体外检测L. donovani对DC表面CLEC-2表达的影响
确定L. donovani感染是否以及如何影响DC上CLEC-2的表达
用LDPm或LDAm感染BMDCs,经LPS刺激后,通过流式细胞术检测CLEC-2表达。同时检测L. donovani感染小鼠脾脏DC上CLEC-2表达的动力学变化。
Leishmania donovani Attenuates Dendritic Cell Trafficking to Lymph Nodes by Inhibiting C-Type Lectin Receptor 2 Expression via Transforming Growth Factor-β.
包含体外细胞模型(BMDCs、HuMoDCs)、体内小鼠模型(BALB/c)、患者样本(HuMoDCs)、功能验证(过表达、siRNA)及机制验证(EMSA、ChIP、报告基因)。
杜氏利什曼原虫感染的BALB/c小鼠模型 小鼠骨髓来源树突细胞(BMDCs) 人单核细胞来源树突细胞(HuMoDCs) 杜氏利什曼原虫AG83株
L. donovani感染BMDCs的寄生虫与细胞比例:10:1 L. donovani感染时间:24小时 LPS刺激浓度:500 ng/mL,刺激时间:24小时 中和抗体使用浓度:10 μg/mL(抗TGF-β或抗IL-10) 体内迁移实验中,DC注射剂量:1×10^6细胞/小鼠,混合LDPm剂量:1×10^7
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定L. donovani感染是否以及如何影响DC上CLEC-2的表达
用LDPm或LDAm感染BMDCs,经LPS刺激后,通过流式细胞术检测CLEC-2表达。同时检测L. donovani感染小鼠脾脏DC上CLEC-2表达的动力学变化。
研究L. donovani诱导的TGF-β是否介导了CLEC-2表达的下调
检测L. donovani感染后DC分泌TGF-β的水平,并通过中和抗体和生物活性实验验证TGF-β的作用。
确定L. donovani是否通过下调CLEC-2抑制DC向PDPN的迁移
使用Transwell迁移实验,检测L. donovani感染、CLEC-2过表达或TGF-β中和后,DC向PDPN包被下室的迁移能力。
明确L. donovani如何通过TGF-β抑制NF-κB对CLEC1B启动子的激活
通过EMSA、DNA pulldown、ChIP和报告基因实验,检测LPS诱导的NF-κB与CLEC1B启动子结合,以及L. donovani和TGF-β对该过程的影响。
确定TGF-β是否通过激活c-Src抑制NF-κB介导的CLEC-2表达
检测L. donovani感染对c-Src磷酸化的影响,并通过siRNA敲低c-Src,观察其对NF-κB结合和CLEC-2表达的影响。
在体内模型中确认L. donovani通过下调CLEC-2和依赖c-Src抑制DC向引流淋巴结的迁移
将处理过的DC(eFluor 670标记)注入小鼠后足垫,48小时后通过流式细胞术检测腘窝淋巴结中eFluor 670+细胞数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-4 | Peprotech | -- | |
| DC感染与处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| DC转染 | FreeStyle MAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 脂质体转染试剂RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 抗c-Src抗体 | Cell Signaling Technology | 2108 |
| 抗磷酸化Tyr416 c-Src抗体 | Cell Signaling Technology | 2101 | |
| 抗CLEC-2抗体 | Abcam | ab90542 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8008 | |
| 抗NF-κB p50抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8414 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2004 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗大鼠抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2032 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗小鼠抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2005 | |
| ChIP | 小鼠IgG | Santa Cruz Biotechnology | sc-2025 |
| 流式分析 | PE标记的抗小鼠CLEC-2抗体 | BioLegend | 146103 |
| APC标记的抗小鼠PDPN抗体 | BioLegend | 127410 | |
| FITC标记的抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | 117306 | |
| FITC标记的CD31抗体 | BioLegend | 160212 | |
| PE标记的大鼠IgG2b,κ同型对照 | BioLegend | 400608 | |
| APC标记的小鼠IgG2a,κ同型对照 | BioLegend | 400219 | |
| 药物处理 | 中和性抗IL-10抗体 | BioLegend | 505002 |
| 中和性抗TGF-β抗体 | Thermo Fisher Scientific | 16-9243-85 | |
| 同型对照抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-4714-82 | |
| 流式分析 | APC标记的抗人CLEC-2抗体 | R&D Systems | FAB1718A |
| 药物处理 | 纯化的抗人CLEC-2抗体 | Merk KGa | MABF957 |
| Transwell迁移实验 | 小鼠PDPN-Fc蛋白 | BioLegend | -- |
| 人PDPN-Fc蛋白 | R&D Systems | -- | |
| siRNA转染 | 靶向c-Src和CLEC-2的siRNA池 | Dharmacon | -- |
| 报告基因实验 | pGL3-(CAGA)12-荧光素酶报告基因构建体 | -- | -- |
| pRL-CMV | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | -- | |
| pCMV-IκBαDN | TaKaRa Bio USA, Inc. | 631923 | |
| 编码小鼠CLEC-2的pCMV3载体 | Sino Biological US Inc. | MG50306-UT | |
| ChIP | ChIP-IT试剂盒 | Active Motif | -- |
| DNA pulldown | 链霉亲和素偶联的Dynabeads磁珠 | -- | -- |
| 体内迁移实验 | eFluor 670染料 | eBioscience | -- |
| Transwell迁移实验 | Transwell插入式细胞培养小室(5 μm孔径) | Corning Life Science | -- |
| ELISA检测 | IL-10 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-7105-88 |
| TGF-β ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-8350-88 | |
| 流式分析 | C6 Accuri流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DC感染 | L. donovani感染DC的比例和时间;LPS浓度和刺激时间 阅读提示:详见Materials and Methods中的'DC infection and treatment' |
| DC转染 | 质粒或siRNA的浓度和转染试剂 阅读提示:详见Materials and Methods中的'DC transfection' |
| Transwell迁移实验 | PDPN包被浓度、迁移时间、DC数量 阅读提示:详见Materials and Methods中的'Transwell DC migration assay' |
| 体内DC迁移实验 | DC注射剂量、L. donovani混合比例、eFluor 670标记浓度、迁移时间 阅读提示:详见Materials and Methods中的'In vivo DC migration assay' |
| 体外分子机制实验 | EMSA、ChIP、报告基因实验的具体条件和抗体 阅读提示:详见Materials and Methods中的'EMSA and immunoblot analysis', 'ChIP assay', 'DNA pulldown assay', 'Reporter assay' |