临床标本分析
评估NFAT5表达及K668甲基化与GBM分期、EGFR活性、TMZ耐药及患者生存的关系。
对83例胶质瘤标本(含55例GBM)进行IHC染色,分析NFAT5、p-EGFR、Me3-NFAT5 K668、EZH2 pS21的表达及相关性;分析TMZ敏感与耐药标本中NFAT5和Me3-NFAT5 K668水平。
Lysine methylation promotes NFAT5 activation and determines temozolomide efficacy in glioblastoma.
包含临床标本IHC分析、细胞功能实验(CCK-8、克隆形成、凋亡)、生化机制实验(Co-IP、质谱、CHX追踪)、动物模型(正位异种移植和PDX)及RNA-seq等多层级验证。
U87/EGFRvIII细胞 U87/EGFR细胞 U251细胞 GBM-24和GBM-35 PDX模型 Balb/c nude小鼠正位异种移植模型
EGF刺激浓度100 ng/mL及时间 TMZ浓度(体外IC50测定,体内60 mg/kg) EZH2抑制剂DZNep浓度(体内1.5 mg/kg,体外10 μM) NFAT5 K668R突变体的构建及功能验证 MGMT和ITGB1作为NFAT5转录靶标的ChIP验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NFAT5表达及K668甲基化与GBM分期、EGFR活性、TMZ耐药及患者生存的关系。
对83例胶质瘤标本(含55例GBM)进行IHC染色,分析NFAT5、p-EGFR、Me3-NFAT5 K668、EZH2 pS21的表达及相关性;分析TMZ敏感与耐药标本中NFAT5和Me3-NFAT5 K668水平。
验证NFAT5对GBM细胞增殖、凋亡及TMZ敏感性的影响。
在U87/EGFRvIII、U87/EGFR、U251等细胞中敲除或过表达NFAT5,检测TMZ的IC50、克隆形成、凋亡和γH2AX水平。
阐明EGF刺激后NFAT5赖氨酸甲基化的调控机制及对NFAT5定位和稳定性的影响。
使用EGF刺激、激酶抑制剂、EZH2敲低或抑制剂、AKT1突变体等处理,检测NFAT5甲基化水平、EZH2结合、核转位和稳定性;质谱鉴定甲基化位点。
揭示NFAT5甲基化如何调节其与TRAF6的相互作用及K63泛素化。
通过Co-IP、免疫荧光和泛素化实验检测TRAF6与NFAT5的结合、K63泛素化水平,以及TRAF6对NFAT5定位和降解的影响。
验证NFAT5 K668甲基化对TMZ耐药关键基因MGMT和ITGB1的转录调控。
通过RT-qPCR、Western blot、双荧光素酶报告基因和ChIP实验,检测NFAT5对MGMT和ITGB1表达及启动子结合的影响。
评估NFAT5 K668甲基化对TMZ疗效的影响及DZNep联合治疗的潜力。
在U87/EGFRvIII正位异种移植和GBM-24/GBM-35 PDX模型中,检测TMZ单药或联合DZNep对肿瘤生长、生存期和DNA损伤标志物的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 替莫唑胺 | aladdin | T-36587 |
| 3-去氮腺苷A | Selleck Chemicals | S7120 | |
| GF109203X | Selleck Chemicals | S7208 | |
| U0126 | Selleck Chemicals | S1102 | |
| 表皮生长因子 | Sino Biological | 10605-HNAE | |
| Western blot | 抗三甲基赖氨酸抗体 | PTMBio | PTM-601 |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD | FACSVerse |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | Sigma | -- |
| 银染和质谱 | 银染试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 质谱分析 | Orbitrap Elite质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
| ChIP | EZ ChIP试剂盒 | Millipore | 17-10086 |
| 荧光素酶检测 | 荧光素酶分析系统试剂盒 | Promega | -- |
| Synergy 2多功能酶标仪 | Biotek | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Viton Lever | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床标本收集与分组 | 标本来源医院、样本数量(83例)、TMZ敏感/耐药定义 阅读提示:Methods: Patients and samples |
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养条件、EGF浓度(100 ng/mL)、抑制剂浓度(DZNep 10 μM, perifosine 10 μM, U0126 10 μM, GF109203X 10 μM) 阅读提示:Methods: Cell lines and reagents |
| 分子机制实验 | NFAT5 K668R突变体构建、EZH2 shRNA序列、TRAF6敲低序列、CHX处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Generation of stable cells, Co-IP, mass spectrometry |
| 体内动物模型 | 动物品系、性别、年龄、细胞注射数量(5×10^5或5×10^6)、给药方案(TMZ 60 mg/kg, DZNep 1.5 mg/kg, 隔日一次, 2周) 阅读提示:Methods: Animal studies |
| 统计设计 | 独立实验次数(n=2或3)、统计检验方法(t检验、ANOVA、Log-rank) 阅读提示:Methods: Statistical analysis |