验证AnxA6 SUMO化修饰
确定AnxA6是否被SUMO化修饰以及主要SUMO化位点。
通过共转染pFlag-AnxA6与pHA-UBC9及pHis-SUMO1/2/3,免疫沉淀富集SUMO化AnxA6,Western blot检测SUMO1修饰;使用SUMO化抑制剂处理观察水平变化;通过LC-MS/MS和点突变确认K299为主要位点。
SUMOylation of AnxA6 facilitates EGFR-PKCα complex formation to suppress epithelial cancer growth.
包含体外细胞实验(SUMO化鉴定、位点突变、信号通路分析、增殖迁移实验)、体内异种移植模型及临床相关EGFR突变实验,证据层级丰富。
HeLa细胞 A431细胞 HEK293T细胞 BALB/c裸鼠异种移植模型
AnxA6 SUMO化位点K299突变(AnxA6K299R) EGF刺激浓度和时间 SUMO化抑制剂2-D08或ML792处理 吉非替尼处理浓度和时间 细胞系和异种移植肿瘤模型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定AnxA6是否被SUMO化修饰以及主要SUMO化位点。
通过共转染pFlag-AnxA6与pHA-UBC9及pHis-SUMO1/2/3,免疫沉淀富集SUMO化AnxA6,Western blot检测SUMO1修饰;使用SUMO化抑制剂处理观察水平变化;通过LC-MS/MS和点突变确认K299为主要位点。
探究AnxA6 SUMO化是否调节EGFR/ERK通路。
在HeLa和A431细胞中过表达野生型AnxA6或AnxA6K299R,EGF刺激后检测pY-EGFR和p-ERK1/2水平;通过IP检测EGFR-PKCα和AnxA6-EGFR相互作用。
评估AnxA6 SUMO化是否影响EGFR T790M/L858R突变信号。
在AnxA6敲低或过表达的HeLa/A431细胞中表达突变EGFR,EGF刺激后检测pY-EGFR和p-ERK1/2水平,并分析EGFR-PKCα相互作用。
考察AnxA6 SUMO化对细胞增殖和迁移的影响。
使用CCK8、集落形成和伤口愈合实验检测AnxA6敲低或过表达(野生型或K299R)对EGF刺激下的细胞增殖和迁移的影响。
评估AnxA6 SUMO化是否影响吉非替尼的疗效。
在不同浓度的吉非替尼处理下,检测AnxA6敲低或K299R突变细胞系的细胞活力、集落形成和迁移能力,并检测EGFR/ERK信号。
验证AnxA6 SUMO化对体内肿瘤生长的影响。
将HeLa或A431细胞(野生型或AnxA6敲低/K299R)皮下注射到裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并分析分子标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 人重组EGF | Sino Biological | 10605-HNAE |
| ML792 | MedChemexpress | HY-108702 | |
| 2-D08 | MedChemexpress | HY-114166 | |
| 吉非替尼 | MedChemexpress | HY-50895 | |
| 药物筛选 | 嘌呤霉素 | MedChemexpress | HY-B1743A |
| 蛋白提取 | N-乙基马来酰亚胺 | MedChemexpress | HY-D0843 |
| 免疫沉淀 | 抗Flag M2亲和凝胶 | Sigma | A2220 |
| 蛋白A磁珠 | Bio-Rad | 161-4013 | |
| Western blot | 抗Myc抗体 | Abcam | ab18185 |
| 抗EGFR抗体 | Santa Cruz | sc-373746 | |
| 抗AnxA6抗体 | Santa Cruz | sc-166807 | |
| 抗Flag抗体 | HuaBio | BX00086 | |
| 抗HA抗体 | HuaBio | BX00069-C3 | |
| 抗His抗体 | HuaBio | BX00085-C3 | |
| 抗SUMO1抗体 | HuaBio | ET1606-53 | |
| 抗UBC9抗体 | HuaBio | ET1610-21 | |
| 抗pY-EGFR(1086)抗体 | HuaBio | ET1612-30 | |
| 抗p-ERK1/2抗体 | HuaBio | ET1610-13 | |
| 抗ERK1/2抗体 | HuaBio | ET1601-29 | |
| 抗细胞周期蛋白D1抗体 | HuaBio | SA38-08 | |
| 抗β-tubulin抗体 | Zsbio | TA-10 | |
| 抗β-actin抗体 | Zsbio | TA-09 | |
| 免疫沉淀 | 正常IgG抗体 | Beyotime | A7016 |
| 细胞转染 | Lipofectamine2000转染试剂 | Life Technologies | 11,668-019 |
| 蛋白质谱 | Easy nano-LC1000高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- |
| Q-Exactive质谱 | Thermo Scientific | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 免疫组化 | Leica DM 2000显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:HEK293T、HeLa、A431;培养基:DMEM或RPMI-1640,10% FBS;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| SUMO化检测 | 共转染质粒pFlag-AnxA6、pHA-UBC9、pHis-SUMO1;转染时间48小时;免疫沉淀使用抗Flag M2亲和凝胶 阅读提示:Materials and methods: Immunoprecipitation; Fig. 1 |
| EGF刺激 | EGF浓度:100 ng/mL或200 ng/mL;刺激时间:3分钟或5分钟;刺激前血清饥饿过夜 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Results: 图3、图4、图5 |
| SUMO化抑制剂处理 | 2-D08 (150 μM) 或 ML792 (10 μM) 处理24小时 阅读提示:Materials and methods: Reagents and antibodies; Fig. 1C-D |
| 细胞增殖和迁移 | CCK8:2×10^3细胞/孔,培养120小时;集落形成:1000细胞/孔,培养14天;伤口愈合:刮痕后EGF处理36小时 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation, Wound healing assays |
| 吉非替尼处理 | 吉非替尼浓度:HeLa 0-40 μM处理48小时;A431 0-30 μM处理24小时 阅读提示:Results: 图6 |
| 体内异种移植 | 5×10^6细胞皮下注射到5周龄雄性BALB/c裸鼠(n=5);肿瘤体积监测时间点 阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor model |