姐妹染色单体黏连建立过程的对称性调控

Symmetric control of sister chromatid cohesion establishment.

作者信息Jiaxin Zhang, Lili Li, Yu Miao, Xiaojing Liu, Haitao Sun, Meiqian Jiang, Xiaoli Li, Zhen Li, Cong Liu, Baohua Liu, Xingzhi Xu, Qinhong Cao, Wenya Hou, Chunlai Chen, Huiqiang Lou
PMID36912084
发布时间2023-06-09
DOI10.1093/nar/gkad146

实验完整度

研究包含体外激酶实验、生化交联与免疫共沉淀、细胞周期同步与免疫印迹、单分子光谱(FCS/PCD)、酵母遗传互补及人类细胞染色体铺展等多个独立证据层级,并包含功能验证(T105D抑制表型)和机制验证(二聚化与SMC3乙酰化)。

主要模型

HeLa细胞 HEK293T细胞 HepG2细胞 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)

重点核对

GSK3A/B双敲低或GSK3i处理导致约15%的姊妹染色单体黏连缺陷(人类细胞) MMS22L T105D突变体挽救MMS22L或GSK3缺失导致的黏连缺陷,而T105A具有显性负效应 GSK3i处理导致染色质结合的MMS22L、ESCO2和SMC3乙酰化水平出现延迟积累(S期时间过程) Eco1单体在G1期,S期约20%形成二聚体,随后在晚S期消失(酵母FCS/PCD) 酵母中MCK1缺失导致着丝粒、臂和端粒处前期姊妹染色单体分离,Mck1回补可挽救

摘要

除了捕获姐妹染色单体之外,cohesin还驱动其他高阶染色体结构动态,如环化、区室化和凝聚。ESCO2乙酰化一部分cohesin,使得黏连必须并且仅在新生姐妹染色单体之间建立。这一过程如何精确实现仍然未知。在这里,我们报道GSK3家族激酶通过ESCO2调节因子CRL4MMS22L提供更高层级的控制。GSK3磷酸化MMS22L的Thr105,导致CRL4MMS22L和ESCO2在S期发生同源二聚化,这一点通过单分子光谱和多种生化方法得到了证实。MMS22L上的一个磷酸化模拟突变(T105D)足以介导它们的二聚化并挽救由GSK3或MMS22L缺失引起的黏连缺陷,而不可磷酸化的T105A即使在野生型细胞中也发挥显性负效应。通过细胞分级分离和时间过程测量,我们显示GSK3促进MMS22L和ESCO2的及时染色质结合,随后促进SMC3乙酰化。ESCO2二聚化的必要性暗示了真核生物中黏连建立过程的对称性调控。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
GSK3家族激酶如何通过CRL4MMS22L对ESCO2进行更高层级的调控,以确保黏连仅在新生姐妹染色单体之间建立?
核心机制
GSK3(酵母Mck1)磷酸化MMS22L Thr105(酵母Mms22 T127),介导CRL4MMS22L的同源二聚化,进而招募并二聚化ESCO2/Eco1,增强S期SMC3乙酰化,最终建立姐妹染色单体黏连。
主要证据
通过酵母双杂交和体外激酶实验确定MMS22L为GSK3底物;免疫共沉淀、GA交联和荧光偏振显示MMS22L二聚化依赖T105磷酸化;BiFC、FCS/PCD和凝胶过滤显示ESCO2/Eco1在S期二聚化;T105D突变体挽救黏连缺陷,T105A具有显性负效应;GSK3i处理延迟SMC3乙酰化并减弱黏连。
研究意义
该研究揭示了GSK3家族激酶通过CRL4MMS22L同源二聚化提供对黏连建立的高精度质量控制,并提出了对称的“双酶双环”模型,为理解真核生物中黏连建立的精确性提供了新视角。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定MMS22L作为GSK3的底物

