适配体引导的荧光偏振平台用于细胞外囊泡液体活检

An aptamer-guided fluorescence polarisation platform for extracellular vesicle liquid biopsy.

作者信息Cuong Viet Pham, Rocky Chowdhury, Shweta Patel, Satendra Kumar Jaysawal, Yingchu Hou, Huo Xu, Lee Jia, Yu-Mei Zhang, Xiaowei Wang, Wei Duan, Dongxi Xiang
PMID39221546
发布时间2024-09
DOI10.1002/jev2.12502

实验完整度

高

文献包含模型建立(细胞系EV)、功能验证(特异性、灵敏度)、机制验证(双标记策略)及体内模拟(人血浆加标),证据层级独立。

主要模型

HT-29结直肠癌细胞来源EV SKBR3乳腺癌细胞来源EV HepG2肝细胞癌细胞来源EV 人血浆样本

重点核对

捕获抗体浓度:8.0 μg/mL 检测适配体浓度:5.0 nM EV捕获时间:16小时 适配体孵育时间:1小时 人血浆基质中加标EV比例:1:9 (v/v)

摘要

将基于细胞外囊泡(EV)的癌症生物标志物的发现转化为个性化精准肿瘤学,需要开发稳健、灵敏且特异的检测方法,并适用于临床实验室。尽管已开发出多种用于EV液体活检的优雅方法,但大多数仍处于研究原型阶段,因为需要高水平的微加工和/或精密仪器。因此,本研究旨在开发一种基于DNA适配体和荧光偏振的简单均相检测方法,无需分离未结合的检测配体与结合物即可检测EV。通过使用一组抗体固定EV,随后用靶向不同EV生物标志物的DNA适配体进行检测,实现高特异性。这种双管齐下的策略确保了在定量生物标志物阳性EV之前,去除输入生物液体中大多数(如果不是全部)非EV物质,包括可溶性蛋白、蛋白质聚集体或非囊泡颗粒。检测限达到5.0 × 10^6 EVs/mL,线性定量范围为5.0 × 10^8至2.0 × 10^10 EVs/mL。借助多参数分析策略,这种适配体引导的荧光偏振检测能够基于EV上同一组生物标志物水平的定量差异,区分来自三种不同实体癌细胞类型的EV。鉴于该方法的简便性及其在自动化临床生化分析仪上的易实现性,该检测方法可用于未来基于EV的连续实时监测新发大或微转移、癌症进展以及癌症管理各个阶段对治疗的反应。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
开发一种简单、灵敏、特异的EV检测方法,用于癌症液体活检。
核心机制
通过抗体捕获EV和适配体检测的双标记策略,确保信号来源于EV,非EV物质被去除。
主要证据
在PBS和人血浆中,FluoPADE检测HT-29 EVs的LOD分别为5.0×10^6和5.0×10^7 EVs/mL;通过多参数分析可区分三种癌细胞系EV。
研究意义
该方法有望用于临床EV液体活检,监测癌症进展和治疗反应。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

EV制备与分离

获取用于检测的细胞来源EV。

从癌细胞系培养上清中通过超滤或超速离心分离EV。

2

FluoPADE检测条件优化

确定最佳抗体浓度、捕获时间、适配体浓度和孵育时间。

通过棋盘滴定优化捕获抗体浓度、包被时间、EV捕获时间、适配体浓度和孵育时间。

3

特异性和选择性验证

验证检测方法对目标EV的特异性,排除非EV物质干扰。

使用阴性对照(Triton X-100处理、阴性适配体、同型抗体、无目标蛋白的EV)验证特异性。

4

灵敏度和线性范围评估

确定检测方法的LOD和线性动态范围。

在PBS和人血浆中制备不同浓度EV,绘制ΔFP与EV浓度的关系曲线。

5

灵敏度测试(稀有目标检测)

评估在大量阴性EV背景下检测阳性EV的能力。

将阳性EV与阴性EV按不同比例混合,保持总EV浓度恒定,测量ΔFP。

6

多参数分析区分不同来源EV

验证利用同一组标志物的定量差异区分不同癌细胞来源EV的能力。

将三种癌细胞系EV分别加标到六个人血浆样本中,使用不同的捕获抗体和检测适配体,测量ΔFP并绘制二维图。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜氏改良 Eagle 培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
谷氨酰胺补充剂Gibco--
胰蛋白酶-EDTASigma--
Centricon® Plus-70 离心过滤器,截留分子量10 kDaMerckUFC701008
抗人CD9 APC偶联抗体Thermo Fisher ScientificA15698
抗人CD9生物素偶联抗体BioLegend312112
抗人CD9 PE偶联抗体BioLegend312106
抗人CD81 APC偶联抗体Thermo Fisher Scientific17-0819-42
抗人CD81生物素偶联抗体BioLegend349514
抗人CD81 FITC偶联抗体BioLegend349504
抗人CD63 APC偶联抗体Thermo Fisher ScientificA15712
抗人CD63生物素偶联抗体BioLegend353017
抗人CD63 FITC偶联抗体BioLegend353006
抗人EpCAM Alexa Fluor® 647偶联抗体R&D SystemsFAB9601R100UG
抗人EpCAM生物素偶联抗体BioLegend324216
抗人HER2 FITC偶联抗体BioLegend324404
抗人HER2 PE偶联抗体BioLegend324405
抗人HER2 APC偶联抗体BioLegend324408
小鼠IgG1生物素偶联同型对照BioLegend400104
FITC-CD63-BP 适配体Integrated DNA Technologies, Inc.--
FITC-HER2-HApt 适配体Integrated DNA Technologies, Inc.--
FITC阴性对照适配体Integrated DNA Technologies, Inc.--
链霉亲和素包被的孔板Thermo Fisher Scientific15503
多功能酶标仪 CLARIOstar PlusBMG Labtech--
Eppendorf 5810R 离心机Eppendorf--
水平转子 S-4-72Eppendorf--
固定角转子 FA-45-6-30Eppendorf--
TLS-55 转子Beckman--
摇床 (Thermoline Scientific, 型号:TL400)Thermoline ScientificTL400
0.22 µm 滤膜----
Triton X-100----
游离 EpCAM 蛋白Sino Biological10694-H08H
GraphPad Prism 8.0----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
EV制备与分离
细胞培养条件、EV分离方法(超滤或超速离心)及参数
阅读提示:见Methods 2.3, 2.5, 2.6
FluoPADE检测
捕获抗体浓度(8 μg/mL)、包被时间(0.5 h)、EV捕获时间(16 h)、适配体浓度(5 nM)、适配体孵育时间(1 h)
阅读提示:见Results 3.2及Methods 2.7
特异性验证
阴性对照设置(Triton X-100处理、阴性适配体、同型抗体、无目标蛋白的EV)
阅读提示:见Results 3.3及Methods 2.7
灵敏度和线性范围
EV在PBS或人血浆中的稀释比例(1:9),浓度梯度设置
阅读提示:见Results 3.4及Methods 2.8
多参数分析
不同来源EV加标到人血浆的比例(1:9 v/v),总EV浓度(1.0×10^10 EVs/mL)
阅读提示:见Results 3.7及Methods 2.9