抗原融合蛋白表达载体构建
构建能够将目标抗原展示在痘病毒外膜上的融合蛋白表达载体
将目标抗原(如GPCR ECD、全长GPCR、CD20等)与痘病毒膜蛋白A56R或F13L融合,构建重组转移质粒,并通过三重重组生成重组MVA病毒。
Use of poxvirus display to select antibodies specific for complex membrane antigens.
包含体外细胞系感染、蛋白表达与折叠验证、pull-down、ELISA、流式、酶活检测、噬菌体淘选及抗体功能实验,并有多轮独立选择的证据。
QT35细胞(MVA感染及表达验证) BHK-21细胞(MVA大规模生产) Jurkat细胞(Sema4D、CXCR4表达及功能实验) SKBR3细胞(Her2表达)
MVA病毒构建方法:采用三重重组及辅助病毒 抗原融合策略:分为A56R融合(用于胞外域)和F13L融合(用于跨膜蛋白) 病毒颗粒纯化:离心和pull-down验证 噬菌体淘选条件:病毒包被于磁珠或ELISA板,多轮淘选及去除非特异性 抗体筛选与验证:流式、ELISA、亲和力测量及功能阻断实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建能够将目标抗原展示在痘病毒外膜上的融合蛋白表达载体
将目标抗原(如GPCR ECD、全长GPCR、CD20等)与痘病毒膜蛋白A56R或F13L融合,构建重组转移质粒,并通过三重重组生成重组MVA病毒。
验证融合蛋白在病毒膜上的表达和正确折叠
通过pull-down实验(抗原特异性抗体捕获病毒)、流式细胞术(检测细胞表面表达)以及Western blot(检测病毒膜蛋白)评估抗原展示。
获得大量纯化的抗原展示病毒用于抗体淘选
在BHK-21细胞中大规模培养MVA,收获含EEV的上清,离心澄清后超速离心浓缩病毒,并验证抗原展示。
从噬菌体抗体库中筛选特异性结合目标抗原的抗体
将抗原展示病毒包被于磁珠或ELISA板,与噬菌体Fab文库孵育,经过多轮淘选(包括去除非特异性病毒结合噬菌体),富集特异性结合子。
从淘选文库中鉴定特异性抗体并评估其结合和功能
将富集的V基因转入哺乳动物表达载体,在CHO细胞中表达重组抗体,通过ELISA和流式细胞术筛选结合阳性克隆,并测序分析,纯化抗体后测定亲和力及功能活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | QT35细胞系 | ATCC | -- |
| BHK-21细胞系 | ATCC | -- | |
| 细胞消化 | Accutase | Sigma-Aldrich | -- |
| 下拉实验 | Dynabeads Protein G磁珠 | ThermoFisher | -- |
| 噬菌体淘选 | MyOne Tosylactivated Dynabeads磁珠 | Invitrogen | 6550 |
| Nunc Maxisorp板 | ThermoFisher | 44-2404-21 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| PEI Max转染试剂 | Polysciences, Inc. | 24765 | |
| 抗体纯化 | MabCapture蛋白A树脂 | Thermo | 4374730 |
| Amicon Ultra-15 30K超滤管 | Millipore | UFC903024 | |
| Mustang E滤器 | Pall | MSTG25E3 | |
| 0.2 μm滤器 | Pall | 4602 | |
| ELISA | SARS-CoV2-S RBD重组蛋白 | Acrobiosystems | SPD-C5255 |
| 生物素化人ACE2蛋白 | Acrobiosystems | AC2-H82F9 | |
| 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | Biosource | SNN4004 | |
| 细胞迁移实验 | 人SDF-1α | Sino Biological | 13511-HNCE |
| Alamar Blue试剂 | -- | -- | |
| CD39酶活实验 | 孔雀绿试剂 | ENZO Life Sciences | BML-AK 111-0250 |
| ATP | Thermo Scientific | R044 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MVA构建 | 三重重组方法、BHK细胞、辅助病毒fowlpox 阅读提示:Materials and methods - MVA construct generation |
| 抗原展示验证 | 融合蛋白类型(A56R/F13L)、抗原ECD或全长、pull-down抗体(抗Sema4D、抗Her2等) 阅读提示:Results - 图1、图5;Materials and methods - Pull-down |
| 噬菌体淘选 | 病毒包被方式(磁珠或ELISA板)、病毒量、文库克隆数、淘选轮数、去除非特异性方法 阅读提示:Results - Sema4D selection;Materials and methods - Phage panning |
| 抗体筛选 | 筛选细胞系(Sema4D阳性Jurkat、Her2阳性SKBR3等)、负选细胞系、抗体浓度、流式/ELISA方法 阅读提示:Materials and methods - Mini-library screening |
| 功能实验 | 阻断实验的具体条件(受体、细胞、抗体浓度等) 阅读提示:Materials and methods - Sema4D flow blocking assay; CXCR4 migration assay; Blocking of SARS-CoV-2 |