EV制备与分离
获取用于检测的细胞来源EV。
从癌细胞系培养上清中通过超滤或超速离心分离EV。
An aptamer-guided fluorescence polarisation platform for extracellular vesicle liquid biopsy.
文献包含模型建立(细胞系EV)、功能验证(特异性、灵敏度)、机制验证(双标记策略)及体内模拟(人血浆加标),证据层级独立。
HT-29结直肠癌细胞来源EV SKBR3乳腺癌细胞来源EV HepG2肝细胞癌细胞来源EV 人血浆样本
捕获抗体浓度:8.0 μg/mL 检测适配体浓度:5.0 nM EV捕获时间:16小时 适配体孵育时间:1小时 人血浆基质中加标EV比例:1:9 (v/v)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取用于检测的细胞来源EV。
从癌细胞系培养上清中通过超滤或超速离心分离EV。
确定最佳抗体浓度、捕获时间、适配体浓度和孵育时间。
通过棋盘滴定优化捕获抗体浓度、包被时间、EV捕获时间、适配体浓度和孵育时间。
验证检测方法对目标EV的特异性,排除非EV物质干扰。
使用阴性对照(Triton X-100处理、阴性适配体、同型抗体、无目标蛋白的EV)验证特异性。
确定检测方法的LOD和线性动态范围。
在PBS和人血浆中制备不同浓度EV,绘制ΔFP与EV浓度的关系曲线。
评估在大量阴性EV背景下检测阳性EV的能力。
将阳性EV与阴性EV按不同比例混合,保持总EV浓度恒定,测量ΔFP。
验证利用同一组标志物的定量差异区分不同癌细胞来源EV的能力。
将三种癌细胞系EV分别加标到六个人血浆样本中,使用不同的捕获抗体和检测适配体,测量ΔFP并绘制二维图。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良 Eagle 培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 谷氨酰胺补充剂 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Sigma | -- | |
| EV分离 | Centricon® Plus-70 离心过滤器,截留分子量10 kDa | Merck | UFC701008 |
| 抗体制备 | 抗人CD9 APC偶联抗体 | Thermo Fisher Scientific | A15698 |
| 抗人CD9生物素偶联抗体 | BioLegend | 312112 | |
| 抗人CD9 PE偶联抗体 | BioLegend | 312106 | |
| 抗人CD81 APC偶联抗体 | Thermo Fisher Scientific | 17-0819-42 | |
| 抗人CD81生物素偶联抗体 | BioLegend | 349514 | |
| 抗人CD81 FITC偶联抗体 | BioLegend | 349504 | |
| 抗人CD63 APC偶联抗体 | Thermo Fisher Scientific | A15712 | |
| 抗人CD63生物素偶联抗体 | BioLegend | 353017 | |
| 抗人CD63 FITC偶联抗体 | BioLegend | 353006 | |
| 抗人EpCAM Alexa Fluor® 647偶联抗体 | R&D Systems | FAB9601R100UG | |
| 抗人EpCAM生物素偶联抗体 | BioLegend | 324216 | |
| 抗人HER2 FITC偶联抗体 | BioLegend | 324404 | |
| 抗人HER2 PE偶联抗体 | BioLegend | 324405 | |
| 抗人HER2 APC偶联抗体 | BioLegend | 324408 | |
| 小鼠IgG1生物素偶联同型对照 | BioLegend | 400104 | |
| 适配体合成 | FITC-CD63-BP 适配体 | Integrated DNA Technologies, Inc. | -- |
| FITC-HER2-HApt 适配体 | Integrated DNA Technologies, Inc. | -- | |
| FITC阴性对照适配体 | Integrated DNA Technologies, Inc. | -- | |
| FluoPADE检测 | 链霉亲和素包被的孔板 | Thermo Fisher Scientific | 15503 |
| 多功能酶标仪 CLARIOstar Plus | BMG Labtech | -- | |
| EV分离 | Eppendorf 5810R 离心机 | Eppendorf | -- |
| 水平转子 S-4-72 | Eppendorf | -- | |
| 固定角转子 FA-45-6-30 | Eppendorf | -- | |
| TLS-55 转子 | Beckman | -- | |
| 摇床 (Thermoline Scientific, 型号:TL400) | Thermoline Scientific | TL400 | |
| 0.22 µm 滤膜 | -- | -- | |
| 检测 | Triton X-100 | -- | -- |
| 游离 EpCAM 蛋白 | Sino Biological | 10694-H08H | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EV制备与分离 | 细胞培养条件、EV分离方法(超滤或超速离心)及参数 阅读提示:见Methods 2.3, 2.5, 2.6 |
| FluoPADE检测 | 捕获抗体浓度(8 μg/mL)、包被时间(0.5 h)、EV捕获时间(16 h)、适配体浓度(5 nM)、适配体孵育时间(1 h) 阅读提示:见Results 3.2及Methods 2.7 |
| 特异性验证 | 阴性对照设置(Triton X-100处理、阴性适配体、同型抗体、无目标蛋白的EV) 阅读提示:见Results 3.3及Methods 2.7 |
| 灵敏度和线性范围 | EV在PBS或人血浆中的稀释比例(1:9),浓度梯度设置 阅读提示:见Results 3.4及Methods 2.8 |
| 多参数分析 | 不同来源EV加标到人血浆的比例(1:9 v/v),总EV浓度(1.0×10^10 EVs/mL) 阅读提示:见Results 3.7及Methods 2.9 |