膜插入物 | Corning | -- |
| 侵袭实验 | BD Matrigel™ | BD | -- |
| 血管生成实验 | 钙黄绿素AM | ThermoFisher Scientific | C3099 |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Laemmli上样缓冲液 | Bio-rad | -- | |
| 抗β肌动蛋白 | Genescript | a00702 | |
| 抗AR抗体 | Abcam | ab133273 | |
| 辣根过氧化物酶偶联的山羊抗鼠IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 辣根过氧化物酶偶联的抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| ECL™蛋白质印迹底物 | Cytiva | GERPN2106 | |
| 基因分型 | Kapa小鼠基因分型试剂盒 | Cliniscience | -- |
| 组织学染色 | 透明剂 | Statlab LLC | CACLELT |
| 伊红溶液 | -- | -- | |
| 免疫组化 | DAB显色液 | Vector Laboratories | SK-4100 |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | Cell Signaling Inc | 77699S |
| 二抗 | Abcam | ab150077 | |
| 含DAPI封片剂 | Abcam | ab104139 | |
| 天狼星红染色 | 天狼星红 | Abcam | ab246832 |
| 蛋白质组学 | 三(2-羧乙基)膦 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胰蛋白酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 甲酸 | Fisher Scientific | -- | |
| C18捕集柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Orbitrap Eclipse三合一质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 纳升喷雾Flex离子源 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| LTQ Orbitrap Elite质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 柱温箱 | PST Phoenix S&T | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基成分,包括PC3、DU145、LNCaP、C42B、22Rv1、HUVECs的培养基和添加物 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 基因敲除和过表达 | 慢病毒载体、sgRNA序列、转导时间、筛选药物(嘌呤霉素)及浓度 阅读提示:Materials and methods: Lentiviral production, Generation of AZGP1 knockout and overexpressing cells |
| 细胞增殖实验 | 细胞接种密度、培养时间、检测方法(CellTiter-Glo等) 阅读提示:Materials and methods: Proliferation assays |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞数量、Matrigel浓度、孵育时间、染色方法 阅读提示:Materials and methods: Transwell migration assay, Transwell invasion assay |
| 体内异种移植瘤 | 小鼠品系(NSG)、细胞数量、注射方式、肿瘤测量时间间隔 阅读提示:Materials and methods: PCa xenograft studies |
| 小鼠模型 | AZGP1敲除小鼠的获取、繁殖、基因分型方法 阅读提示:Materials and methods: AZGP1 knockout mice breeding |
| 免疫组化和免疫荧光 | 抗原修复条件、抗体稀释度、孵育时间、显色方法 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry staining, Immunofluorescence staining |