疫苗设计与构建
构建表达不同VOC Spike蛋白的腺病毒载体疫苗。
基于hAdV5/3平台,将不同VOC的Spike基因插入腺病毒载体,并进行突变修饰。
Cross-protection and cross-neutralization capacity of ancestral and VOC-matched SARS-CoV-2 adenoviral vector-based vaccines.
包含体外细胞实验(Spike表达与流式)、小鼠免疫原性实验(ELISA、ELISpot、假病毒中和)、K18-hACE2小鼠活病毒攻毒实验(病毒载量、病理、免疫组化),多个独立证据层级。
BALB/c小鼠 K18-hACE2转基因小鼠 Hs 729 T人肌肉肉瘤细胞 HEK293T细胞
疫苗剂量:108或109病毒颗粒(vp) 免疫途径:后腿肌肉注射 攻毒剂量:Gamma 1×10^4 TCID50,Delta 5×10^5 TCID50,Omicron BA.1 3.5×10^4 TCID50 攻毒途径:鼻内感染(50 μl) 血清中和实验:使用假病毒,ID50计算
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建表达不同VOC Spike蛋白的腺病毒载体疫苗。
基于hAdV5/3平台,将不同VOC的Spike基因插入腺病毒载体,并进行突变修饰。
评估疫苗诱导的体液和细胞免疫反应。
BALB/c小鼠免疫后采集血清,进行ELISA检测IgG、假病毒中和实验和IFN-γ ELISpot。
评估疫苗对异源VOC攻毒的保护效力。
K18-hACE2小鼠免疫后,用不同VOC进行鼻内攻毒,检测病毒载量、组织病理和免疫组化。
评估疫苗血清对多种VOC假病毒的中和能力。
使用假病毒中和实验测定血清ID50,并构建抗原图谱。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HEK293T细胞系 | ATCC | CRL-3216 |
| Hs 729 T细胞系 | ATCC | HTB-153 | |
| 胎牛血清 | Natocor | -- | |
| 病毒扩增 | CellSTACK细胞培养室 | Corning | -- |
| 病毒纯化 | CsCl密度梯度离心 | -- | -- |
| Western blot | 抗Spike抗体 | Sino Biological | 40150-T62 |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | Ab18251 | |
| 流式分析 | StemPro Accutase细胞分离液 | Life Technologies | A11105-01 |
| 可固定活力染料510 | BD Horizon | 564406 | |
| 抗S1(NTD)抗体 | Cell Signaling Technology | E7M5X | |
| 抗RBD抗体 | Sino Biological | 40592-MM117 | |
| 抗RBD抗体 | Sino Biological | 40592-R0004 | |
| Cy-5标记的驴抗小鼠二抗 | Jackson Immunoresearch | 715-175-150 | |
| 抗兔二抗 | Jackson Immunoresearch | 711-175-152 | |
| FACS Aria流式细胞仪 | Becton-Dickinson | -- | |
| ELISA | ELISA板 | BRAND GMBH | -- |
| SARS-CoV-2 Wu-1 Spike蛋白 | Sino Biological | 40589-V08B1 | |
| SARS-CoV-2 Delta Spike蛋白 | Sino Biological | 40589-V08B16 | |
| SARS-CoV-2 BA.1 Spike蛋白 | Sino Biological | 40589-V08H26 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG H&L抗体 | Abcam | ab6789 | |
| TMB底物溶液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Bio-Rad Model 550酶标仪 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| ELISPOT | 小鼠IFN-γ检测试剂盒 | R&D Systems | -- |
| PepTivator SARS-CoV-2 Prot_S肽池 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CTL-ImmunoSpot S6显微分析仪 | Cellular Technology Limited | -- | |
| 病毒载量 | QIAamp病毒RNA小提试剂盒 | Qiagen | -- |
| LightMix模块化SARS-CoV检测试剂盒 | TIB MOLBIO | -- | |
| 组织病理 | 3-氨丙基三乙氧基硅烷 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫组化 | 抗CD3抗体 | DAKO | A0452 |
| 抗SARS-CoV-2 N蛋白抗体 | Sino Biological | 40143-T62 | |
| CytoScan HRP检测系统 | -- | -- | |
| 液体DAB-Plus底物试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 假病毒构建 | G*DG-荧光素酶重组VSV | Kerafast | -- |
| Optimem培养基 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 假病毒中和 | 荧光素酶检测系统 | Promega | -- |
| 96孔板 | Greiner Bio-One | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 疫苗免疫 | 疫苗剂量(108或109 vp)、免疫途径(肌肉注射)、小鼠品系(BALB/c或K18-hACE2)、年龄(6-8周龄或6-8月龄) 阅读提示:Methods: Mice immunization; In vivo challenge studies with VOC |
| 攻毒实验 | 攻毒病毒株(Gamma、Delta、Omicron BA.1)、攻毒剂量(TCID50)、攻毒途径(鼻内)、取样时间(攻毒后第3或4天) 阅读提示:Methods: In vivo challenge studies with VOC |
| 中和实验 | 假病毒类型(VSV假病毒)、靶细胞(HEK293T-ACE2)、血清稀释、孵育时间(20-24小时)、计算ID50 阅读提示:Methods: Construction of VOC-matched pseudoviruses and neutralization assays |
| 病毒载量检测 | 组织样本(肺、脑)、RNA提取试剂盒、qRT-PCR试剂盒、检测基因(E基因)、计算方法 阅读提示:Methods: Viral load assessment |