验证GSK3是否通过磷酸化MMS22L来调控黏连建立

通过体外激酶实验,使用纯化的重组Mms22片段与GSK3/Mck1在γ-32P-ATP存在下孵育,并通过LC-MS/MS鉴定Mms22的磷酸化位点。

2

验证MMS22L的S期特异性同源二聚化

探究MMS22L是否在S期形成同源二聚体并依赖GSK3

通过FLAG-IP、GA交联和荧光偏振实验,检测MMS22L在细胞周期中的自相互作用及其对GSK3磷酸化的依赖性。

3

验证T105磷酸化对黏连建立的关键作用

测试MMS22L T105磷酸化是否对姐妹染色单体黏连必不可少

在MMS22L或GSK3敲低的人类细胞中表达MMS22L-WT、T105D或T105A突变体,通过染色体铺展分析黏连缺陷。

4

检测ESCO2/Eco1的S期二聚化

验证GSK3依赖的MMS22L二聚化是否导致ESCO2/Eco1二聚化

使用BiFC(人类细胞)和FCS/PCD(酵母)检测ESCO2/Eco1的二聚化状态,并通过凝胶过滤分析Eco1-Mms22复合物。

5

验证SMC3乙酰化及染色质结合

探究GSK3缺失是否影响ESCO2和SMC3的染色质结合及SMC3乙酰化

通过双胸苷同步化细胞,释放后在不同时间点制备染色质组分,免疫印迹检测MMS22L、ESCO2和SMC3ac的水平。

6

体内功能验证:Eco1二聚化挽救黏连缺陷

确定Eco1二聚化是否足以替代GSK3在黏连建立中的功能

利用rapamycin诱导的二聚化系统,在mck1Δ酵母细胞中通过FRB-FKBP标签强制Eco1二聚化,检测黏连缺陷是否被挽救。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清ABW--
SMM 293-TⅠ培养基Sino Biological--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
RaPure总RNA提取试剂盒Magen--
逆转录酶Promega--
胸苷Sigma--
诺考达唑Sigma--
RO-3306Selleckchem--
含羞草氨酸Sigma--
CHIR-98014Selleckchem--
吉姆萨染色液Amresco--
碘化丙啶----
核糖核酸酶A----
CytoFLEX S流式细胞仪Beckman Coulter--
抗FLAG M2磁珠Sigma--
Superdex 200 Increase 10/300 色谱柱GE Healthcare--
ÄKTA FPLC 蛋白质纯化系统GE Healthcare--
SPARK多功能酶标仪TECAN--
FITC标记的MMS22L T105肽----
FITC标记的pT105肽----
抗FLAG M2磁珠Sigma--
FLAG肽----
镍离子琼脂糖凝胶GE Healthcare--
抗GSK3 α/β抗体CST5676
抗ESCO2抗体Abcamab86003
抗MMS22L抗体Abcamab181047
抗SMC3抗体BETHYLA300-060A
抗乙酰化SMC3 Lys105/106抗体MerckMABE1073
抗ORC2抗体CST4736
抗Tubulin抗体MBLPM054
抗FLAG抗体SigmaF3165
抗Myc抗体Proteintech16286-1-AP
抗mCherry抗体Proteintech26765-1-AP

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与转染
细胞系(HeLa, HEK293T, HepG2),培养基(DMEM, Gibco),血清浓度(10% FBS),转染试剂(Lipofectamine 3000),转染时长(48 h)
阅读提示:见 Materials and Methods: Cell culture, transfection, strains
细胞同步化
双重胸苷阻断(2 mM胸苷处理14-16 h,释放8-10 h,再2 mM胸苷16 h),胸苷释放时间点,nocodazole浓度(100 ng/ml),RO-3306浓度(10 μM),mimosine浓度(0.4 mM)
阅读提示:见 Materials and Methods: Cell synchronization and drug treatments
GSK3抑制
CHIR-98014浓度(5 μM),处理时间(12 h)
阅读提示:见 Materials and Methods: Cell synchronization and drug treatments
染色体铺展
低渗处理(75 mM KCl 5 min),固定液(Carnoy's solution, 甲醇:乙酸 3:1),Giemsa染色浓度(10% v/v),显微镜(Leica CytoVision, 100×/NA1.3油镜)
阅读提示:见 Materials and Methods: Chromosome spreads
酵母黏连检测
酵母菌株(SBY180等),同步化方式(α-factor和nocodazole),生长条件(YPDA, 30°C, 25 μM CuSO4),观测显微镜(Leica DMI8, 100×/NA1.4)
阅读提示:见 Materials and Methods: Yeast sister chromatid cohesion assays
流式细胞术
PI浓度(10 μg/ml),RNase A浓度(500 μg/ml),乙醇固定,流式细胞仪(CytoFLEX S)
阅读提示:见 Materials and Methods: Flow cytometry cell cycle analysis
免疫沉淀
裂解液成分(50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 1% NP-40, 5 mM EDTA, 10% glycerol),超声,4°C孵育时间(2 h),洗涤次数(4次)
阅读提示:见 Materials and Methods: Immunoprecipitation
GA交联
GA浓度(0.02%),孵育时间(30 min, 冰上),淬灭(50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 15 min)
阅读提示:见 Materials and Methods: Glutaraldehyde (GA)-crosslinking assays
凝胶过滤
色谱柱(Superdex 200 Increase 10/300),流速(0.25 ml/min),样品比例(Eco1:Mms22, 1:1摩尔比),缓冲液(50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl)
阅读提示:见 Materials and Methods: Gel filtration
染色质分级分离
CSK缓冲液成分,孵育时间(20 min, 冰上),离心(2000 × g, 15 min, 4°C)
阅读提示:见 Materials and Methods: Chromatin fractionation analysis
荧光偏振
肽浓度(10 ng/μl),反应体积(100 μl),激发/发射波长(485/535 nm),96孔板(BD Falcon),酶标仪(SPARK, TECAN)
阅读提示:见 Materials and Methods: Fluorescence polarization measurements
BiFC
细胞密度(1×10^5 cells/well),向量(GFP-N-ESCO2, GFP-C-ESCO2),转染时间(48 h),固定(4% PFA),染色(DAPI,5 min),显微镜(Leica DMI8,40×或100×)
阅读提示:见 Materials and Methods: Biomolecular fluorescence complementation assay (BiFC)
FCS/PCD
酵母G1同步(2.5 μM α-factor),释放(含2%半乳糖),裂解(玻璃珠破碎),稀释(2-4个分子/共聚焦体积),激光功率(10 mW),测量时间(10 s),重复数(10次)
阅读提示:见 Materials and Methods: Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) and photon counting distribution (PCD) assays
体外激酶实验
底物(Mms22N, 1-300),激酶(Mck1, GSK3A/B),γ-32P-ATP,GSK3i使用
阅读提示:见 Results: MMS22L is a substrate of GSK3 kinases 和 Materials and Methods: Protein purification and in vitro kinase assays
统计分析方法
样本量(至少三次独立实验),误差条(mean ± SEM),统计检验(ANOVA, Student's t-test, multiple t-tests),显著性水平(P < 0.05等)
阅读提示:见 Materials and Methods: Statistical analysis