Hsp70-Bim相互作用通过招募parkin和TOMM20形成复合物促进线粒体自噬

Hsp70-Bim interaction facilitates mitophagy by recruiting parkin and TOMM20 into a complex.

作者信息Ting Song, Fangkui Yin, Ziqian Wang, Hong Zhang, Peng Liu, Yafei Guo, Yao Tang, Zhichao Zhang
PMID37237369
发布时间2023-05-26
DOI10.1186/s11658-023-00458-5

实验完整度

包含体外细胞模型(HEK293T、HeLa、MEF)、细胞器分离、免疫共沉淀、体外泛素化实验、基因敲低和药物处理等多层级验证,明确功能与机制验证。

主要模型

HEK293T细胞 HeLa细胞 小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)及Bax/Bak双敲除(DKO)MEF

重点核对

HEK293T、HeLa细胞及MEF细胞模型,Bax/Bak DKO MEF用于验证Bax/Bak非依赖性 Hsp70-Bim PPI的干扰剂S1g-2(10 μM)及Bcl-2-Bim干扰剂S1(10 μM)处理,DMSO作为对照 应激条件:0.5 mM H2O2、34 μM VP-16或HBSS处理4小时 parkin和TOMM20的共定位及泛素化水平检测,通过共免疫沉淀和体外泛素化实验 通过shRNA敲低Hsp70或Bim验证其对自噬和parkin转位的影响

摘要

背景:对于癌症治疗,识别选择性自噬靶点和特异性调节自噬的小分子是迫切需要的。热休克蛋白70(Hsp70)是最近发现的BH3受体,与Bcl-2相互作用的细胞死亡介质(Bim)形成蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。本文中,Hsp70-Bim PPI的特异性抑制剂S1g-2及其类似物S1(一种Bcl-2-Bim干扰剂)被用作化学工具来探索Hsp70-Bim PPI在调节线粒体自噬中的作用。方法:使用免疫共沉淀和免疫荧光实验确定蛋白质相互作用和共定位模式。通过细胞器纯化和线粒体、内质网(ER)和高尔基体上LC3-II/LC3-I的免疫检测来鉴定特定类型的自噬。基于细胞和体外泛素化研究用于研究Hsp70-Bim PPI在parkin介导的线粒体外膜20(TOMM20)泛素化中的作用。结果:我们发现,在建立PPI后,Hsp70和Bim与parkin和TOMM20形成复合物,进而促进parkin转位到线粒体、TOMM20泛素化和线粒体自噬通量,且不依赖Bax/Bak。此外,S1g-2选择性抑制应激诱导的线粒体自噬,而不干扰基础自噬。结论:这些发现强调了Hsp70-Bim PPI在调节线粒体自噬和凋亡中的双重保护功能。因此,S1g-2是一种新发现的抗肿瘤药物候选物,可驱动线粒体自噬和通过凋亡的细胞死亡。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
Hsp70-Bim PPI在调节线粒体自噬中的作用及其机制是什么?
核心机制
Hsp70与Bim形成PPI后,招募parkin和TOMM20形成复合物,促进parkin转位至线粒体,进而促进TOMM20的泛素化,驱动线粒体自噬,且不依赖Bax/Bak和PINK1稳定性。
主要证据
通过免疫共沉淀、免疫荧光、细胞器分离和体外泛素化实验,发现S1g-2破坏Hsp70-Bim PPI后抑制parkin-TOMM20关联、TOMM20泛素化和线粒体自噬;Bax/Bak DKO MEF中Bim诱导的线粒体自噬依然发生,表明该机制不依赖Bax/Bak。
研究意义
揭示Hsp70-Bim PPI作为线粒体自噬调节因子的新功能,并确定S1g-2作为同时促进线粒体自噬和凋亡的抗肿瘤药物候选物,为癌症治疗提供潜在新靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

检测S1g-2和S1对自噬的差异影响

探究Hsp70-Bim和Bcl-2-Bim PPI干扰剂对不同应激条件下自噬的调节作用。

用H2O2、VP-16或HBSS处理HEK293T细胞,并在有或无S1g-2、S1、S1n的情况下,通过Western blot检测LC3-II/LC3-I比值和p62水平。

