数据库分析MVP表达与M2巨噬细胞浸润相关性
探究MVP表达与HCC中TAMs浸润的相关性。
利用TIMER2.0数据库分析MVP表达与多种免疫细胞浸润水平的相关性,并比较肿瘤与癌旁组织中MVP表达差异。
Major vault protein regulates tumor-associated macrophage polarization through interaction with signal transducer and activator of transcription 6.
包含临床样本分析、细胞实验、体内小鼠模型、机制研究等多个独立证据层级,并有功能及机制验证。
HCC患者肿瘤组织及癌旁组织 小鼠肝癌细胞系Hepa1-6和人肝癌细胞系Huh-7 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)和腹腔巨噬细胞(PMs) C57BL/6野生型(Wt)和MVP敲除(Mvp-/-)小鼠皮下移植瘤模型
MVP表达与M2巨噬细胞浸润的相关性(TIMER2.0数据库) MVP敲除或过表达对M2极化的影响 MVP与STAT6的相互作用 MVP对STAT6磷酸化和核转位的影响 Mvp-/-小鼠肿瘤生长及TAMs浸润情况
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究MVP表达与HCC中TAMs浸润的相关性。
利用TIMER2.0数据库分析MVP表达与多种免疫细胞浸润水平的相关性,并比较肿瘤与癌旁组织中MVP表达差异。
验证MVP在HCC患者肿瘤组织中与M2-TAMs的关系。
收集HCC患者肿瘤及癌旁组织,进行免疫荧光染色检测MVP、CD68、CD206、Arg-1等表达及共定位。
考察MVP缺失对HCC肿瘤生长和M2-TAMs浸润的影响。
将Hepa1-6细胞注射到Wt和Mvp-/-小鼠皮下,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫荧光和流式细胞术检测肿瘤组织中巨噬细胞标志物。
验证MVP缺乏的巨噬细胞对肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其机制。
制备Wt和Mvp-/- BMDMs的条件培养基(CM),处理Hepa1-6和Huh-7细胞,检测细胞活力、克隆形成、迁移和侵袭;同时用肿瘤细胞CM处理巨噬细胞,检测M2标志物表达。
阐明MVP调控M2极化的具体分子机制。
通过免疫共沉淀验证MVP与STAT6、JAK1的相互作用,检测IL-4刺激下STAT6的磷酸化、核转位及转录活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RPMI1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | -- |
| 脂质体转染试剂 | Yeasen | -- | |
| 巨噬细胞极化诱导 | 重组人IL-4蛋白 | Sino Biological | 11846-HNAE |
| 重组人IFN-γ蛋白 | Sino Biological | 11725-HNAS | |
| 重组小鼠IL-4蛋白 | Sino Biological | 51084-MNAE | |
| 重组小鼠IFN-γ蛋白 | Sino Biological | 50709-MNAH | |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8细胞计数试剂盒 | Vazyme | -- |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | -- |
| eBioscience™固定/破膜浓缩液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | MCE | HY-K0010 | |
| 磷酸酶抑制剂 | APExBIO | K1015 | |
| Bio-Rad蛋白定量试剂 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫共沉淀 | NP-40裂解液 | -- | -- |
| 蛋白A/G琼脂糖 | -- | -- | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因试剂盒 | Promega | -- |
| pRL-TK载体 | Promega | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| ABScript III逆转录预混液 | ABclonal | -- | |
| 通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal | -- | |
| 免疫荧光/免疫组化 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 免疫组化 | Harris苏木素 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 胶原酶IV | Sigma-Aldrich | -- |
| DNA酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗体 | 抗MVP抗体 | Proteintech | 16478-1-AP |
| 抗STAT6抗体 | Proteintech | 51073-1-AP | |
| 抗磷酸化STAT6 (Tyr641)抗体 | Cusabio | CSB-PA000625 | |
| 抗JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 50996 | |
| 抗磷酸化JAK1 (Tyr1034/1035)抗体 | Cell Signaling Technology | 3331 | |
| 抗CD206抗体 | Proteintech | 18704-1-AP | |
| 抗Arg-1抗体 | Proteintech | 16001-1-AP | |
| 抗F4/80抗体 | Abcam | ab300421 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab182981 | |
| 抗CD68抗体 | Boster Biological Technology | BA3638 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与极化 | BMDMs分离与极化条件:IL-4浓度(20 ng/mL)和刺激时间(24小时);M1极化条件:LPS(100 ng/mL)和IFN-γ(50 ng/mL)刺激24小时;并确认细胞来源。 阅读提示:参见Methods中的“Murine primary macrophage isolation and polarization”部分。 |
| 体内肿瘤模型 | 皮下注射的Hepa1-6细胞数量(3×10^6)、Matrigel比例(30%)、小鼠品系与周龄(6-8周龄雄性),以及肿瘤测量频率。 阅读提示:参见Methods中的“Mice and tumor model”部分及Figure 2图注。 |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解液成分(NP-40 buffer),抗体使用(anti-Flag、anti-HA等),以及IL-4刺激时间(30分钟)。 阅读提示:参见Methods中的“Western blot and co-immunoprecipitation analysis”部分。 |
| STAT6核转位检测 | 核质分离步骤中buffer A和buffer B的配方,以及IL-4刺激时间点。 阅读提示:参见Methods中的“Nuclear extraction”部分及Figure 6图注。 |
| 荧光素酶报告基因实验 | 报告基因构建(6×Stat6结合位点)、内参(pRL-TK)、以及IL-4刺激条件。 阅读提示:参见Methods中的“Luciferase assays”部分以及补充材料。 |