分析肿瘤组织中PD-1和CTLA-4共表达
评估PD-1和CTLA-4在肿瘤中的共表达情况,为设计双特异性抗体提供依据。
使用TCGA PanCan Atlas数据,通过cBioPortal分析多种肿瘤类型中PD-1和CTLA-4 mRNA表达水平的相关性。
Cadonilimab, a tetravalent PD-1/CTLA-4 bispecific antibody with trans-binding and enhanced target binding avidity.
包含体外细胞实验(ELISA、FACS、混合淋巴细胞反应)和功能验证(ADCC、ADCP、CDC),并进行了trans-binding实验和TCGA数据分析。
293T细胞(稳定转染人PD-1或CTLA-4) CHO-K1细胞(表达PD-1和/或CTLA-4) 人外周血单个核细胞(PBMCs)与树突状细胞(DCs)共培养 Jurkat细胞(表达PD-1)
靶点密度:高密度(50 nM)PD-1和CTLA-4 vs 低密度(10 nM)PD-1 Fc突变:L235A/L236A/G238A 效应功能检测:ADCC、ADCP、CDC和细胞因子释放 细胞系:293T-CTLA4-PD1、CHO-K1-PD1-CTLA4、Raji-PDL1 抗体浓度:3、30、300 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PD-1和CTLA-4在肿瘤中的共表达情况,为设计双特异性抗体提供依据。
使用TCGA PanCan Atlas数据,通过cBioPortal分析多种肿瘤类型中PD-1和CTLA-4 mRNA表达水平的相关性。
验证cadonilimab对PD-1和CTLA-4的结合活性和竞争性阻断能力。
通过ELISA和FACS检测cadonilimab与PD-1和CTLA-4的结合及竞争性阻断配体结合。
检测cadonilimab阻断PD-1和CTLA-4通路后能否激活T细胞并促进细胞因子分泌。
在混合淋巴细胞反应中,将人PBMCs与DCs或Raji-PDL1细胞共培养,加入不同浓度的cadonilimab,检测IL-2和IFN-γ分泌。
探究cadonilimab在高密度抗原下的结合亲合力增强及其连接不同细胞的能力。
通过Fortebio分析比较高密度(50 nM)和低密度(10 nM)下的结合亲合力;通过显微镜和FACS观察细胞交联。
验证Fc突变是否消除Fc受体介导的效应功能并减少炎症细胞因子释放。
测量ADCC、ADCP、CDC和IL-6/IL-8释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA结合实验 | CTLA-4鼠Fc融合蛋白 | Akeso Biopharma | -- |
| PD-1鼠Fc融合蛋白 | Akeso Biopharma | -- | |
| HRP标记的山羊抗人IgG | Jackson | 109-035-088 | |
| FACS结合实验 | FITC标记的山羊抗人IgG | Jackson | 109-095-098 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | V900933-1 | |
| 流式分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- |
| FACS竞争结合实验 | FITC标记的链霉亲和素 | Biolegend | 405202 |
| FITC标记的抗小鼠二抗 | BD | 555988 | |
| BLI分析 | Fortebio OctetQKe | -- | -- |
| Fortebio Octet Red96e | -- | -- | |
| 转结合实验 | Hoechst 33342 | Biohao | C0420 |
| ADCC实验 | Ficoll-PaqueTM Plus | GE | 17-1440-02 |
| LDH检测试剂盒 | Roche | 11644793001 | |
| CDC实验 | 正常人血清 | Quidel | A113 |
| ADCP实验 | 鼠巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 315-02 |
| CFSE | Biolegend | 423801 | |
| APC偶联的山羊抗小鼠/人CD11b | Biolegend | 101212 | |
| ADCR实验 | 人巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 300-25 |
| IFN-γ | Sinobiological | 11725-HNAS-100 | |
| 脂多糖 | Sigma | L4391 | |
| IL-8 ELISA试剂盒 | Dakewe | 1110802 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Dakewe | 1110602 | |
| 混合淋巴细胞反应 | IL-4 | Peprotech | 200-04 |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 300-03 | |
| IL-2 ELISA试剂盒 | Dakewe | 1110202 | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Dakewe | 1110002 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 靶点密度模拟 | 高密度:PD-1 (50 nM)和CTLA-4 (50 nM);低密度:PD-1 (10 nM) 阅读提示:Figure 3及对应Methods部分 |
| Fc突变设计 | Fc区突变:L235A/L236A/G238A 阅读提示:Materials and methods - Antibody construction |
| 效应功能检测 | ADCC:293T-CTLA4-PD1细胞,PBMCs效靶比30:1;ADCP:CHO-K1-PD1-CTLA4细胞与巨噬细胞共培养;CDC:CHO-K1-PD1-CTLA4细胞与2%人血清孵育 阅读提示:Materials and methods - ADCC assay, CDC assay, ADCP assay |
| T细胞活化实验 | PBMCs与DCs比例10:1(1e5:1e4),孵育5天;PBMCs与Raji-PDL1共培养,抗体浓度3、30、300 nM,孵育3天 阅读提示:Materials and methods - 混合淋巴细胞反应部分 |