2

靶点鉴定化学蛋白质组学

识别S1g-2和S1在细胞内的自噬调节靶点。

使用S1g-2-probe、S1-probe、S1n-probe进行原位蛋白质标记和pull-down实验,通过银染和Western blot验证靶蛋白。

3

验证Hsp70-Bim PPI对应激诱导自噬的必要性

确定Hsp70-Bim PPI是否为S1g-2抑制应激诱导自噬的关键靶点,并检测其是否影响基础自噬。

通过共免疫沉淀检测Hsp70与Bim的相互作用,使用shRNA敲低Hsp70或Bim,并检测基础自噬条件下LC3和p62水平。

4

分析Hsp70-Bim PPI对线粒体自噬的特异性影响

通过分离不同细胞器,验证Hsp70-Bim PPI对线粒体自噬的特异性调节。

分离线粒体、ER和高尔基体,检测LC3-II/LC3-I比值;同时通过免疫荧光观察GFP-LC3与线粒体共定位。

5

验证Hsp70-Bim PPI对parkin转位和TOMM20泛素化的影响

探索Hsp70-Bim PPI影响线粒体自噬的分子机制。

通过共免疫沉淀检测Hsp70与Bim、TOMM20、parkin的相互作用,以及parkin与TOMM20的关联;用共聚焦显微镜观察GFP-parkin与线粒体的共定位;进行体外泛素化实验检测TOMM20的泛素化水平。

6

验证Bax/Bak非依赖性

排除凋亡通路对Hsp70-Bim PPI介导的线粒体自噬的影响。

使用Bax/Bak DKO MEF细胞,通过HBSS处理或诱导Bim表达,检测线粒体LC3水平、蛋白相互作用和TOMM20泛素化。

7

评估线粒体自噬抑制对凋亡的影响

研究S1g-2通过抑制线粒体自噬是否增强应激诱导的凋亡。

使用parkin shRNA敲低作为对照,在长期应激条件下检测细胞色素c释放、线粒体和细胞质中细胞色素c的水平,以及Annexin V染色的凋亡率。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证蛋白相互作用
验证泛素化
验证基因功能

产品清单

实验环节名称品牌货号
依托泊苷Selleck Chemicals--
巴佛洛霉素A1Selleck Chemicals--
BimLΔC27重组蛋白Sino Biological Inc.13816-H07E
LC3抗体Santa Cruz Biotechnologysc-398822
p62抗体Santa Cruz Biotechnologysc-28359
β-肌动蛋白抗体Santa Cruz Biotechnologysc-8432
Bim抗体Santa Cruz Biotechnologysc-374358
Beclin 1抗体Santa Cruz Biotechnologysc-48341
Hsp70抗体Santa Cruz Biotechnologysc-24
Mcl-1抗体Santa Cruz Biotechnologysc-74436
Bcl-2抗体Abcamab32124
TOMM20抗体Abcamab283317
Calnexin抗体Abcamab92573
GM130抗体Abcamab32337
Parkin抗体Abcamab77924
PINK1抗体Abcamab300623
细胞色素c抗体Cell Signaling Technology4272
AMPK抗体Cell Signaling Technology2532
磷酸化AMPK (Thr172)抗体Cell Signaling Technology2531
DMEM培养基Thermo Scientific HyClone--
胎牛血清Gibco BRL--
青霉素-链霉素Thermo Scientific HyClone15140148
Lipofectamine 2000转染试剂Thermo Fisher Scientific--
聚凝胺----
线粒体提取试剂盒Genmed Scientifics Inc.--
内质网分离试剂盒Sigma038M4161V
高尔基体分离试剂盒SigmaGL0010
BCA蛋白定量试剂盒Pierce--
MitoTracker Red CMXRos线粒体荧光探针Molecular Probes--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与处理
HEK293T和HeLa细胞系来源为ATCC,DMEM培养基含10%胎牛血清和100 U/mL青霉素-链霉素,37°C、5% CO2培养。
阅读提示:Materials and methods: Cell lines
药物处理
S1g-2和S1的浓度(10 μM),处理时间(4小时),DMSO作为对照。
阅读提示:Results: Fig. 1B, Materials and methods: Reagents
应激诱导
应激条件:0.5 mM H2O2、34 μM VP-16或HBSS,处理4小时。
阅读提示:Results: Fig. 1B, Materials and methods: Reagents
蛋白相互作用分析
共免疫沉淀中抗体使用量(如anti-parkin 300 μg),以及用于检测Hsp70、Bim、TOMM20、parkin的抗体。
阅读提示:Materials and methods: In vitro ubiquitination assay, Fig. 4 legend
泛素化实验
体外泛素化反应条件:E1酶50 ng、E2酶500 ng、ubiquitin 10 μg、重组Hsp70 1 μM、Bim 0.1 μM、TOMM20 1.2 μM,37°C孵育4小时。
阅读提示:Materials and methods: In vitro ubiquitination assay
基因敲低
shRNA敲低Hsp70和Bim,使用Santa Cruz Biotechnology的shRNA慢病毒颗粒,感染HEK293T细胞,48小时后进行实验。
阅读提示:Materials and methods: Plasmid construction and transfection
细胞器分离
线粒体提取试剂盒、内质网分离试剂盒、高尔基体分离试剂盒的具体操作按说明书进行。
阅读提示:Materials and methods: Mitochondria, ER and Golgi isolation